Pemeriksaan kualitas air susu secara biologis dapat dilakukan dengan mikroskopis, bakteriologis dan biokemis. Pemeriksaan secara biologik dengan pemeriksaan kandungan mikroorganisme yang ada dalam susu.
Pemeriksaan air susu terhadap kemungkinan pemalsuan tidaklah mudah. Hasil pemeriksaan sesungguhnya hanya berarti kalau air susu yang diperiksa bila dibandingkan dengan hasil pemeriksaan susu kandang, yang langsung berasal dari pemerahan sapi ada perbedaan yang pada akhirnya akan mempengaruhi kualitasnya. Pemalsuan dapat dilakukan sedemikian rupa sehingga air susu tidak memperlihatkan adanya perubahan secara fisik namun secara kimia akan berubah.