Bab 1 pendahuluan latar Belakang Masalah
Yüklə 94,56 Kb.
|
- Bu səhifədəki naviqasiya:
- BAB II TINJAUAN PUSTAKA
- Aliran Informasi Genetik (Sentral Dogma).
- TRANSKRIPSI TRANSKRIPSI BALIK DNA mRNA PROTEIN TRANSLASI Replikasi
- Tahap Transkripsi Transkripsi
- Inisiasi (pengawalan). Transkripsi tidak dimulai disembarang tempat pada DNA, tetapi dibagian hulu (upstream) dari gen yaitu promoter
- Synthesis of an RNA Transcript
- BAB III PENUTUP KESIMPULAN
- Ingat: A jadi U; T jadi A; C jadi G pada transkripsi DNA menjadi RNA
|
BAB 1
PENDAHULUAN
Salah satu ciri makhluk hidup adalah berkembang biak (mereproduksi jenisnya). Dimana keturunan berikutnya memiliki sifat yang hampir sama dengan orangtuanya. Dalam menghasilkan keturunan baru, informasi genetik juga diwariskan dari orang tua kepada keturunannya. Proses demikian disebut dengan Hereditas (pewarisan). Genetika adalah ilmu tentang hereditas yang terkait dengan gen. Gen adalah bagian dari DNA kromosom yang mengkode satu buah molekul RNA spesifik, yang selanjutnya mengkode untuk polipeptida tertentu. Gen tersusun dari DNA (Deoxyribo Nucleic Acid). DNA tersusun atas basa nitrogen, asam deoxyribosa dan fosfat. Dimana DNA adalah dasar kimia hereditas (pewarisan) dan diorganisasikan kedalam gen, yang menjadi unit dasar informasi genetika. Pembuktian bahwa DNA mengandung informasi genetik dilakukn pertama kali pada tahun 1944 dalam serangkain percobaan oleh Avery, MacLeod, McCarty. Ketiga peneliti ini memperlihatkan bahwa penetapan genetik dari karakter kapsul pneumokukus spesifik dapat dipindahkan kepada pneumokukus lain dengan tipe kapsul yang berbeda melalui penyisipan DNA yang dimurnikan sehingga memiliki tipe yang spesifik dengan pneumokukus awalnya. Kandungan informasi DNA (kode genetik) terletak didalam (rangkaian) sequence tempat tersusunnya monomer-monomer deoksiribosanukleotida purin dan pirimidin yang saling berikatan sangat kuat yaitu ikatan fosfodieter. Dimana dengan seperti ini dapat ditentukan stuktur DNA membentuk heliks ganda. Gen juga mengendalikan sistesis berbagai tipe RNA (mRNA, rRNA, tRNA) dari DNA yang sebagian besar diantaranya terlibat dalam sintesis protein. DNA diperoleh melalui proses isolasi DNA didalam gen itu sendiri.
Berdasarkan latar belakang masalah yang telah dikemukakan di atas, maka dapat dirumuskan:
Pembuatan makalah ini bertujuan untuk:
Setelah mempelajari makalah ini, diharapkan pembaca mendapatkan:
BAB II TINJAUAN PUSTAKA
Genetika adalah cabang ilmu biologi yang mempelajari sifat-sifat keturunan (hereditas) serta segala seluk beluknya secara ilmiah. Unit-unit hereditas yang ditransmisikan dari satu generasi ke generasi berikutnya (dengan kata lain, yang diwariskan) disebut gen. Pertama kali istilah gen diperkenalkan oleh Thomas Hunt Morgan, ahli Genetika dan Embriologi Amerika Serikat (1911), yang mengatakan bahwa substansi hereditas yang dinamakan gen terdapat dalam lokus, di dalam kromosom. Pada konsep Mendelian, suatu gen digambarkan sebagai unit penurunan sifat yang mempunyai ciri-ciri yang mempengaruhi karakteristik fenotip. Menurut W. Johansen, gen merupakan unit terkecil dari suatu makhluk hidup yang mengandung substansi hereditas, terdapat di dalam lokus gen. Seluruh metabolisme dalam tubuh diatur oleh gen. Gen terdapat pada DNA. DNA merupakan komponen penyusun kromosom. Gen mempunyai sifat-sifat sebagai berikut:
Hal ini dibuktikan dari percobaan Fred Griffith (1928) yang menunjukkan DNA bakteri dapat memindahkan informasi genetik melalui proses yang disebut transformasi.
