1 friday, april 19 Biochemistry and Molecular Biology asbmb graduate and postdoctoral travel award keynote lecture special Session

Y. 

Zhang, D. Zhou, J. Ma, Y-X. Pan and H. Chen. Univ. of Illinois 

at Urbana-Champaign.

C58 

981.7 

The detection of 5-hydroxymethylcytosine in 

Trypanosoma brucei DNA. 

E. Valentine, R. Smindak and K.T. 

Militello. SUNY at Geneseo.

C59 

981.8 

Replication and transcription of SV40 direct 

distinct epigenetic signaling. 

B. Milavetz, L. Kallestad, A. 

Gefroh, E. Woods and K. Christensen. Univ. of North Dakota.

C60 

981.9 

Regulation of the DNA-binding protein CFP1 

by ERK1/2. 

A.M. Klein, S. Earnest and M.H. Cobb. Univ. of 

Texas Southwestern Med. Ctr.

TUESDAY BIOCHEMISTRY

330

982. HETEROCHROMATIN

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C61 

982.1 

Sirtuins mediate cohesion of silenced domains 

in Saccharomyces cerevisiae. 

Y-F. Chen and M. Gartenberg. 

UMDNJ-Robert Wood Johnson Sch. of Med.

983.  NON-CODING RNAS IN GENE REGULATION 

AND CHROMOSOME STRUCTURE

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C62 

983.1 

Identification of SCAL1, a novel long non-

coding RNA, induced by cigarette smoke and associated with 

lung cancer. 

P. Thai, S. Statt, E. Liang, C. Campbell and R. 

Wu. Univ. of California, Davis.

984.  RECOMBINANT DNA TECHNOLOGY

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C63 

984.1 

A biologist’s resource for protein expression 

plasmids: the Protein Structure Initiative:Biology-Materials 

Repository. 

C. Cormier, J. Park, M. Fiacco, J. Steel, P. Hunter 

and J. LaBaer. Biodesign Inst., Arizona State Univ.

C64 

984.2 

Vaccination of BALB/c mice against a murine 

hookworm model. 

M.W. Schlotterback, P. Comella, C. Horien, 

K. Neutzling, K. Luk, E. Richards and J. Pearson. Concordia 

Col., MN.

C65 

984.3 

Innovative immunological assays for diagnosis 

of Schistosoma mansoni for clinical acute and/or chronic forms. 

R.F.G. Queiroz, D. Harn and P.M. Coelho. Fiocruz, Belo 

Horizonte, Brazil and Univ. of Georgia.

C66 

984.4 

Large-scale expression and purification of 

active pseudolysin in Escherichia coli. 

R.S. Tarpley, O.A. 

Adekoya, I. Sylte and O.O. Odunuga. Stephen F. Austin State 

Univ., TX and Univ. of Tromsø, Norway.

C67 

984.5 

Novel method for the scarless single-step 

assembly of many small DNA sequences. 

T.L. Roth, L. 

Milenkovic and M. Scott. Stanford Univ.

C68 

984.6 

Synthetic biology and the production from 

Brazilian spider silk protein Masp1 in E. coli system. 

V.A. 

Michalczechen-Lacerda, P.F. Oliveira, G.R. Vianna, A.M. 

Murad, D.L. Kaplan and E. Rech. Tufts Univ. and Univ. of 

Brasilia.

985.  FRONTIERS IN RNA BIOLOGY

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C69 

985.1 

Inhibition of HIV-1 transcription by a tunable 

chimeric tRNA(Ser)-nucloelar localizing trans-activation 

response element decoy. 

C. Stevens, L. Scherer, J. Rossi and 

K. Haushalter. Harvey Mudd Col., CAand Beckman Res. Inst., 

Duarte, CA.

986.  RIBOSOME AND TRANSLATION

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C70 

986.1 

The disassembly of post-termination complex 

by ribosome recycling factor and EF-G occurs first with the 

releases of tRNA, mRNA, and splitting of the ribosome in its 

order – IF3 does not participate in this reaction. 

A. Kaji, N. 

Iwakura and H. Kaji. Univ. of Pennsylvania Sch. of Med. and 

Thomas Jefferson Univ. Kimmel Cancer Ctr.

