Genomové mutace: Mají podobu změny celého karyotypu (tj. počtu chromozomů). Často vznikají v důsledku poruchy buněčného
dělení (mitózy nebo meiózy).
polyploidie: počet chromozomů je celým násobkem haploidní sady (3n = triploidie, 4n = tetraploidie, 5n = pentaploidie)
u živočichů se téměř nevyskytují (způsobují smrt už ve stadiu embrya)
u rostlin se vyskytují běžně (polyploidizace je často užívanou metodou šlechtitelství, vede ke zvýšení výnosu)
aneuploidie: v karyotypu chybí nebo přebývají některé chromozomy (2n–1, 2n+3…)
Genetika populací
Základní pojmy:
druh: skupina jedinců schopných při křížení produkovat plně životaschopné potomky (i potomci mají schopnost plnohodnotného
rozmnožování)
klon: skupina jedinců vzniklých z původního jedince nepohlavním rozmnožováním (včetně klonování z jedné původní buňky)
populace: soubor jedinců určitého druhu schopných vzájemného křížení (tj. musí žít ve stejnou dobu na společném místě)
Genetická struktura populace a její rovnováha
Typy párování gamet v populaci
autogamie: samooplození, příkladem u rostlin je samosprašnost, u živočichů je vzácné (např. u tasemnice)
inbreeding = příbuzenské křížení (mezi rodiči a potomky, mezi sourozenci ap.): u většiny živočichů má nepříznivé důsledky (vyšší
riziko výskytu vzácných recesivních poruch), běžně se uplatňuje např. v laboratorních chovech myší
panmixie (randombreeding): zcela náhodné párování gamet, zkřížení kterýchkoliv dvou jedinců je stejně pravděpodobné. Za zcela
panmiktické lze považovat populace se zcela náhosdným "mícháním" pohlavních buněk (větrosprašných rostliny, u živočichů
například ryby, které vypouštějí jikry a mlíčí na společném místě)
Ostatní populace lze považovat za panmiktické v případě těch znaků, které nehrají roli při výběru partnera. I lidská populace je
většině znaků do značné míry pankmiktická.
Rovnováha v autogamické populaci
Nechť je populace zpočátku tvořená pouze heterozygoty Aa. V každé generaci se potomstvo heterozygotů vyštěpí v poměru 1: 2: 1, tj.
vznikne 25% homozygotů AA, 25% homozygotů aa a 50% heterozygotů Aa. V každé další generaci se počet heterozygotů sníží na
polovinu. Z tohoto jednoduchého modelu lze odvodit hlavní pravidlo:
V autogamické populaci postupně klesá procento heterozygotů a roste podíl homozygotů.
Rovnováha v panmiktické populaci
Modelem pro odvození bude populace, u které budeme sledovat výskyt alel A, a. Frekvenci výskytu alely A označíme p, frekvenci
výskytu alely a označíme q.
Pokud se sledovaný gen vyskytuje jen v těchto dvou alelách, pak samozřejmě musí platit vztah p + q = 1.
Odvození bude provedeno na konkrétním příkladu: v populaci se vyskytuje 40% alel A (tj. p = 0,4) a 60% alel a (q = 0,6). Vytvoříme
všechny možné kombinace alel, které mohou nastat při párování 40% alel A a 60% alel a.
A
A
A
A
a
a
a
a
a
a
A
AA
AA
AA
AA
Aa
Aa
Aa
Aa
Aa
Aa
A
AA
AA
AA
AA
Aa
Aa
Aa
Aa
Aa
Aa
A
AA
AA
AA
AA
Aa
Aa
Aa
Aa
Aa
Aa
A
AA
AA
AA
AA
Aa
Aa
Aa
Aa
Aa
Aa
a
Aa
Aa
Aa
Aa
aa
aa
aa
aa
aa
aa
a
Aa
Aa
Aa
Aa
aa
aa
aa
aa
aa
aa
a
Aa
Aa
Aa
Aa
aa
aa
aa
aa
aa
aa
a
Aa
Aa
Aa
Aa
aa
aa
aa
aa
aa
aa
a
Aa
Aa
Aa
Aa
aa
aa
aa
aa
aa
aa
a
Aa
Aa
Aa
Aa
aa
aa
aa
aa
aa
aa
Náhodným párováním 4 alel A a 6 alel a vzniklo
100 kombinací.
16 setin z nich je AA.
36 setin z nich je aa.
48 setin z nich je Aa.
