PRAYMER
Nukleotid ard
ıcıllığı
G
özlənilən
fraqment
lərin ölçüsü
(n.c.)
Ann.
temp.
(
˚C)
5-HTT
– F
5-HTT
– R
5'-GCGCTCCTGCATCCCCCATTA-3'
L
– 297 bp
S
–253 bp
62
˚C
5'-GGGATGCGGGGGAATACTGGT-3'
5-HT2A
– F-1
5-HT2A
– R -1
5’-CATGGAGAATAATGAGCCCAAA -3’
TT
– 427 n.c
CT
– 427, 252, 175 n.c
CC
– 252, 175 n.c
58
˚C
5’-TAACAATTGACAGCAGGAAATACC -3’
5-HT2A
– F-2
5-HT2A
– R-2
5'-AGCCAACTTCAAATGGGACA-3'
58
˚C
5'-CACACACAGCTCACCTTTTCA-3'
DNT-nin amplifikas
iyası zamanı bir nümunə üçün ümumi reaksiyanın
h
əcmi 25 μl (13μl nümunə DNT-si + 12 μl reaksiya qarışığı) təşkil etmişdir.
Reaksiya qarışığı (cədvəl 2.3) yığıldıqdan sonra tübiklər PZR aparatına (Applied
Biosystems 2720 Thermal Cycler) yerl
əşdirilmiş və müvafiq olaraq 5-HTT və 5-
HT2A genl
əri üçün cədvəl 2.2-də qeyd edilən ardıcıllıqda proqram tərtib
olunmuşdur. İlkin olaraq reaksiya 94°C temperaturda DNT zəncirinin
de
naturasiyası ilə başlayır. Sonrakı 3 mərhələ - DNT zəncirinin denaturasiyası,
praymerin DNT z
ənciri ilə hibridləşməsi və Taq DNT-polimeraza vasitəsilə
47
komplimentar DNT z
əncirinin sintezi isə bir-birinin ardınca 35-40 dəfə tsikl
şəklində təkrarlanır. Son olaraq 10 dəqiqə müddətində 72°C temperaturda
sintez pr
osesinin tamamlanması ilə PZR reaksiyası yekunlaşmış olur.
C
ədvəl 2.2
5-HTT v
ə 5-HT2A praymerlərinin PZR üçün reaksiya şəraitləri
Dostları ilə paylaş: |