|
1.2 So'nggi ishlarning zaifligi
Yuqorida muhokama qilingan hizalamasiz usullarning muvaffaqiyatiga qaramay, bu usullar ikkita asosiy cheklovga ega: Birinchidan, ular oqsillar ketma-ketligini ifodalash uchun faqat PseAAC ni ko'rib chiqdilar. An'anaviy aminokislotalar tarkibi 20 ta komponentdan iborat bo'lib, ularning har biri ketma-ket 20 ta mahalliy aminokislotadan birining paydo bo'lish chastotasini aks ettiradi. Bundan farqli o'laroq, PseAAC turli xil rejimlar [ 31 ] orqali ba'zi ketma-ketlik ma'lumotlarini o'z ichiga olgan qo'shimcha komponentlarni o'z ichiga oladi. Biroq, qo'shimcha omillar atributlari oqsil ketma-ketligining uzunligi bilan cheklangan. Konotoksin oqsillarining ko'pchiligi odatda qisqa (uzunligi 10-30 aminokislota) bo'lgani uchun [ 36 ]] PseAAC ma'lumotlari juda cheklangan. Konotoksin oqsillari ketma-ketligidagi 20 ta mahalliy aminokislotalarning normallashgan paydo bo'lish chastotalarini aks ettiruvchi dastlabki 20 ta atributga kelsak, qisqa ketma-ketlik statistik jihatdan haqiqiy paydo bo'lish chastotalarini aks ettirmasligi mumkin. Ikkinchidan, konotoksinlarning superoilasidagi evolyutsion va strukturaviy munosabatlar o'rnatilmagan. Gomologiyani ketma-ketlik o'xshashligidan xulosa qilish mumkinligi va homologik munosabatlar odatda bir xil yoki hech bo'lmaganda juda o'xshash tizimli munosabatlarni nazarda tutadi [ 20 , 37 ].
Dostları ilə paylaş: |