Snadno lze odvodit, že:
Frekvence výskytu kombinací AA je
0,16 = 0,4 · 0,4 = p
2
Frekvence výskytu kombinací aa je
0,36 = 0,6 · 0,6 = q
2
Frekvence výskytu kombinací Aa je
0,48 = 2 · 0,4 · 0,6 = 2pq
Pro rovnováhu v panmiktické populaci proto platí následující vztah (nazývaný
Hardy-Weinberg
ů
v zákon
):
Je li p frekvence alely A, a q je frekvence alely a,
pak frekvence homozygotů AA je p
2
, frekvence heterozygotů Aa je 2pq a frekvence homozygotů aa je q
2
.
Zkráceným zápisem
p + q = 1
p2 + 2pq + q2 = 1
P
ř
íklad 1
Alela pro tmavou barvu srsti (T) je úplně dominantní nad alelou pro světlou barvu srsti (t). V panmiktické populaci je 51 % tmavých a
49 % světlých jedinců. Kolik procent populace tvoří dominantní homozygoti TT ?
Řešení:
Všichni světlí jedinci musí být recesivní homozygoti tt. Proto platí q
2
= 0,49.
Z tohoto vztahu vypočítáme q:
q =
49
,
0
= 0,7
Dosazením do vztahu p + q = 1 vypočítáme p:
p = 1 – q = 1 – 0,7 = 0,3
A nakonec vypočítáme frekvenci homozygotů TT:
p
2
= 0,3
2
= 0,09 = 9%
V populaci je proto 9% dominantních homozygotů.
P
ř
íklad 2
Albinismus je recesivní porucha, kterou v ČR trpí přibližně 0,1‰ lidí. Kolik obyvatel ČR je zdravých přenašečů alely pro albinismus?
Řešení: Frekvence výskytu recesivních homozygotů 0,1‰ = 0,0001, tj. q
2
= 0,0001
Vypočítáme frekvenci alely pro albinismus v populaci:
q =
0 0001
,
= 0,01
Frekvence "zdravé" alely je:
p = 1 – 0,01 = 0,99
Frekvence "zdravých přenašečů" (heterozygotů):
2pq = 2·0,99·0,01 = 0,0198 = 1,98%, tj. přibližně 2%
Z přibližně 10 milionů obyvatel je přibližně 2% heterozygotů:
10 000 000
⋅
0,02 = 200 000
V České republice je přibližně 200 tisíc zdravých přenašečů albinismu.
N
ě
které d
ů
sledky pro lidskou populaci:
Hardy-Weinbergův zákon platí pouze pro panmiktickou populaci, a proto jej můžeme použít pouze u těch znaků, u nichž lze
předpokládat zcela náhodné párování alel, tj. u znaků, které při výběru životního partnera nehrají významnou roli (např. krevní
skupina). Při sledování znaků, které jsou pro výběr životního partnera důležité (inteligence, barva kůže ap.) nelze lidskou populaci
považovat za panmiktickou. Hardy-Weinbergův zákon můžeme aplikovat i opačným směrem - pokud pro frekvenci některých znaků
neplatí Hardy-Weinbergův zákon, pak buď populace není pro tento znak panmiktická, anebo je panmiktická a pak v populaci není
rovnováha (populace je narušena například mutací).
Faktory narušující genetickou rovnováhu v populaci
Mutace
Vlivem mutagenních faktorů se zvyšuje množství vad, což se pochopitelně odráží i v porušené rovnováze.
Migrace
Genetická rovnováha se naruší, pokud se populace dostane do kontaktu s jinou populací a nositelé některých alel z původní populace
vycestují (emigrují) a příslušníci druhé populace do původní populace vniknou (imigrují).
Náhodný genetický posun (drift)
U malých populací může dojít k náhodnému oddělení několika jedinců (např. uhynutím při přírodní katastrofě, oddělením populace
změnou krajiny – například výstavbou dálnice), a tím se může výrazně změnit frekvence některých alel. Tento jev se týká pouze
populací s malým počtem jedinců (např. populací velkých savců v Evropě ap.).
Selekce (p
ř
írodní výb
ě
r)
Selekcí se nazývá takové působení vnějších podmínek, při kterém jsou nositelé určitých alel zvýhodněni a nositelé jiných alel
znevýhodněni. Selekce může působit několika způsoby, které si můžeme ilustrovat na příkladu změny frekvence výskytu určitého
kvantitativního znaku. Původní frekvence je vyznačena tečkovanou čárou, nová frekvence je vyznačena plnou čárou.
Usměrňující selekce:
Prostředí jednostranně zvýhodňuje určitý
extrém znaku, průměrná hodnota znaku
se „posouvá“ jedním směrem
(např. prodlužuje se srst, zvyšuje se objem
mozkovny…)
Stabilizující selekce:
Prostředí zvýhodňuje nositele průměrných
znaků a znevýhodňuje extrémy. Tento typ
většinou následuje po usměrňující selekci
a bývá dokladem stabilních podmínek.
