O‘ZBEKISTON RESPUBLIKASI OLIY TA’LIM, FAN VA INNOVATSIYALAR VAZIRLIGI
URGANCH DAVLAT UNIVERSITETI
Tabiiy fanlar fakulteti biologiya yo’nalishi
194-guruh tolibi Madaminov Sulaymonning
Bioinformatika fanidan
KURS ISHI
Mavzu: Oqsil ketma-ketliklari bazalari (SWISS-PROT).
Bajardi: Madaminov Sulaymon
Qabul qildi:
Urganch 2023
MUNDARIJA:
KIRISH.....................................................................................................................3
I BOB. ADABIYOTLAR SHARHI........................................................................6
II BOB. ASOSIY QISM........................................................................................14
2.1. SWISS-PROT protein ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi va uning qo'shimchasi TreEMBL................................................................................................................14
2.2. Inson proteomikasi tashabbusi (HPI)...............................................................21
2.3. SWISS-PROT-da saqlangan ma'lumotlarni boshqarish..................................25
XULOSA................................................................................................................32
FOYDALANILGAN ADABIYOTLAR.............................................................33
KIRISH
SWISS-PROT ( Bairoch va Apweiler, 1996 ) 1986-yilda tashkil etilgan va Jeneva universitetining Tibbiy biokimyo kafedrasi va EMBL maʼlumotlar kutubxonasi tomonidan 1987-yildan beri hamkorlikda yuritiladigan izohli oqsil ketma-ketligi maʼlumotlar bazasi. Bu yuqori darajadagi izohlarni (masalan, oqsil funktsiyasining tavsifi, uning domen tuzilishi, translatsiyadan keyingi modifikatsiyalari va variantlari ), minimal ortiqcha ortiqcha va yuqori darajadagi ma'lumotlarni taqdim etishga intiladigan oqsillar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi. boshqa ma'lumotlar bazalari bilan integratsiya. TrEMBL bu EMBL nukleotidlar ketma-ketligining barcha tarjimalarini o'z ichiga olgan SWISS-PROT ning kompyuter izohli qo'shimchasidir.hali SWISS-PROTga integratsiya qilinmagan yozuvlar. Hozirda SWISS-PROT va TrEMBL mos ravishda 0,5 va 7,6 million ketma-ketlikka ega. Ushbu ma'lumotlar bazalari http://www.expasy.org/sprot/ va http://www.ebi.ac.uk/swissprot/ saytlarida bepul mavjud .
SWISS-PROT oqsilning nomi va kelib chiqishi, oqsil atributlari, umumiy ma'lumotlar, ontologiyalar, ketma-ketlik annotatsiyasi, aminokislotalar ketma-ketligi , bibliografik havolalar, ketma-ketlik bilan o'zaro havolalar, tuzilish va o'zaro ta'sir ma'lumotlar bazalari va kirish ma'lumotlarini o'z ichiga oladi.
Bundan tashqari, u ketma-ket qidiruv tizimi (SRS), to'liq matnli qidiruv, kengaytirilgan qidiruv yoki tavsif yoki identifikatsiya raqami bo'yicha bir nechta qidiruv imkoniyatlariga ega.
Dostları ilə paylaş: |