Gen menyimpan instruksi untuk membuat protein tetapi gen tidak menyusun protein secara langsung. Jembatan antara DNA dan sintesis protein adalah RNA. Basa nukleotida yang menyusun RNA adalah A, G, C, dan U. RNA pada umumnya tersusun atas untai tunggal. DNA dan RNA terbentuk dari kelompok basa nitrogen yang berbeda yaitu purin dan pirimidin. Dua purin yang terdapat paling banyak dalam DNA adalah adenin dan guanine, sedangkan basa pirimidin yang umum adalah sitosin dan timin. DNA terdiri dari gula pentose, basa nitrogen dan fosfat Gambar 1. Gambar DNA
Sejak tahun 1944 telah diketahui bahwa DNA merupakan partikel pembawa informasi genetik. Alur informasi genetik yang terjadi pada sel hidup meliputi tiga tahap yaitu tahap replikasi, transkripsi dan translasi. Alur informasi genetik (Sentral Dogma) adalah proses transkripsi DNA menjadi mRNA dan translasi menjadi sebuah polipeptida. Maksudnya adalah semua informasi yang terdapat pada DNA, kemudian akan digunakan untuk menghasilkan molekul RNA melalui transkripsi, dan sebagian informasi pada RNA tersebut akan digunakan untuk menghasilkan protein melalui proses yang disebut translasi. Pada tahun 1956, Francis H. Crick memperkenalkan diagram alur yang menggambarkan fungsi DNA dalam perjalanan informasi genetik yang disebut sentral dogma (Watson, et al. dalam T. Milanda, 1994). 2 3
TRANSKRIPSI TRANSKRIPSI BALIK DNA mRNA PROTEIN TRANSLASI Replikasi Skema 2. Dogma sentral aliran informasi genetik (Marks, et al., 2000) Keterangan:
Replikasi merupakan pembentukan DNA rangkap ganda yang komplemen satu dengan yang lainnya dan persis seperti DNA semula. Replikasi DNA bersifat semikonservatif, yaitu kedua untai tunggal DNA bertindak sebagai cetakan untuk pembuatan untai-untai DNA baru, seluruh untai tunggal hasil cetakan dipertahankan dan untai yang baru dibuat dari nukleotida – nukleotida.
Gambar 2. Macam - macam replikasi DNA Proses replikasi DNA Mula-mula, heliks ganda dibuka menjadi dua untai tunggal oleh enzim helikase (9) dengan bantuan topoisomerase (11) yang mengurangi tegangan untai DNA. Untaian DNA tunggal dilekati oleh protein-protein pengikat tunggal (10) untuk mencegahnya membentuk heliks ganda kembali. Primase (6) membentuk oligonukleotida RNA yang disebut primer (5) dan molekul DNA polimerisase (3 dan 8) melekat pada seuntai tunggal DNA dan bergerak sepanjang untaian tersebut memperpanjang primer, membentuk untaian tunggal DNA baru yang disebut leading strand (2) dan lagging strand (1). DNA polymerase yang membentuk lagging strand harus mensintesis segmen – segmen polinukleotida discontinue (disebut fragmen Okazaki (7)). Enzim DNA ligase (4) kemudian menyambungkan potongan – potongan lagging strand tersebut. Gambar 3. Proses replikasi DNA Garpu replikasi
Untaian ini disintesis dalam segmen – segmen yang disebut fragmen Okazaki. Pada untaian ini, primase membentuk primer RNA. DNA polimerisasi dengan demikian dapat menggunakan gugus OH 3’ bebas pada primer RNA tersebut untuk mensitesis DNA dengan arah 5’ 3’. Fragmen primer RNA tersebut lalu disingkirkan (misalnya dengan RNase H dan DNA Polimerisasi 1) dan deoksiribonukleotida baru ditambahkan untuk mengisi celah-celah yang tadinya ditempati oleh RNA. DNA ligase lalu menyambungkan fragmen – fragmen Okazaki tersebut sehingga sintesis lagging strand menjadi lengkap.
