II INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS
32
Qafqaz University
18-19 April 2014, Baku, Azerbaijan
2]. Pro1-Met2-Ser3-Met4-Leu5-Arg6-Leu7-NH
2
miomodulin A molekulu yeddi aminturşu qalığından, 127 atomdan və 43
ikiüzlü fırlanma bucağından ibarətdir. Molekulun fəza quruluşu nəzəri konformasiya analizi üsulu ilə tədqiq edilmişdir [3].
Molekulun fəza quruluşunu öyrənmək üçün sistemin potensial enerjisi qeyri-valent, elektrostatik, torsion qarşılıqlı təsir
enerjilərinin və hidrogen rabitəsi enerjisinin cəmi şəkildə seçilmişdir. Miomodulin A molekulunun fəza quruluşu onu
fraqmentlərə ayırmaqla öyrənilmişdir Əvvəlcə molekulun N-tərəf Pro1-Met2-Ser3-Met4-tetra və C-tərəf Met4-Leu5-Arg6-
Leu7-NH
2
tetrapeptid fraqmentlərinin konformasiya imkanları onları əmələ gətirən aminturşu qalıqlarının stabil
konformasiyaları əsasında öyrənilmişdir. İkinci mərhələdə N- və C-tərəf tetrapeptid fraqmentlərinin stabil konformasiyaları
əsasında heptapeptid Pro1-Leu7-NH
2
molekulunun fəza quruluşu hesablanmışdır. Hesablamaların nəticələri göstərir ki,
şeyplərin, əsas zəncirin formalarının və konformasiyaların enerjilərinə görə kəskin differensiasiya gedir. 0-11.0 kkal/mol
enerji intervalına heptapeptid molekulun 11 konformasiyası düşür, Həmin konformasiyalar əsasında miomodulin A
molekulunun N-metilləşmiş [MeSer3], [MeMet4], [MeArg6]. analoqlarının fəza qurulaşları hesablanmışdır. Onların nisbi
enerjiləri cədvəl 1-də göstərilmlşdir.
[MeSer3] analoqunun yalnız iki konformasiyası aşağıenerjili olmuşdur RB
1222
B
12
R
3222
R
2122
B
3322
R
2122
konformasiyası
ən stabil olmuşdur, bu konformasiyanın nisbi enerjisi təbii molukulda 4.6 kkal/mol idi. Analoqun digər stabil
konformasiyası 4.8kkal/mol nisbi enerjili BB
1222
B
11
B
2122
R
2122
B
3322
R
2122
-dir, onun nisbi enerjisi təbii molekulda 6.6 kkal/mol
idi. Hesablamaların nəticələrinə görə qeyd etmək olar ki, [MeSer3] analoqunu sintez ücün təklif etmək olar ki, bu analoq
təbii molekulun yalnız müəyyən funkiyasını yerinə yetirə bilər.
Dostları ilə paylaş: |