Ubiquitin (dastlab, hamma joyda tarqalgan immunopoetik polipeptid) birinchi marta 1975 yilda [1] barcha eukaryotik hujayralarda ifodalangan 8,6 kDa oqsil sifatida aniqlangan. Ubiquitinning asosiy funktsiyalari va ubikvitatsiya yo'lining tarkibiy qismlari 1980-yillarning boshida Technionda Aaron Ciechanover, Avram Hershko va Irwin Rose tomonidan 2004 yilda kimyo bo'yicha Nobel mukofotiga sazovor bo'lgan [11] tomonidan yoritilgan.
Ubiquitylation tizimi dastlab hujayra ekstraktlarida mavjud bo'lgan ATPga bog'liq proteolitik tizim sifatida tavsiflangan. Ushbu ekstraktlarda mavjud bo'lgan issiqlikka bardoshli polipeptid, ATP ga bog'liq proteoliz omili 1 (APF-1) ATP va Mg 2+ ga bog'liq jarayonda model oqsil substrati lizozimiga kovalent tarzda biriktirilganligi aniqlandi. [13] Bir nechta APF-1 molekulalari izopeptid aloqasi orqali bitta substrat molekulasi bilan bog'langan va konjugatlar erkin APF-1 ning chiqishi bilan tez parchalanishi aniqlangan. APF-1-oqsil konjugasiyasi tavsiflanganidan ko'p o'tmay, APF-1 ubiquitin sifatida aniqlandi. Ubiquitinning C-terminal glitsin qoldig'ining karboksil guruhi (Gly76) substrat lizin qoldiqlari bilan konjugatsiyalangan qism sifatida aniqlandi.
