СОДЕРЖАНИЕ
Введение
|
4
|
Глава I. Введение в предмет биоинформатики
|
8
|
Введение в предмет биоинформатики. История развития биоинформатики. Перспективы развития предмета биоинформатики.
|
|
Глава II. Базы современных биоинформационных данных.
|
48
|
Виды Базы современных биоинформационных данных.
|
|
Глава III. Сравнение биологических последовательностей.
|
90
|
Основы сравнение биологических последовательностей.
|
|
Г омологические последовательности. Одиночное и множественное сравнение биологических последовательностей.
|
|
Глава IV. Прогноз генных структур эукариотических организмов.
|
173
|
Передача генетических информаций.
|
|
Досконально изученныегеномы прокариотов и эукариотов.
|
|
Глава V. Молекулярная филогенетика
|
237
|
Основные понятия филогенетики.
|
|
Определение филогенетических связей и установление филогенетического родтсва.
|
|
Глава VI. Современные способы визуализации биологических макромолекул.
|
271
|
Основные принципы визуализации пространственных структур.
|
|
Визуализуализация биологических макромолекул на основе их начальных структур.
|
|
Глава VII. Изучение структуры и свойств белков в условиях in- silico.
|
315
|
Современные подходы к предсказыванию и изучению структуры белка.
|
|
Определение структуры белка в геномах.
|
|
Глава VIII. Нейронные сети.
|
342
|
Принцип передачи сигналов в нейронах.
|
|
Применение нейронных сетей.
|
|
Глава IX, Применение биоинформационных подходов в производстве лекарственных средств.
|
362
|
Компьютерное моделирование новых лекарственных препаратов.
|
|
Глава X. Методические указания для выплнения лабораторных работ.
|
402
|
ГЛОССАРИЙ
|
564
|
Примерные варианты контрольных работ
|
573
|
ИСПОЛЬЗОВАННАЯ ЛИТЕРАТУРА
|
578
|
ИСПОЛЬЗОВАННЫЕ ЭЛЕКТРОННЫЕ
|
580
|
MUNDARIJA
|
KIRISh
|
4
|
I bob. Bioinformatika fanga kirish
|
8
|
Bioinformatika faniga kirish. Bioinformatika fanining rivojlanish tarixi.
Bioinformatika fanining istiqbollari
|
|
II bob. Zamonaviy bioinformatsion ma’lumotlar bazalari
|
48
|
Zamonaviy bioinformatsion ma’lumotlar bazalari turlari
|
|
III bob. Biologik ketma-ketliklarni taqqoslash
|
90
|
Biologik ketma-ketliklarni taqqoslash asoslari
|
|
Gomologik ketma-ketliklar. Biologik ketma-ketliklarning yakka va ko’plik taqqoslanishlari. BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) algoritmlari.
|
|
IV bob. Eukariot organizmlar gen strukturalarini bashorat qilish
|
173
|
Genetik axborotning uzatilishi.
|
|
Hisoblashning ochiq ramkasini izlash. ORF Finder dasturi.
|
|
V bob. Molekulyar filogenetika
|
237
|
Filogenetikning asosiy tushunchalari
|
|
Filogenetik daraxtlar (bog’lanishlarni aniqlash). Filogenetik daraxtlarni tuzishda maxsuslashtirilgan dasturiy vositalardan foydalanish.
|
|
VI. Biologik makromolekulalarini vizualizatsiyalashtirishning zamonaviy usullari
|
271
|
Fazoviy strukturani vizualizatsiyalashning asosiy printsiplari. RasMOL dasturi.
|
|
Biologik makromolekulalarning boshlang’ich strukturasi asosida ularni vizualizatsiyalashtirish. Работа в программах PyMOL или I-TASSER.
|
|
VII. Oqsillarning strukturasi va xususiyatlarini in-silico sharoitida o’rganis.
|
315
|
Oqsil strukturasini oldindan bilish va o’rganish bo’yicha zamonaviy yondashuvlar
|
|
Genomlarda oqsil strukturalarini aniqlash
|
|
VIII bob. Neyron to’rlari va neyron tarmoqlar
|
342
|
Neyron tarmoqlar. Neyron tarmoqlarning amaliyotda qo’llanilishi.
|
|
Neyron tarmoqni yaratish.
|
|
IX bob. Dori vositalarini ishlab chiqishda bioinformatsion yondashuvlarning qo’llanilishi
|
362
|
Yangi dori-darmonlarni kompyuterli modellashtirish.
|
|
X bob. Tajriba mashg’ulotlarni bajarish uchun uslubiy ko’rsatmalar
|
402
|
GLOSSARIY
|
564
|
Nazorat ishlarining namunalari
|
573
|
FOYDALANGAN ADABIYOTLAR
|
578
|
FOYDALANGAN ELECTRON MANBALARI
|
580
|
CONTENT
|
Introduction
|
4
|
I, Introduction to the subject of bioinformatics.
|
8
|
Introduction to the subject of bioinformatics. The history of the development of bioinformatics. Prospects for the development of the subject of bioinformatics.
|
|
II. Bases of modern bioinformation data.
|
48
|
Types of modern bioinformatic Data Bases.
|
|
III. Comparison of biological sequences.
|
90
|
Basics of comparing biological sequences.
|
|
Homologous sequences. Single and multiple biological sequence comparisons. BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)
|
|
IV. Prediction of the gene structures of eukaryotic organisms.
|
173
|
Transfer of genetic information. Genomes of prokaryotes and eukaryotes.
|
|
Finding an open reading frame. ORF Finder.
|
|
V. Molecular phylogenetics
|
237
|
Basic concepts of phylogenetics.
|
|
Phylogenetic trees. Application of specialized software tools in the construction of phylogenetic trees.
|
|
VI. Modern methods of visualization of biological macromolecules.
|
271
|
Basic principles of visualization of spatial structures. RASMOLprogram and how to work in it.
|
|
Visualization of biological macromolecules based on their initial structures. Work in PyMOL or I-TASSER programs.
|
|
VII. In-silico study of the structure and properties of proteins.
|
315
|
Modern approaches to predicting and studying protein structure.
|
|
Determination of protein structure in genomes.
|
|
VIII. Neural networks.
|
342
|
Neural networks. Application of neural networks.
|
|
Neural network compilation.
|
|
IX. Application of bioinformatic approaches in the production of medicines.
|
362
|
Computer modeling of new drugs.
|
|
X. Guidelines for conducting experimental exercises
|
402
|
GLOSSARY
|
564
|
Examples of control work
|
573
|
REFERENCES
|
578
|
ELECTRONIC SOURCES USED
|
580
|
