Mavzu: Proteinogen aminokislotalar

Mavzu: Proteinogen aminokislotalar

Proteinogen aminokislotalar 20 ta aminokislotadir, bu genetik kod bilan kodlanganligi va oqsillarga tarjima jarayoniga kiritilganligi bilan farqlanadi. Ularning yon zanjirlarining strukturasi va polaritesiga qarab tasniflanadi.
Proteinogen aminokislotalarning xossalari
Bunday aminokislotalarning xossalari ularning sinfiga bog'liq. Va ular ko'plab parametrlarga ko'ra tasniflanadi, ular orasida quyidagilar ko'rsatilishi mumkin:
radikal (zaryadlangan "+" va "-" zaryadlangan, kutupsiz zaryadlangan, nonpolar);
funktsional guruhlar (oltingugurtli aminokislotalar, alifatik, aromatik, imino kislotalar va heterosiklik birikmalar);
katabolizmning tabiati bo'yicha (ketogenik aminokislotalar, glikogen va aralash turdagi birikmalar);
kimyoviy xususiyatlar bo'yicha (monobaz, kislotali, dikarboksilik aminokislotalar);
(sun'iy ravishda olingan aminlar, tabiiy aminokislotalar).
Har bir sinf o'z xususiyatlariga ega.
Proteinogen aminokislotalarni tasniflash
Bu turdagi aminokislotalarning etti klassi bor (ular jadvalda ko'rinadi). Quyidagilarga e'tibor bering:
Alifatik aminokislotalar. Ushbu guruhga alanin, valin, glitsin, leysin va izolotsin kiradi.
Oltingugurtli aminokislotalar. Ushbu turdagi metionin va sistein kabi kislotalar mavjud.
Aromatik aminokislotalar. Ushbu guruhga fenilalanin, histidin, tirozin va triptofan kiradi.
Neytral aminokislotalar. Bu toifa serine, treonin, asparagin, prolin, glutamin o'z ichiga oladi.
Imino kislotalari. Ushbu guruhdagi yagona element bo'lgan Proline, uni amino kislotadan ko'ra ko'proq amino kislotalar deyishga to'g'ri keladi.
Kislotali aminokislotalar . Aspartik va glutamik kislotalar ushbu toifaga kiritilgan.
Asosiy aminokislotalar. Bu toifadagi lizin, gistidin va arginin o'z ichiga oladi.
Proteinogen aminokislotalar bor aminokislotalar biosintez bilan kiritilgan oqsillar davomida tarjima. "Proteinogen" so'zi "oqsil yaratish" degan ma'noni anglatadi. Hammasi ma'lum hayot, 22 ta genetik kodlangan (proteinogen) aminokislotalar, 20 ta standartda genetik kod va maxsus tarjima mexanizmlari bilan qo'shilishi mumkin bo'lgan qo'shimcha.
Farqli o'laroq, proteinogen bo'lmagan aminokislotalar yoki oqsillarga qo'shilmagan aminokislotalar (masalan) GABA, L-DOPA, yoki triiodotironin), genetik kodlangan aminokislota o'rniga noto'g'ri kiritilgan yoki to'g'ridan-to'g'ri va standart uyali aloqa vositalari tomonidan ajratilgan holda ishlab chiqarilmagan (masalan gidroksiprolin). Ikkinchisi ko'pincha kelib chiqadi tarjimadan keyingi modifikatsiya oqsillar. Ba'zi proteinogen bo'lmagan aminokislotalar tarkibiga kiritilgan nonribosomal peptidlar ribosomal bo'lmagan peptid sintetazlar tomonidan sintezlanadi.
Ikkalasi ham eukaryotlar va prokaryotlar kiritishi mumkin selenotsistein a deb nomlanuvchi nukleotidlar ketma-ketligi orqali ularning oqsillariga SECIS elementi, bu hujayrani yaqin atrofdagi UGA-ni tarjima qilishga yo'naltiradi kodon kabi selenotsistein (UGA odatda a kodonni to'xtatish). Ba'zilarida metanogen prokaryotlar, UAG kodonini (odatda to'xtatish kodoni) ham tarjima qilish mumkin pirroliz.
Eukaryotlarda atigi 21 ta proteinogen aminokislotalar mavjud, ularning standart genetik kodining 20 tasi selenotsistein. Odamlar bularning 12 tasini bir-biridan yoki vositachilik metabolizmining boshqa molekulalaridan sintez qilishi mumkin. Qolgan to'qqiztasini iste'mol qilish kerak (odatda ularning oqsil hosilalari sifatida) va shuning uchun ular deyiladi muhim aminokislotalar. Muhim aminokislotalar histidin, izolösin, leytsin, lizin, metionin, fenilalanin, treonin, triptofanva valin (ya'ni H, I, L, K, M, F, T, W, V).
Proteinogen aminokislotalar to'plami bilan bog'liqligi aniqlandi aminokislotalar tomonidan tan olinishi mumkin ribozim autoaminoatsilatsiya tizimlari. Shunday qilib, proteinogen bo'lmagan aminokislotalar nukleotidlarga asoslangan hayot shakllarining shartli evolyutsiyaviy muvaffaqiyati bilan chiqarib tashlangan bo'lar edi. Ba'zi o'ziga xos proteinogen bo'lmagan aminokislotalarning umuman oqsillarga qo'shilmasligini tushuntirish uchun boshqa sabablar taklif qilingan; masalan, ornitin va gomoserin peptid magistraliga qarshi velosipedga aylanadi va oqsilni nisbatan qisqaradi yarim umr, boshqalari toksik, chunki ular noto'g'ri ravishda arginin analogi kabi oqsillarga kiritilishi mumkin kanavanin.
Biz vitaminlarni iste'mol qiladigan taomlardan va bizga ta'sir qiladigan quyoshdan olgan narsalarni mustahkamlash uchun qo'shamiz. Ular tanaga turli usullar bilan singib ketadi va tanadan ajralib turadi. Biz ularni suvda eruvchan yoki yog'da eriydigan deb tasniflashimiz mumkin.