O categorie specială este cea a embrionilor creaţi prin transfer nuclear în scopul derivării celulelor stem („clonare terapeutică”).
Preferarea acestei metode de producere a celulelor stem embrionare stă în faptul că aceste celule vor fi compatibile cu celulele donatorului nucleului, cu numeroase posibilităţi pentru transplantul autolog şi rezolvări în cazul respingerii organului trasplantat.
Alături de celelalte problemele etice pe care le ridică acest tip de procedură se impune discutarea şi unei alte probleme etice: transferul nuclear poate deveni primul pas spre clonarea reproductivă umană.