Gambar 4. Beberapa peristiwa dalam proses replikasi DNA
Gambar 5. Arah replikasi DNA Enzim yang terlibat dalam proses replikasi DNA adalah
Transkripsi adalah sintesis RNA dibawah arahan DNA. Keduanya menggunakan bahasa yang sama sehingga informasi dari DNA disalin begitu saja dari satu molekul ke molekul yang lain (basa T pada DNA disalin menjadi basa U pada RNA). Untai tunggal DNA bertindak sebagai template untuk penyusunan sekuen nukleotida RNA (seperti pada proses replikasi DNA, perbedaannya pada replikasi DNA yang disusun pada template induk adalah sekuen nukleotida DNA). Fungsi ini disebut fungsi heterokatalis DNA karena DNA mampu mensintesis senyawa lain yaitu RNA. Sebuah rantai DNA digunakan untuk mencetak rantai tunggal mRNA dengan bantuan enzim RNA polimerase. Enzim tersebut menempel pada kodon permulaan, umumnya adalah kodon untuk asam amino metionin. Bagi gen pengkode protein, molekul RNA tersebut merupakan transkrip dari instruksi penyusunan-protein dari gen (RNA ini dapat dihasilkan dalam jumlah yang banyak melalui proses transkripsi). Tipe molekul RNA semacam ini disebut messenger RNA (mRNA) karena molekul ini membawa pesan genetik dari DNA menuju mesin pensintesa-protein dalam sel. (Transkripsi merupakan istilah umum untuk sintesis berbagai tipe RNA dari template DNA dan ada berbagai tipe RNA yang dihasilkan melalui transkripsi). Pertama-tama, ikatan hidrogen di bagian DNA yang disalin terbuka. Akibatnya, dua utas DNA berpisah. Salah satu polinukleotida berfungsi sebagai pencetak atau sense, yang lain sebagai gen atau antisense. Misalnya pencetak memiliki urutan basa G-A-G-A-C-T, dan yang berfungsi sebagai gen memiliki urutan basa komplemen C-T-C-T-G-A. Karena pencetaknya G-A-G-A-C-T, maka RNA hasil cetakannya C-U-C-U-G-A. Jadi, RNA C-U-C-U-G-A merupakan hasil kopian dari DNA C-T-C-T-G-A (gen), dan merupakan komplemen dari pencetak. Hasil (produk) yang didapatkan pada tahap transkripsi adalah:
Ketiga produk RNA ini mengambil bagian pada proses selanjutnya dalam tahap translasi. Komponen yang terlibat pada tahap transkripsi adalah
Tahapan dalam proses transkripsi pada dasarnya terdiri dari 3 tahap :
Transkripsi tidak dimulai disembarang tempat pada DNA, tetapi dibagian hulu (upstream) dari gen yaitu promoter. Salah satu bagian terpenting dari promoter adalah kotak Pribnow (TATA box). Di dalam suatu promoter sudah terdapat signal tempat mulainya transkripsi. Selain itu promoter juga menentukan untai DNA mana yang akan dijadikan template untuk ditranskripsi (DNA memiliki dua untai berbetuk helix – double helix). Inisiasi dimulai ketika holoenzim RNA polimerase menempel pada promoter. Tahapannya dimulai dari pembentukan kompleks promoter terbuka, penggabungan beberapa nukleotida awal dan perubahan konfirmasi RNA polymerase karena struktur sigma dilepas dari kompelks holoenzim. Dimana tahapan yang terjadi pada inisiasi adalah:
Proses selanjutnya adalah elongasi (pemanjangan). Pemanjangan disini adalah pemanjangan nukleotida. Setelah RNA polymerase menempel pada promoter, maka enzim tersebut akan bergerak sepanjang molekul DNA, menguraikan dan meluruskan heliks. RNA polimerase bergerak sepanjang DNA, membuka untaian double helix-nya untuk dipasangkan dengan nukleotida RNA. Suatu enzim menambahkan untai nukleotida yang baru terbentuk sehingga untai RNA ini memanjang. RNA nukleotida yang baru tersebut terlepas dari template DNA, dan dua untai DNA yang terpisah menyatu kembali menjadi doublehelix. Dalam pemanjangan, nukloetida ditambahkan secara kovalen pada ujung 3’ molekul RNA yang ditambahkan adalah Urasil (U) dan seterusnya. Laju pemanjangan maksimim molekul transkripsi RNA berkisar antara 30 – 60 nukleotida per detik. Kecepatan elongasi tidak konstan.