C71 

986.2 

Actin bundling mutants in translation elongation 

factor 1A induce altered protein synthesis at both the initiation 

and elongation steps. 

W.B. Perez and T.G. Kinzy. UMDNJ-

Robert Wood Johnson Med. Sch.

C72 

986.3 

Cloning and characterization of leucyl-tRNA 

synthetase from Pseudomonas aeruginosa. 

E. Medellin, H. 

Salazar, N. Quach, P. Chavero and J. Bullard. Univ. of Texas 

-Pan American.

C73 

986.4 

Enzymatic analysis of EF-Tu and EF-Ts from 

Pseudomonas aeruginosa. 

A. Tran, S. Palmer and J. Bullard. 

Univ. of Texas-PA.

C74 

986.5 

Cloning and characterization of EF-Tu and EF-

Ts from Bacillus subtilis. 

C. Rivera, V. Garcia and J. Bullard. 

Univ. of Texas-PA.

C75 

986.6 

Evolution of ribosomal RNA: universal and 

domain-specific conserved sequences. 

S.A. Gerbi, S.M. Doris, 

D. Smith, B. Raphael, J. Beamesderfer and J. Nathanson. 

Brown Univ.

C76 

986.7 

Widespread regulation of translation by 

elongation pausing in heat shock. 

R. Shalgi, S. Lindquist and 

C.B. Burge. MIT and Whitehead Inst. for Biomed. Res.

C77 

986.8 

Primary and alternative S18 ribosomal protein 

in  Mycobacterium tuberculosis. 

S. Prisic and R.N. Husson. 

Boston Children’s Hosp./Harvard Med. Sch.

987.  RNA EDITING AND MODIFICATION

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C78 

987.1 

Characterization of putative mitochondrial 

processing peptidase 

a-subunit in Trypanosoma brucei.  I.L. 

Mak, Z. Lu, V.N. Mehta and R. Salavati. McGill Univ.

BIOCHEMISTRY TUESDAY

331

T

U

E

988.  RNA PROCESSING

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C79 

988.1 

Structural insights into RNase T in RNA 

maturation and DNA repair. 

H.S. Yuan, Y-Y.  Hsiao  and W-C. 

Chu. Inst. of Molec. Biol., Acad. Sinica, Taipei and Natl. Yang-

Ming Univ., Taiwan.

C80 

988.2 

Investigation of functionally critical residues 

in the pseudo-helicase domain of Brr2. 

D. Anguiano, C.M. 

Brittsan, J.K. Titus, W. Boswell, C. Guthrie and C. Maeder. 

Texas State Univ.-San Marcos and UCSF.

C81 

988.3 

Comprehensive mechanistic analysis of the 

RNA-lariat debranching enzyme. 

E.M. Ransey, S. Dey, S. Das 

and M. Macbeth. Carnegie Mellon Univ.

C82 

988.4 

Alternative substrate kinetics of Escherichia 

coli ribonuclease P: determination of relative rate constants 

by internal competition. 

L.E. Yandek, H-C. Lin and M. Harris. 

Case Western Reserve Univ.

C83 

988.5 

Insights into splicing: structure of the yeast 

U1 snRNP. 

C. van der Feltz, N. Grigorieff and D. Pomeranz 

Krummel. Brandeis Univ. and HHMI, Chevy Chase, MD.

989.  RNA STRUCTURE AND DYNAMICS

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C84 

989.1 

Molecular dynamics study of the stability of the 

sarcin/ricin domain of RNA. 

M.F. Bruist and C. Cavanaugh. 

Univ. of Sciences in Philadelphia.

C85 

989.2 

Conformational stability of loop E in the potato 

spindle tuber viroid. 

R.M. Salvo, M.F. Bruist and T. Baumstark. 

Univ. of Sciences, Philadelphia and Cornell Univ.

990.  RNA STRUCTURE, FUNCTION AND 

REGULATION

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C86 

990.1 

The amyotrophic lateral sclerosis and 

frontotemporal dementia-associated C9ORF72 r(GGGGCC)n 

hexanucleotide repeat forms extremely stable uni- and multi-

molecular RNA G-quadruplex structures. 

