Filogenetik daraxtlar klasterlash metodlari

FILOGENETIK DARAXTLAR KLASTERLASH METODLARI
REJA:
Kirish
I Bob Genetik algoritmga asoslangan filogenetik daraxtlar
1.1 Filogenetik haqida tushuncha
1.2 Filogenetik daraxtlarni rekonstruktsiya qilishda genetik algoritm qanday qo'llaniladi
II Bob Filogenetik daraxtlar klasterlash metodlari
2.1 Tuzilgan daraxt turlar o'rtasidagi munosabat
Xulosa
Foydalanilgan adabiyotlar
Kirish
Garchi ko'plab biologlar gibridizatsiya, gorizontal gen o'tkazish, rekombinatsiya va reassortment kabi retikulyar hodisalar evolyutsiyada muhim rol o'ynaydi, deb hisoblashsa-da, ko'pchilik nashr etilgan tadqiqotlar o'rganilayotgan turlar to'plamining evolyutsiya tarixini aks ettirish uchun daraxtlardan foydalanadi. Buning sabablaridan biri, daraxt bo'lmagan tarixlar yoki filogenetik tarmoqlarni aniqlashning ishonchli va qabul qilingan usullarining yo'qligi. So‘nggi yillarda ushbu muammoni bartaraf etish bo‘yicha ko‘plab ishlar amalga oshirildi. Bizning bu sohadagi ishimiz dastlab ildizsiz filogenetik tarmoqlarni aniqlash usullarini ishlab chiqishga qaratilgan edi va bizning kompyuter dasturimiz SplitsTree hozirda filogenetik tarmoqlarni qurishda eng ko'p ishlatiladigan dastur hisoblanadi. Yaqinda biz ildiz otgan filogenetik tarmoqlar uchun usullarni ishlab chiqishga e'tibor qaratdik, ularni daraxt va tarmoq chizish dasturimiz Dendroscope orqali taqdim etamiz.
Filogenetik tarmoqlar 2007 yilda Kembrij universitetining Nyuton institutida Filogenetika bo'yicha to'rt oylik tadqiqot dasturining asosiy mavzularidan biri bo'ldi. U erda biz filogenetik tarmoqlar sohasi shu darajaga yetgan, degan taassurot paydo bo'ldiki, buning uchun yetarli materiallar mavjud edi. bu sohaga kirishni va turli savollar va yondashuvlarni yagona tarzda taqdim etishga harakat qiladigan kitob. Bizning maqsadimiz bioinformatika, usullar va algoritmlarga qiziquvchi biologlar va evolyutsiyaga qiziquvchi kompyuter olimlari uchun ochiq uslubda ushbu sohani qamrab oladigan kitob yozish edi. Bu kitob SplitsTree4 va Dendroskop dasturlarining ideal hamrohi.