Terminasi juga tidak terjadi disembarang tempat. Transkripsi berakhir ketika menemui nukleotida tertentu berupa stop kodon. Selanjutnya RNA terlepas dari DNA templat menjadi ribosom. mRNA sebagai pembawa informasi dari DNA menuju ribosom, ditranskripsi dari untai template suatu gen. Enzim RNA polimerase memisahkan dua untai DNA dan menggabungkan nukleotida RNA dengan basa pasangannya pada template DNA. Sekuen nukleotida yang spesifik pada untai DNA menandai tempat dimana transkripsi gen bermula dan berakhir. Sekuen DNA dimana RNA polimerase menempel dan memulai transkripsi dikenal sebagai promoter (pada bacteria signal yang mengakhiri transkripsi dikenal sebagai terminator). Untai DNA yang ditranskripsi ke dalam molekul RNA disebut unit transkripsi. Selama transkripsi, gen menentukan urutan dari basa sepanjang molekul mRNA (Gambar 5). Untuk tiap-tiap gen, hanya satu dari dua untai DNA yang ditranskripsi. Untai ini disebut template strand karena untai tersebut menyediakan pola atau cetakan urutan nukleotida dalam transkrip RNA. Molekul mRNA merupakan komplemen dari DNA template karena basa RNA disusun berdasarkan aturan pasangan basa. Pasangannya adalah serupa dengan yang dihasilkan pada replikasi DNA tetapi U pada RNA menggantikan T dan berpasangan dengan A, serta nukleotida dari mRNA mengandung ribose bukan deoxyribose. Seperti pada sintesis untai baru DNA, molekul RNA yang disentesis dari template DNA juga disusun dengan arah antiparalel. Sebagai contoh, basa triplet DNA adalah ACC (dibaca 3’- ACC-5’) menjadi template bagi tersusunnya 5’-UGG-3’ mRNA. Basa triplet pada mRNA ini disebut kodon, dan pada umumnya tertulis dengan arah 5’-3’. Pada contoh diatas UGG merupakan kodon bagi asam amono tryptophan (Trp). Istilah kodon juga digunakan untuk basa triplet DNA pada untai non-template. 
Gambar 6. Tiga kode DNA (kodon) Synthesis of an RNA Transcript Terdapat tiga tahap transkripsi (Figure 6) yaitu inisiasi, elongasi, dan terminasi.
Gambar 7. Tiga tahap transkripsi
Translation adalah sintesis polipeptida yang terjadi melalui arahan dari mRNA. Sel harus menterjemahkan urutan molekul basa RNA ke dalam urutan asam amino polipeptida. Tempat terjadinya penerjemahan/translasi adalah ribosom yaitu suatu komponen partikel yang memfasilitasi penggabungan asam amino yang berurutan menjadi rantai polipeptida.Translasi merupakan suatu proses penerjemahan urutan nukleotida yang ada pada molekul mRNA menjadi rangkaian asam-asam amino yang menyusun suatu polipeptida atau protein. Yang diperlukan dalam proses translasi adalah mRNA, ribosom, tRNA, dan asam amino. Dalam melakukan proses translasi, sel menginterpretasikan pesan genetik ke dalam pembentukan polipeptida. Pesan tersebut terdapat dalam rangkaian kodon pada molekul mRNA, sedangkan interpreter-nya adalah transfer RNA (tRNA). Fungsi tRNA adalah mentransfer asam amino dari sitoplasma menuju ribosom. Ribosom merangkai asam amino yang dibawa oleh tRNA menjadi rangkaian polipeptida (Gambar 8). Gambar 8. Konsep dasar tahap translasi. Kunci dari translasi pesan genetik menjadi rangkaian asam amino tertentu adalah bahwa tiap-tiap molekul tRNA mentranslasikan kodon mRNA ke dalam asam amino tertentu. tRNA yang masuk ke dalam ribosom membawa asam amino pada ujungnya sedangkan pada ujung yang lainnya terdapat triplet nukleotida yang disebut antikodon, yang berpasangan dengan kodon mRNA. Seperti halnya pada tahap transkripsi, tahap translasi ini juga dibagi tiga tahap:
Tempat terjadinya penerjemahan/translasi adalah ribosom yaitu suatu komponen partikel yang memfasilitasi penggabungan asam amino yang berurutan menjadi rantai polipeptida. Ribosom tersusun atas dua sub unit yaitu subunit besar dan subunit kecil (Gambar 9).
