Bioinformatika fanining rivojlanish tarixi

Molekulalarni modellashtirish bo’yicha ma`lumotlar bazalari (MMDB).
Molekulyar modellashtirish ma'lumotlar bazasi (MMDB) eksperimental ravishda aniqlangan uch o'lchamli biomolekulyar tuzilmalar ma'lumotlar bazasi bo'lib, u Entrez Structure ma'lumotlar bazasi deb ham ataladi. Bu nazariy modellar bundan mustasno, RCSB Protein Data Bank (PDB) dan olingan uch o'lchovli tuzilmalarning kichik to'plamidir . NCBIda ma'lumotlarni qayta ishlash jarayoni ma'lumotlar bo'yicha hisoblashni osonlashtiradigan va ularni Entrez tizimidagi ko'plab boshqa ma'lumotlar turlari bilan bog'laydigan bir qator foydali xususiyatlarni qo'shishga olib keladi . Har bir MMDB yozuvi u olingan manba PDB yozuviga (ya’ni, MMDB xulosa sahifasi) o‘zaro havola qiladi.struktura uchun uning MMDB identifikatori va mos keladigan PDB identifikatori ko'rsatiladi ). Agar MMDB yozuvi ikki yoki undan ortiq PDB bo'lingan fayllaridan birlashtirilgan tuzilmani ifodalasa , u holda xulosa sahifasida birlashtirilgan tuzilmani tashkil etuvchi barcha manba PDB yozuvlarining PDB identifikatorlari ko'rsatiladi.MMDB turli xil rekord turlarini o'z ichiga oladi, ular rentgen kristallografiyasi va yadro magnit-rezonansi (NMR) kabi turli xil eksperimental metodologiyalarni va oqsillar, DNK va RNK kabi kimyoviy moddalar bilan yoki bog'lanmagan turli xil molekula turlarini aks ettiradi.
Molekulalarni modellashtirish bo’yicha ma`lumotlar bazalari (PDB).
BDB ma'lumotlar bazasi (http://immunet.cn/bdb) MimoDB ma'lumotlar bazasining yangilanishi bo'lib, u avvalroq 2012 yil Nuklein kislotalari tadqiqotlari ma'lumotlar bazasi sonida tasvirlangan. BDB rebrendlangan nomi biopanning ma'lumotlar bankining qisqartmasi bo'lib, u kombinatorial peptid kutubxonasining biopanning natijalari uchun portal bo'lishni maqsad qilgan. Oxirgi marta 2015-yil iyul oyida yangilangan, BDB 1322 ta ekspertizadan oʻtgan maqolalardan toʻplangan 2904 biopanning maʼlumotlar toʻplamini oʻz ichiga oladi. U 25 786 peptid ketma-ketligini, 1704 nishonni, 492 ma'lum shablonni, 447 peptid kutubxonasini va shablon yoki maqsadli peptid komplekslarining 310 kristalli tuzilmasini o'z ichiga omaqsadliladi. BDBda saqlangan barcha ma'lumotlar qayta ko'rib chiqildi va peptidga yaqinlik, o'lchash usuli va protseduralari haqidagi ma'lumotlar 246 nashr etilgan maqoladagi 411 biopanning ma'lumotlar to'plamidan 2298 peptid uchun qo'shildi. Bunga qo'chimcha, yanada professional va foydalanuvchilar uchun qulay veb-interfeys amalga oshirildi, batafsilroq yordam tizimi ishlab chiqildi va yangi tezkor ma'lumotlarni vizualizatsiya qilish vositasi va ma'lumotlarni tahlil qilish uchun bir qator vositalar birlashtirildi. Mavjud bo'lgan ushbu yangi ma'lumotlar va vositalar bilan biz BDB ma'lumotlar bazasi fag displeydan foydalanadigan olimlar uchun asosiy manba bo'lib, biopanning va tegishli ilmiy jamoalar uchun yaxshilangan yordamga ega bo'lishini kutamiz.