1-mavzu: Molekular mехanika. Kimyoviy ilmiy-tekshirish ishlarida kompyuterlarni qo`llash

Lekin undagi qator kamchiliklar mazkur dasturni tadqiqotchining asosiy quroli sifatida foydalanishga tavsiya etish imkon bermaydi. Ular quyidagilar:

• Lekin undagi qator kamchiliklar mazkur dasturni tadqiqotchining asosiy quroli sifatida foydalanishga tavsiya etish imkon bermaydi. Ular quyidagilar:
• Kompyuter resiirslaridan samarasiz foydalanish, shu bilan bir qatorda ko‘p vaqt yo‘qotilishiga olib keladigan molekulyar tizimlar geometriyasini maqbullashtirishni tashkil etish;
• Tanlanadigan bazis to‘plainlari va elektron korrelyatsiyasini hisobga oluvchi usullarning chegaralanganligi;
• Molekulyar tizim dastlabki geometriyasini Z-matritsalar shaklida berilgandagina simmetriyani hisobga olish imkoniyati mavjud. Bu esa molekulyar strukturalami interfaol tuzih bahosini anchaga kamaytiradi.

PRIRODA dasturi

• Ushbu kvant-kimyoviy dastur ko‘p sig‘imli molekulyar modellashtirishning original amalga oshirilishiga misoldir. PBE fimksional zichlik usuli yordamida uch eksponentsialli bazis to‘plami bilan chatishtirilgan holda hisoblash vaqti N1 o‘rniga ga tushirilgan. DFT bilan bir qatorda g‘alayonlanish va bog‘langan klasterlar nazariyalari amalga oshirilgan, Dannning korrelyatsion-kelishilgan va relyativistik tuzatishlarni hisobga oluvchi psevdopotensialli bazislarni hisobga olish imkoniyati mavjud.
• Dasturning kamchiligiga foydalaniladigan hisoblash uslubiyatlarining «qovushmasligi» ni jumladan bazislar to‘plamiga diffuz qobiqlar yoki qo‘shimcha qutblanish funksiyalarini qo'sha olmaslikni kiritish mumkin.

Shunday dasturiy vositalar komplekslaridan yana biri ChemOffice (CambridgeSoft Corporation firmasining mahsuloti) dir. Ushbu dasturiy majmua bugungi kunda eng ko‘p tarqalgan dasturlardan biri bo‘lib, quyidagi 4 ta alohida dasturlarni o‘z ichiga olgan:

• Shunday dasturiy vositalar komplekslaridan yana biri ChemOffice (CambridgeSoft Corporation firmasining mahsuloti) dir. Ushbu dasturiy majmua bugungi kunda eng ko‘p tarqalgan dasturlardan biri bo‘lib, quyidagi 4 ta alohida dasturlarni o‘z ichiga olgan:
• «Kimyoviy muharrir» CS ChemDraw – an’anaviy kimyoviy formulalar muharriri vositasi;
• Ixtisoslashgan ma’lumotlar bazasi muharriri CS ChemFinder — kimyoviy birikmalar strukturasini yaratish, tahrirlash va ma’lumotlar bazasini boshqarish uchun mo`ljallangan;
• CS Chem3D dasturi — kimyoviy birikmalar fazoviy modellarini ko‘rish, kompyuter modellashtirish va hisoblashlar uchun mo‘ljallangan;
• CS Table Editor jadval muharriri – CS ChemD dasturida ishlatiladigan jadval ma’lumotlarini ko‘rish va tahrirlash uchun mo`ljallangan.