Gambar 9. Susunan ribosom dan anatomi dari fungsi ribosom. Subunit ribosom tersusun atas protein dan molekul RNA yang disebut ribosomal RNA (rRNA). Setiap ribosom memiliki selain memiliki tempat untuk mengikat mRNA juga memiliki tempat untuk mengikat tRNA yaitu sisi P, sisi A, dan sisi E. Sisi P mengikat tRNA yang membawa rangkaian polipeptida, sisi A mengikat tRNA yang membawa asam amino berikutnya yang akan dirangkai, sisi E adalah tempat keluarnya tRNA. Inisiasi diawali dengan mengumpulnya mRNA, tRNA yang membawa asam amino pertama, dan dua subunit ribosom. Subunit ribosom kecil mengikat mRNA dan tRNA yang membawa asam amino metionin, kemudian subunit ribosom besar menempel. Secara keseluruhan komponen ini disebut sebagai translation initiation complex. Suatu protein yang disebut initiation factor dibutuhkan untuk menjaga translation initiation complex tetap menyatu. Pertama tRNA mengikat asam amino menyebabkan tRNA teraktivasi (dinamakan peristiwa amino-asilasi). Proses amino-asilasi ini dikatalis oleh enzim tRNA sistetase. Kemudian ribosom mengalami pemisahan menjadi subunit besar dan kecil. Subunit kecil dapat menempel pada mRNA dengan kodon awal tempat menempel : 5’ – AGGAGG – 3’. Urutan tempat menempelnya subunit kecil disebut urutan Shine-Dalgamo. Subunit kecil dapat menempel pada mRNA bila ada IF-3. Pembentukan kompleks IF-2/tRNA-fMet dan IF-3/mRNA-fMet disebut asam amino N-formilmetionin dan memerlukan banyak GTP sebagai sumber energi. tRNA-fMet kemudian menempel pada kodon pembuka P subunit kecil. Pada proses IF-1 dan IF-2 dilepas dan GTP dihidrolisis menjadi GDP, dan siap melakukan elonganasi.
Perbedaan pada proses transkripsi, pada translasi asam amino yang dipanjangkan. Tahapan yang dilakukan pada proses elongasi, pertama adalah pengikatan tRNA pada sisi A yang ada pada ribosom. Yang saling berikatan membentuk ikatan peptida. Pada elongasi translasi, asam amino ditambahkan satu persatu ke asam amino sebelumnya. Setiap penambahan asam amino membutuhkan protein yang disebut elongation factor. Elongasi berlangsung dalam siklus yang terdiri atas tiga tahap yaitu pengenalan kodon, pembentukan ikatan peptide, dan translokasi (Gambar 10).
Translasi akan berakhir pada salah satu dari tiga kodon terminasi (UAA, UGA, UAG) yang ada pada mRNA mencapai posisi A pada ribosom. Ketiga sinyal penghentian ini disebut release factor (RF) pada kodon terminasi (stop kodon). Tahap akhir translasi adalah terminasi (Gambar 11). Elongasi akan berjalan terus menerus hingga kodon “stop” pada mRNA mencapai sisi A pada ribosom. Protein yang disebut release factor terikat secara langsung pada kodon “stop” di sisi A.
