Kashfiyot Eng qadimgi mikroskoplar XIII-asrda ko'zoynagida linzalarning keng qo'llanilishidan boshlab, cheklangan kattalashtirishga ega bo'lgan yagona linzalikattalashtiruvchi ko'zoynaklar edi. Murakkab mikroskoplar ilk bor Yevropada 1620 atrofida paydo boʻlgan, bundan tashqari, biri Londonda Kornelis Drebbel tomonidan namoyish etilgan (taxminan 1621 yilda) va biri 1624 yilda Rimda namoyish etilgan Murakkab mikroskopning haqiqiy ixtirochisi noma'lum, ammo yillar davomida ko'plab da'volar qilingan. Gollandiyalik ko'zoynak ishlab chiqaruvchi Yoxannes Zakarassen tomonidan paydo bo'lganidan 35yil o'tgach, otasi Zakariya Yanssen 1590 yilda aralash mikroskop va yoki teleskopni ixtiro qilgani haqidagi da'vo shular jumlasidan bo'lishi mumkin. Yoxannesning ko'rsatmalari, ba'zilari shubhali bo'lib, ixtiro sanasini shu qadar orqaga suradiki, Zakariya o'sha paytda bola bo'lgan bo'lar edi, bu esa Yoxannesning da'vosi haqiqat ekanligi haqidagi taxminlarga olib keladi. Aralash mikroskopni Yoxannesning bobosi Xans Martens ixtiro qilgan bo'lishi kerak edi. Yana bir da'vo shundaki, Yanssenning raqobatchisi Hans Lippershey (1608 yilda birinchi teleskop patentiga ariza bergan) ham aralash mikroskopni ixtiro qilgan. Boshqa tarixchilar gollandiyalik novator Kornelis Drebbelning 1621-yilgi birikma mikroskopiga ishora qiladilar.
O'tkazilgan yorug'lik orqali namunalarni ko'rish uchun mo'ljallangan barcha zamonaviy optik mikroskoplar yorug'lik yo'lining bir xil asosiy qismlariga ega bo'ladi. Bundan tashqari, mikroskoplarning katta qismi bir xil "strukturaviy" komponentlarga ega [16] (o'ngdagi rasmga muvofiq quyida taqsimlangan):
Ko'zoynak (ko'z linzalari) (1)
Obektiv minora, revolver yoki aylanadigan burun qismi (bir nechta obektiv linzalarni ushlab turish uchun qo'llaniladi) (2)
