PNJ má nadregionální působnost pro poskytování lůžkové zdravotní péče, její historické spádové území zahrnuje kromě Kraje Vysočina část Jihočeského kraje tj. 6 okresů:
Tábor (Jihočeský kraj)
Jindřichův Hradec (Jihočeský kraj)
Pelhřimov (Kraj Vysočina)
Jihlava (Kraj Vysočina)
Žďár nad Sázavou (Kraj Vysočina)
Třebíč (Kraj Vysočina)
Počet obyvatel ve spádovém území je kolem 600 tisíc, kromě lůžkové péče PNJ je zajištěna akutní psychiatrická péče v PO Tábor (25 lůžek) a lůžkovém zařízení Pateb s.r.o. Jemnice (60 lůžek se specializací na léčbu závislostí).
