Oshqozon osti bezi va gippokampdagi genlar ekspressiyasining solishtirma tahlili

II.Bob. Gippokampdagi genlar ekspressiyasining solishtirma tahlili va oshqozon osti bezini ahamiyati.
2.1. Gippokampdagi genlar ekspressiyasining
solishtirma tahlili
Inson genomlarini xaritalash uchun ishlatiladigan turli usullar ro'yxati quyida keltirilgan. Ushbu usullar odamlarda normal va kasallik genlarini aniqlash uchun ham foydalidir.
1. DNK ketma-ketligi: DNKning fizik xaritasi eng yuqori aniqlikda aniqlanishi mumkin.
2. Problardan foydalanish: RFLP, STS va SNPlarni aniqlash uchun.
3. Radiatsion gibrid xaritalash: genomni katta bo'laklarga bo'ling va markerlar va genlarni toping. Somatik hujayra gibridlarini talab qiladi.
4. Floresan in situ gibridizatsiyasi (FISH) : Xromosomadagi genni lokalizatsiya qilish.
5. Sequence tagged sayt (STS) xaritalash: Agar ba'zi ketma-ketlik ma'lumotlari mavjud bo'lsa, DNK ketma-ketligining istalgan qismiga qo'llaniladi.
6. Ekspresslangan ketma-ketlik yorlig'i (EST) xaritalash : STS xaritalashning bir varianti ifodalangan genlar aslida xaritaga tushiriladi va joylashadi.
7. Impulsli maydon gel elektroforezi (PFGE) : Katta DNK fragmentlarini ajratish va izolyatsiya qilish uchun.
8. Vektorlarda klonlash (plazmidlar, faglar, o'zgaruvchan uzunliklar, kosmidlar, YACs, BAC).: O'zgaruvchan uzunlikdagi DNK fragmentlarini ajratib olish.
9. Polimeraza zanjiri reaktsiyasi (PCR): Gen fragmentlarini kuchaytirish uchun.
10. Xromosoma yurishi : Bir-biriga o'xshash DNK bo'laklarini klonlash uchun foydalidir (taxminan 200 kb bilan cheklangan).
11. Xromosomalarning sakrashi: DNK katta bo'laklarga bo'linishi va xromosoma yurishida foydalanish uchun aylana shaklida bo'lishi mumkin.
12. Sitogenetik anomaliyalarni aniqlash : Ba'zi genetik kasalliklar ta'sirlangan genlarni klonlash orqali aniqlanishi mumkin, masalan. Duchenne mushak distrofiyasi.
13. Ma'lumotlar bazalari: Mavjud ma'lumotlar bazalari DNK va oqsil ketma-ketligini taqqoslash orqali genlarni aniqlashni osonlashtiradi.
Inson genomini tushuntirish uchun ikkita HGP guruhi tomonidan turli yondashuvlar qo'llanilgan. IHCSC asosan birinchi navbatda xaritadan, keyin esa ketma-ketlikdan foydalandi. Asosiy usul ierarxik ov miltig'i ketma-ketligi edi. Bu usul genomning kichik bo'laklarga (100-200 kb) bo'linishi, ularni vektorlarga (asosan bakterial sun'iy xromosomalar, BAC) kiritish va klonlashni o'z ichiga oladi. Klonlangan fragmentlarni ketma-ketlashtirish mumkin edi.
Celera Genomics butun genom ov miltig'i yondashuvidan foydalangan. Bu xaritalash bosqichini chetlab o'tadi va vaqtni tejaydi. Bundan tashqari, Celera guruhi inson genomlari ketma-ketligini erta yakunlashga yordam beradigan yuqori samarali sekvenatorlar va kuchli kompyuter dasturlariga ega bo'lishdan baxtiyor edi.
Inson genomi loyihasining qiziqarli savollaridan biri bu kimning genomi ketma-ketligi va u dunyoda o'zgaruvchan 6 milliardga yaqin aholi bilan qanday bog'liq? Bu savolga oddiy javob yo'q.
Biroq, ijobiy tomondan qaraganda, kimning genomi ketma-ketligi muhim emas, chunki shaxslar o'rtasidagi fenotipik farqlar umumiy genom ketma-ketligining atigi 0,1 foizidagi o'zgarishlarga bog'liq. Shuning uchun ko'plab individual genomlar ketma-ketlik uchun manba sifatida ishlatilishi mumkin.
Inson genomi bo'yicha ishlarning katta qismi Frantsiyaning Parij shahridagi Inson polimorfizmi markazi tomonidan taqdim etilgan materialda amalga oshirildi. Ushbu institut har biri uch avlodni qamrab olgan oltmish xil frantsuz oilalaridan hujayra liniyalarini to'plagan. Parijdan keltirilgan material inson genomlarini sekvensiyalash uchun ishlatilgan.
Inson genomi loyihalari haqidagi ma'lumotlar juda keng va quyida faqat ba'zi muhim fikrlarni keltirish mumkin. Ulardan ba'zilari qisqacha tavsiflanadi.