Disruptivní selekce:
Prostředí znevýhodňuje nositele
průměrných znaků a zvýhodňuje extrémy.
Původní Gaussova křivka se postupně
mění na křivky dvě. Konečným
výsledkem může být rozdělení populace
na dva různé druhy. Tento typ selekce je
v přírodě vzácný, je však možným
vysvětlením vzniku dvou nových druhů
z jednoho společného předka.
Genetika
č
lov
ě
ka
Charakteristika lidského genomu
Haploidní sada obsahuje 23 chromozomů (molekuly DNA o celkové délce cca 1 m). Kompletní genom (sekvence nukleotidů) byl
"přečten" v roce 2000 (v současné době se výsledky vyhodnocují, zpřesňují a doplňují o "čtení" vzorků dalších lidí).
Genom (v haploidní sadě) obsahuje přibližně 3,1 miliardy nukleotidů, v nichž je kódováno 20 až 25 tisíc genů (kromě funkčních
genů obsahuje i balast – nefunkční zbytky genů ap.).
Metody studia lidské genetiky
Lidská genetika z etických důvodů zásadně nedovoluje cílené experimenty (pokusná křížení).
Veškeré výsledky jsou proto získávány z klinické praxe (poznatky lékařů) a zkoumání vzorků populace – dobrovolníků. Nesmírně
cenné je studium rodokmenů (tzv. genealogie). Velmi cenné poznatky o míře dědivosti (heritabilitě) určitých znaků poskytuje
studium dvojčat (gemelilogie), obzvláště dvojčat jednovaječných (se shodným genomem).
P
ř
íklady známých monogenních kvalitativních znak
ů
D
ě
di
č
nost krevních skupin
Krevní skupiny AB0 systému jsou kódovány jedním genem, který se vyskytuje ve třech alelách:
I
A
- alela pro antigen A
I
B
- alela pro antigen B
I
0
- alela pro „žádný“ antigen
Alely I
A
a I
B
jsou vůči alele I
0
úplně dominantní. Mezi alelami I
A
a I
B
je vztah kodominance.
Rh faktor je kódován jedním genem, který se vyskytuje ve dvou alelách: D - alela pro Rh antigen, d - alela pro „žádný“ antigen.
Alela D je úplně dominantní nad alelou d.
P
ř
íklady dalších znak
ů
Barva očí: Alela pro tmavé (hnědé) oči je úplně dominantní nad alelou pro světlé (modré, zelené, šedé…) oči.
Barva vlasů: Alela pro tmavé vlasy je úplně dominantní nad alelou pro světlé vlasy.
Levorukost: Alela pro dominanci pravé ruky je úplně dominantní nad alelou pro dominanci levé ruky (neplatí úplně u všech lidí).
D
ě
di
č
nost a pohlaví
Člověk má savčí typ chromozomového určení pohlaví, kde sestava XX určuje ženu a sestava XY určuje muže. Obě sestavy vznikají
s matematickou pravděpodobností 50% (rozdíl v počtu narozených chlapců a děvčat je dán rozdílnou životaschopností spermií a
embryí).
Oba gonozomy mají některé úseky DNA shodné (homologní), většina úseků však nese rozdílné geny (úseky jsou heterologní). Geny
pohlavně vázaných znaků jsou uloženy v heterologních ("neshodných") úsecích pohlavních chromozomů. Geny uložené na
heterologním úseku gonozomu Y mají přímou dědičnost (přenášejí se z otce na syna). Některé pohlavní znaky (např. stavba varlat)
jsou sice uloženy v autozomech, ale projeví se jen v přítomnosti gonozomu Y – takové znaky se nazývají pohlavím ovládané.
Pojmem matroklinita se označuje jev, kdy dítě (bez ohledu na pohlaví) nese více znaků matky než otce. Vysvětlením tohoto jevu je
mimojaderná dědičnost – dítě má ve svých buňkách mimojadernou DNA z cytoplazmy vajíčka, a proto o něco má více "matčiných"
znaků.