K. Reddy, B. Zamiri, 

S. Stanley, R. Macgregor and C. Pearson. The Hosp. for Sick 

Children and Univ. of Toronto.

991.  RNA TRANSPORT AND LOCALIZATION

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C87 

991.1 

Regulation of mRNA export by the PI3 kinase/

AKT signaling pathway. 

E.A. Vancor, A.J.C. Quaresma and 

J.A. Nickerson. Univ. of Massachusetts Med. Sch.

992.  RNA TURNOVER

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C88 

992.1 

A stress-activated, p38 MAPK-ATF/CREB 

pathway regulates the post-transcriptional decay of target 

mRNSs. 

J. Gao, J.L. Wagnon, R.M. Protacio, G.V. Glazko, 

M. Beggs, V. Raj, M.K. Davidson and W.P. Wahls. Univ. of 

Arkansas for Med. Sci.

993.  REGULATORY THIOL MODIFICATIONS

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C89 

993.1 

Turnabout is fair play: mutual regulation of 

palmitoylation and raft partitioning. 

I. Levental and K. Simons. 

Univ. of Texas Hlth. Sci. Ctr. at Houston and Max Planck Inst. of 

Cell Biol. and Genet., Dresden.

C90 

993.2 

A redox insensitive triple cysteine mutant of 

SirT1 rescues oxidative stress-induced apoptosis. 

D. Shao, 

J. Fry, R. Zee, V. Kumar, D. Pimentel, R. Cohen and M. 

Bachschmid. Boston Univ.

C91 

993.3 

Modulation of signaling proteins by reversible 

cysteine modification. 

J.D. Keyes, K. Nelson, D. Parsonage, 

L. Daniel, C. Furdui and L. Poole. Wake Forest Univ.

C92 

993.4 

Oxidation of the Hsp70 BiP protects cells 

during ER stress. 

C. Sevier, K. Pareja and J. Wang. Cornell 

Univ.

994. AUTOPHAGY

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C93 

994.1 

Role of HSF1 and FoxO3 in proteotoxic stress 

induced macroautophagy. 

A. Murshid, S.D. Chou, T. Eguchi 

and S. Calderwood. Beth Israel Deaconess Med. Ctr., Harvard 

Med. Sch.

C94 

994.2 

Failure of autophagy induction makes multidrug 

resistant cells vulnerable to BH3-mimetic gossypol. 

J-H. Ahn, 

G-H. Jang and M. Lee. Univ. of Incheon, South Korea.

TUESDAY BIOCHEMISTRY

332

C95 

994.3 

Mitophagy as a quality control mechanism in 

Saccharomyces cerevisiae. 

H. Abeliovich, M. Zarei, K.T.G. 

Rigbolt, R.J. Youle and J. Dengjel. Hebrew Univ. of Jerusalem, 

Freiburg Inst. for Adv. Studies, Germany and NINDS, NIH.

C96 

994.4 

The role of enhanced autophagy in acquired 

resistance to new B-Raf inhibitor UI-152. 

G-H. Jang, J-H. Ahn 

and M. Lee. Univ. of Incheon, South Korea.

C97 

994.5 

Effects of aging on the heat shock response 

and autophagy in human peripheral blood mononuclear 

cells. 

K.R. Lanphere, S. Schneider, C. Mermier, M. Zuhl, K. 

Dokladny and P. Moseley. Univ. of New Mexico.

C98 

994.6 

B19, a novel monocarbonyl analogue of 

curcumin induced human ovarian cancer cells apoptosis 

via activation endoplasmic reticulum stress and autophagy 

signaling pathway. 

J. Xiao, W. Qu, Z. Wang, H. Shi and H. 

Zhang. Wenzhou Med. Col., China.

C99 

994.7 

The effect of HSF-1 and HSP70 on autophagy 

regulation. 

K. Dokladny, V. Deretic and P.L. Moseley. Univ. of 

New Mexico.

C100 

994.8 

Effect of a six week exercise training program 

on proteolytic enzyme activity, ROS generation and autophagy 

in the white gastrocnemius and left ventricle of normotensive 

and hypertensive rats. 

E.M. McMillan, M-F. Paré and J. 

Quadrilatero. Univ. of Waterloo, Canada.

