Supplementary Table : Primers used for real-time pcr experiments
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- Supplementary Table 4: Statistical overview of clinical outcome and gene expression of the candidate genes in n=50 LCLs.
- WNT2B SULT4A1 TCF7L2 FZD7
|
A_24_P228717 |
RAC2 |
-1,1 |
-1,5 |
-2,1 |
-3,6 |
-1,8 |
1,1 |
-1,3 |
-1,4 |
-2,3 |
-1,9 |
-1,5 |
± |
1,5 |
-1,7 |
± |
0,5 |
0,35 |
|
A_33_P3295523 |
RAC3 |
-1,0 |
-1,4 |
-1,0 |
1,7 |
2,0 |
-1,3 |
-1,1 |
1,0 |
-1,6 |
-1,4 |
0,2 |
± |
1,5 |
-1,4 |
± |
0,2 |
0,76 |
|
A_24_P192262 |
RALA |
1,3 |
1,2 |
-1,4 |
-2,9 |
-2,4 |
-1,2 |
1,1 |
-1,0 |
1,2 |
1,2 |
-1,3 |
± |
1,5 |
1,2 |
± |
0,1 |
0,02 |
|
A_24_P497226 |
RPS6KB1 |
1,1 |
1,4 |
-1,6 |
-2,4 |
-3,0 |
-1,2 |
1,2 |
1,2 |
1,6 |
1,5 |
-1,0 |
± |
1,7 |
1,4 |
± |
0,2 |
0,11 |
|
A_33_P3251727 |
RYR2 |
1,1 |
1,4 |
-5,2 |
1,2 |
-1,0 |
1,0 |
1,0 |
1,1 |
1,3 |
2,2 |
-0,3 |
± |
2,5 |
1,5 |
± |
0,5 |
0,01 |
|
A_33_P3318606 |
SHC2 |
2,1 |
-1,1 |
2,3 |
1,1 |
1,7 |
2,9 |
1,0 |
-1,8 |
-1,6 |
1,1 |
1,4 |
± |
1,7 |
-0,1 |
± |
1,4 |
0,07 |
|
A_23_P343808 |
SOS1 |
-1,1 |
-1,8 |
-1,0 |
1,6 |
2,7 |
1,4 |
-1,4 |
-1,2 |
-1,6 |
-2,5 |
0,4 |
± |
1,7 |
-1,8 |
± |
0,5 |
0,11 |
|
A_33_P3250671 |
TCF7 |
1,2 |
-1,9 |
3,1 |
2,6 |
2,6 |
-1,6 |
-1,2 |
-1,2 |
-1,6 |
-1,5 |
1,1 |
± |
2,1 |
-1,5 |
± |
0,3 |
0,01 |
|
A_23_P389588 |
TCF7L2 |
1,7 |
-1,5 |
3,3 |
7,4 |
4,4 |
1,4 |
-1,2 |
-1,4 |
-1,1 |
-2,6 |
2,8 |
± |
3,0 |
-1,6 |
± |
0,7 |
0,07 |
|
A_33_P3377294 |
TCF7L2 |
1,0 |
-1,6 |
1,1 |
1,5 |
2,2 |
1,3 |
-1,6 |
-1,4 |
-2,5 |
-1,8 |
1,0 |
± |
1,2 |
-1,9 |
± |
0,4 |
0,04 |
|
A_23_P411157 |
WNT1 |
-1,1 |
1,3 |
-1,6 |
-2,3 |
-2,3 |
-1,2 |
1,5 |
-1,0 |
-1,1 |
1,3 |
-1,6 |
± |
0,6 |
0,7 |
± |
1,2 |
0,01 |
|
A_33_P3382588 |
WNT1 |
4,2 |
1,8 |
1,1 |
3,9 |
-2,0 |
1,1 |
-1,2 |
1,6 |
1,2 |
1,8 |
1,7 |
± |
2,3 |
0,9 |
± |
1,4 |
0,02 |
|
A_23_P162322 |
WNT10B |
-1,2 |
-1,2 |
2,5 |
5,4 |
2,3 |
-1,2 |
1,8 |
-1,2 |
1,6 |
1,1 |
1,1 |
± |
2,8 |
0,8 |
± |
1,4 |
1,00 |
|
A_24_P253003 |
WNT11 |
-2,3 |
-1,0 |
-3,0 |
-2,4 |
-1,7 |
-2,1 |
-1,5 |
1,3 |
-2,3 |
1,1 |
-1,7 |
± |
1,5 |
-0,9 |
± |
1,5 |
0,76 |
|
A_23_P134601 |
WNT16 |
-1,0 |
-1,1 |
-9,6 |
1,3 |
1,1 |
1,1 |
1,2 |
1,0 |
-1,1 |
1,0 |