Gambar 11. Tahap terminasi dari translasi. Selama translasi, sekuen dari kodon di sepanjang untai mRNA di terjemahkan (translasi/dekode) ke dalam sekuen asam amino yang menyusun rantai polipeptida. Gambar 12 menunjukkan hubungan antara kodon dan protein yang disintesis. Gambar 12. Hubungan antara kodon dan protein yang disintesis
Gambar 13. Tahap translasi
Gambar 14. Tahap sintesis protein KODE GENETIK Masing – masing protein mengandung asam amino dalam jumlah tertentu yang tersusun secara tepat menjadi suatu sekuens. Gen - gen tersusun dari kodon-kodon yang masing - masing menspesifik sebuah asam amino spesifik melalui molekul mRNA . Sebuah kodon terdiri atas sebuah gugus tiga nukleotida (triplet nukleotida. Urutan sekuen DNA dan mRNA adalah sebagai berikut:
Dalam pembentukan asam amino diawali oleh asam amino metionin (AUG) dan diakhiri oleh kodon stop (UAA, UAG, UGA).
DNA adalah polimer dari nukleotida-nukleotida. Nukleotida-nukleotida dalam DNA dihubungkan satu dengan yang lainnya oleh ikatan fosfodiester, yaitu ikatan yang terjadi antara Carbon katida dari satu nukleotida terdiri dari sebuah gula pantosa (deoksiribosa), satu buah fosfat dan satu basa nitrogen. Basa nitrogen tersebut berikatan dengan carbon pertama dari gula deoksiribosa, sedangkan fosfat berikatan dengan karbon kelima dari gula yang sama. Basa nitrogen yang menyusun nukleotida dikelompokan menjadi 2 yaitu:
Gambar 15. Basa Nitrogen Beda DNA dengan RNA adalah
Tabel 1. Beda DNA dan RNA Bentuk susunan DNA dan RNA 
Gambar 16. (a) Perbandingan nukleotida RNA dan DNA dan (b) Perbandingan struktur tiga dimensi DNA dan RNA
Hukum Chargaff: Chargaff meneliti proporsi relatif dari purin dan purimidin dalam suatu DNA dari sejumlah organisma. Hasil penelitiannya menunjukkan bahwa dalam DNA dari organisma apapun jumlah A=T dan C=G. Dengan menggunakan difraksi sinar X diketahui bahwa DNA mempunyai susunan helix. Watson dan Crick: Watson dan Crick menemukan bahwa DNA berbentuk doubel helix. Setiap molekul DNA terdiri dari dua rantai polinukleotida yang tersusun secara anti paralel membentuk struktur duobel helix.
Komponen Penyusun DNA double heliks
Tiga ikatan hidrogen antara C dan G
D. ISOLASI DNA Isolasi DNA adalah suatu proses untuk memisahkan DNA dari suatu sel makhluk hidup baik dari inti, mitokondria maupun kloroplas. Isolasi DNA merupakan langkah yang tepat untuk mempelajari DNA seperti mengetahui urutan basa purin dan pirimidinnya. Prinsip-prinsip dalam melakukan isolasi DNA ada dua, yaitu sentrifugasi dan presipitasi. Sentrifugasi merupakan teknik untuk memisahkan campuran berdasarkan berat molekul komponennya. Molekul yang mempunyai berat molekul besar akan berada di bagian bawah tabung dan molekul ringan akan berada pada bagian atas tabung. Hasil sentrifugasi akan menunjukkan dua macam fraksi yang terpisah, yaitu supernat pada bagian atas dan pelet pada bagian bawah (Campbell dkk. 2002 : 115). Presipitasi merupakan langkah yang dilakukan untuk mengendapkan suatu komponen dari campuran (Albert dkk. 1994 : 254) Isolasi DNA memilika beberapa tahapan, yaitu :