Genetické vady a poruchy
Genomové mutace (p
ř
ibližn
ě
3-5% vrozených vad)
Downův syndrom (zastarale a nesprávně "mogoloidismus"): způsoben trisomií 21. chromozomu (místo dvou chromozomů jsou tři)
výskyt přibližně 1 : 600 (na 600 narozených dětí připadá jedno postožené)
kulatý obličej, kožní řasa na víčku (znak mongoloidního plemena), mérné derformity končetin srdeční vady, snížené IQ
snížená šance dožití (většina jedinců umírá do 40 let)
s rostoucím větkem matky riziko výskytu výrazně roste (ve věku matky 35 let je cca desetkrát vyšší)
Edwardsův syndrom: trisomie 18. chromozomu
výskyt přibližně 1 : 3000
těžké srdeční vady, rozštěpy, poruchy příjmu potravy, deformace lebky…
přežití po narození zpravidla do 1 roku
Patauův syndrom: trisomie 13. chromozomu
výskyt přibližně 1 : 5000
vrozené mozkové vady, srdeční vady, rozštěpy rtu a patra, mentální retardace, polydaktylie (zmnožení prstů)
přežití po narození velmi krátké (1 až 2 měsíce)
Turnerův syndrom: gonozomy X0, tj. pouze jeden gonozom X (a žádný další gonozom)
výskyt přibližně 1 : 2000
žena s menším vzrůstem (do 150 cm), sterilita, chybí sekundární pohlavní znaky (infantilní vzhled – lze léčit podáváním estrogenů)
běžné dožití, normální životní uplatnění (nemá vliv na inteligenci ani není žádný výraznější zdravotní handicap)
Klinefelterův syndrom: gonozomy XXY (vzácně i XXXY, XXXXY)
výskyt přibližně 1 : 1000
muži s málo vyvinutými sekundárními pohlavními znaky (snížená produkce testosteronu), obezita, sterilita, léčí se testosteronem
většinou normální životní uplatnění (výjimečně lehká mentální retardace)
superfemale ("superžena", "nadsamice"): gonozomy XXX
registrovaný výskyt přibližně 1 : 2000 (skutečný výskyt bude mnohem vyšší)
žena s normálním tělesným i duševním vývojem, poruchy funkce pohlavních orgánů (časté potraty), předčasný nástup klimakteria
supermale ("supermuž", "nadsamec"): gonozomy XYY
registrovaný výskyt přibližně 1 : 1000 (skutečný výskyt bude mnohem vyšší)
nadprůměrná tělesná výška, někdy vyšší produkce testosteronu (sklony k vyšší agresivitě)
Autozomáln
ě
dominantní poruchy
(p
ř
enášeny na autozomech, alela pro poruchu je dominnatní)
otoskleróza: postupná ztráta sluchu v dospělosti (od 40 let)
polydaktylie: nadpočetné prsty
achondroplazie: porucha růstových chrupavek, trpaslictví (v dospělosti do 120 cm)
hyperlipoproteinemie: zvýšené množství cholesterolu, časté infarkty myokardu
Autozomáln
ě
recesivní poruchy
galaktosemie: neschopnost odbourávat galaktózu, hromadění toxických zplodin v těle (zákaly, selhání ledvin…)
fenylketonurie: zvýšené množství fenylalaninu v plazmě, poruchy ledvin, oligofrenie (slabomyslnost)
cystinurie: zvýšená tvorba močových krystalků a kaménků
albinismus: nedostatečná tvorba tělních pigmentů (velmi světlá kůže, bílé vlasy), časté oční poruchy
srpkovitá anemie: výskyt hlavně ve střední Africe (3% populace), deformované erytrocyty (zhoršený přenos kyslíku)
Heterozygoti mají zvýšenou odolnost vůči malárii, proto jsou mositelé této alely v tropických malarických oblastech zvýhodněni
oproti "normální" (populaci).
Gonozomáln
ě
recesivní poruchy (p
ř
enášeny na gonozomu X)
hemofilie: zvýšená krvácivost
daltonismus: barvoslepost, především neschopnost rozeznávat červenou a zelenou barvu (postiženo 8 % mužů a 0,5 % žen)
D
ě
di
č
né vývojové vady
Tímto pojmem se označují poruchy diferenciace tkání a orgánů v prenatálním vývoji. Většinou nelze přesně diagnostikovat konkrétní
genovou poruchu nebo se na poruše podílí více genů. Častými dědičnými vývojovými vadami jsou například luxace kyčelních
kloubů, vrozené srdeční vady, celiakie (nesnášenlivost lepku v potravě), rozštěpy rtu a patra, rozštěpy páteře, anencefalie
(nevyvinutá mozkovna) ap.
Vrozené dispozice
Některé poruchy organismu jsou očividně ovlivněné dědičností, ale nelze jednoznačně říci, že jsou stoprocentně dědičné. V naší
populaci se často vyskytují vrozené dispozice k hypertenzi (zvýšenému krevnímu tlaku), srdečním poruchám, alergiím, nervovým
poruchám (neurózám ap.) a dalším "civilizačním chorobám".
Dostları ilə paylaş: |