-1,0 |
± |
4,3 |
0,0 |
± |
1,2 |
0,26 |
|
A_23_P138352 |
WNT2B |
2,3 |
-6,0 |
34,3 |
17,4 |
10,1 |
-1,2 |
-6,6 |
-1,9 |
-2,0 |
-49,2 |
10,2 |
± |
13,9 |
-16,0 |
± |
22,3 |
0,61 |
|
A_23_P385690 |
WNT3A |
-1,1 |
-1,0 |
-1,1 |
-1,3 |
-2,4 |
-4,0 |
1,6 |
-1,3 |
2,8 |
1,2 |
-1,9 |
± |
1,1 |
1,2 |
± |
1,6 |
0,01 |
|
A_33_P3417502 |
WNT3A |
-1,1 |
-1,7 |
1,0 |
1,2 |
2,3 |
1,2 |
-1,6 |
-1,5 |
-2,4 |
-1,7 |
0,5 |
± |
1,5 |
-1,8 |
± |
0,4 |
0,01 |
|
A_23_P258410 |
WNT7A |
1,3 |
1,0 |
1,3 |
-2,9 |
-2,2 |
-1,4 |
1,1 |
-1,2 |
-1,1 |
-2,2 |
-0,9 |
± |
1,8 |
-0,3 |
± |
1,6 |
0,01 |
|
A_33_P3248903 |
WNT7B |
-1,0 |
1,5 |
3,4 |
1,9 |
2,2 |
1,5 |
1,5 |
-1,4 |
1,3 |
1,3 |
1,1 |
± |
1,9 |
1,4 |
± |
0,1 |
0,76 |
|
A_24_P911607 |
WNT7B |
1,1 |
-3,2 |
-2,7 |
-2,2 |
-10,1 |
-1,1 |
-2,6 |
-1,1 |
-1,0 |
1,7 |
-2,7 |
± |
3,9 |
-1,3 |
± |
2,2 |
0,61 |
|
A_33_P3256920 |
WNT7B |
1,4 |
-1,5 |
-2,1 |
-1,5 |
1,4 |
1,4 |
1,3 |
-2,2 |
1,2 |
-1,8 |
-0,3 |
± |
1,8 |
-0,2 |
± |
1,7 |
0,76 |
|
A_24_P314351 |
ZBTB33 |
1,0 |
1,5 |
-1,5 |
-2,6 |
-2,5 |
-1,0 |
1,1 |
1,1 |
1,4 |
1,3 |
-0,9 |
± |
1,6 |
1,3 |
± |
0,2 |
0,76 |
Supplementary Table 4: Statistical overview of clinical outcome and gene expression of the candidate genes in n=50 LCLs. Gene expression was compared between positive (e.g. responder) and negative (e.g. non-responder) clinical outcome by the use of t-test (basal gene expression) or Wilcoxon rank sum test (fold changes). Significant p-values are bold and underlined.
|
|
|
WNT2B |
SULT4A1 |
TCF7L2 |
FZD7 |
ABCB1 |
|
basal gene expression |
Response after 5 weeks |
0.795 |
0.029 |
0.595 |
0.422 |
0.979 |
|
Response after 8 weeks |
0.877 |
0.092 |
0.430 |
0.476 |
0.635 | |
|
Remission after 5 weeks |
0.324 |
0.604 |
0.490 |
0.925 |
0.472 | |
|
Remission after 8 weeks |
0.656 |
0.354 |
0.109 |
0.187 |
0.992 | |
|
fold changes after treatment with fluoxetine |
Response after 5 weeks |
0.819 |
1.000 |
0.438 |
0.272 |
0.535 |
|
Response after 8 weeks |
0.966 |
1.000 |
0.373 |
0.235 |
0.963 | |
|
Remission after 5 weeks |
0.025 |
0.229 |
0.159 |
0.357 |
0.266 | |
|
Remission after 8 weeks |
0.316 |
0.400 |
0.224 |
0.462 |
0.760 |
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