Isolasi sel bertujuan untuk memisahkan sel dari jaringan selanjutnya dinding dan membran sel dilisis dengan dua cara yaitu mekanik dan enzimatik. Ekstraksi DNA dalam larutan bertujuan memisahkan DNA dari larutan. DNA yang diperoleh kemudian dipurifikasi untuk memisahkan DNA dari kontaminan. Tahap terakhir dari isolasi DNA yaitu presipitasi yang bertujuan untuk mengendapkan DNA dari supernatannya. Proses isolasi DNA pada umumnya memiliki prinsip isolasi yang hampir sama dengan cara sentrifugasi dan presipitasi seperti yang dikemukakan Zubaidah (2004) dan Jamilah (2005) menyatakan bahwa isolasi DNA dapat dilakukan melalui tahapan-tahapan antar lain : preparasi ekstrak sel, pemurnian DNA dari ekstrak sel dan presipitasi DNA. Secara umum dapat dilihat pada skema berikut : GEN DNA
MEDIA Pengendapan DNA Campuran membentuk 3 lapisan Lap bawah (fase organik) Lap atas
(fase air) Lap interfase (protein terdaturasi) LAP AIR
ENDAPAN DNA ISOLASI DNA Dipecah:
Enzim dan mekanik dilepaskan disuspensi
- saline- EDTA - pemanasan - NaCl - detergen (SDS) - enzim protease - sentrifugase (10.000g) Campuran alcohol/etanol/isoamilalkohol dan kromofom (deproteinasi) Skema 2. Proses Isolasi DNA Pada tahap awal isolasi DNA, sel dari organisme dipecah (dapat dilakukan secara mekanik atau menggunakan enzim). Selanjutnya DNA yang diperoleh disuspensikan kedalam media tertentu lalu diendapakn. Pengendapan DNA dapat dilakukan dengan menggunakan larutan saline-EDTA, detergen (SDS), NaCl, pemanasan, enzim protase dan sentrifugasi. Pada tahap selanjutnya ditambahkan campuran yang terdiri dari tiga lapisan yaitu lapisan bawah, lapisan atas dan lapisan interface (tergantung dari DNA yang diinginkan). Misalnya DNA pada pisang ditemukan pada lapisan interface dan DNA pada darah ditemukan pada lapisan bawah (saepudin dan siswati, 2011). Isolasi DNA pada Leukosit
BAB III PENUTUP
Hal ini dibuktikan dari percobaan Fred Griffith (1928) yang menunjukkan DNA bakteri dapat memindahkan informasi genetik melalui proses yang disebut transformasi.
2 3 1 Skema alur informasi genetik TRANSKRIPSI TRANSKRIPSI BALIK DNA mRNA PROTEIN TRANSLASI Replikasi
Watson dan Crick menemukan bahwa DNA berbentuk doubel helix. Setiap molekul DNA terdiri dari dua rantai polinukleotida yang tersusun secara anti paralel membentuk struktur doubel helix.
Isolasi DNA merupakan proses pemisahan DNA dari sel baik dari inti sel, mitokondria. Isolasi DNA dapat dilakukan dengan preparasi ekstrak sel dan pemurnian sel DNA yang dapat dilakukan dengan cara elektroforesis. DAFTAR PUSTAKA Elrod, L. Susan & William D. Stansfield. 2002. Schaum’s Outline Teori dan Soal – Soal Genetika, Edisi Keempat. Erlangga. Goodenough & Adisoemarto. 1988. Genetika. Jakarta. Erlangga Griffith, A.J.F; Miller, J.H; Suzuki, D.T; Lewotin R,C and Gelbart,W.M (1993). An Introduction to Genetic Analysis. 5th. New York; W.H. Freeman dan Company. Pp. 541-543. Kuchel, Philip & Greorgy B. Ralston. 2006. Schaum’s Easy Outline. Erlangga Poedjiadi, Anna & Supriyanti, Titin F. M. Dasar – Dasar Biokimia. Jakarta: Universitas Indonesia Press Reece, Campbell: Mitchell. (2000). Biologi. Edisi kelima. Erlangga Stryer, Lubert. 1981. Biochemistry. New York. Freemanand Company Watson, J.D ; Hopkins, N. H: Robert, J..: Steitz, J.A dnd Weiner, A.M. (1987). Molecular Biology of The Gene.4th Ed. California The Benjamin/Cummings Publishing Company. Pp. 571-573 http://google.com/ Expresi Gen (From Gene of Protein) diambil dari Campbell et al (2009), Biology 8th.
INDEKS
Untai DNA
Ingat: A jadi U; T jadi A; C jadi G pada transkripsi DNA menjadi RNA
Yüklə 94,56 Kb. Dostları ilə paylaş:
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pembentukan leading dan lagging strand
garpu replikasi yang mensintesis DNA (untaian ganda)