C101 

994.9 

A protocol for screening of autophagy 

regulatory genes applying cell sorting and next-generation 

sequencing technologies. 

W-P. Huang and A-Y. Liu. Natl. 

Taiwan Univ.

995.  PROTEASES IN CELL REGULATION AND 

DISEASE

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C102 

995.1 

Expression of recombinant human neutrophil 

cathepsin G in Pichia pastoris. 

E.T. Perry, E. Smith and D. 

Johnson. East Tennessee State Univ. Quillen Col. of Med.

C103 

995.2 

Extracellular thimet oligopeptidase is carried 

by cell membrane microvesicles of prostate cancer cells. 

Y. Liu, 

L.A. Bruce and A.J. Wolfson. Wellesley Col.

C104 

995.3 

Perillyl alcohol and rapamycin-mediated 

inhibition of migration and invasion. 

T. Sundin, P. Mollica, D. 

Peffley and P. Hentosh. Old Dominion Univ.

C105 

995.4 

Nuclear MMP-2: presence and activity in 

cardiac myocytes. 

M.Y. Kondo, M.M. Castro, F. Fan and R. 

Schulz. Univ. of Alberta.

C106 

995.5 

Caspase-1 activation is critical for endothelial 

activation and early atherogenesis. 

Y. Yin, H. Wang and X-f. 

Yang. Temple Univ. Sch. of Med.

C107 

995.6 

The activation of factor VII by a variety of 

potential activators. 

K. Ke and J. Morrissey. Univ. of Illinois, 

Urbana.

C108 

995.7 

Development of affinity purification systems for 

isolation and proteomic analysis of proteases from Tetrahymena 

thermophila. 

B. Lu, J.R. Carreon and J.W. Straus. Vassar 

Col., NY and Ramapo Col., NJ.

C109 

995.8 

RpoS is directly controlled by ATP levels. 

C. 

Peterson. Suffolk Univ., MA.

996.  PROTEIN FOLDING, MISFOLDING AND 

AGGREGATION

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C110 

996.1 

Dual role of the metalloprotease FtsH in 

biogenesis of the DrrAB drug transporter. 

W. Li. Georgia State 

Univ.

C111 

996.2 

Detection of pathological tau conformers in 

cerebrospinal fluid. 

Z.M. March, S. Gupta and D.W. Colby. 

Univ. of Delaware and Indian Inst. of Technol.-Gandhinagar.

C112 

996.3 

Antiparallel 

b structure in Ab42 oligomers. L. 

Gu, C. Liu and Z. Guo. UCLA.

C113 

996.4 

Probing molecular mechanism of 

destabilization and misfolding of human apolipoprotein A-I 

in familial amyloidosis. 

M. Das, X. Mei, D. Atkinson and O. 

Gursky. Boston Univ. Sch. of Med.

C114 

996.5 

Structural and functional importance of third-

circuit hydrogen bonds within hemolysin A. 

M.A. Apolinario 

and T.M. Weaver. Univ. of Wisconsin-La Crosse.

C115 

996.6 

Hydrazines as potential anti-amyloidogenic 

agents. 

S. Ghosh , C. Schifone, M. Foster, B. Torok, H. Levine 

III and M. Torok. Univ. of Massachusetts Boston and Univ. of 

Kentucky.

C116 

996.7 

Synthesis of functional proteins via 

bioconjugation. 

M. Pirigyi and N.J. Zondlo. Univ. of Delaware.

C117 

996.8 

Isoflurane preconditioning involves the 

upregulation of aquaporin genes. 

Z. Schwamb, N. Seidler and 

C. Theisen. Kansas City Univ. of Med. and Biosci.

C118 

996.9 

The circulating molecular chaperone clusterin 

interacts with amyloidogenic transthyretin oligomers and 

modulates amyloid formation. 

M.J. Greene, E. Klimtchuk, C. 

Koch, D. Seldin and L.H. Connors. Boston Univ. Sch. of Med.

C119 

996.10  A single-molecule fluorescence system for 

studying adenylate kinase under force. 

C.A.M. Wilson, S.M. 

Leachman, B. Cervantes, A. Ierokomos, S. Marqusee and 

C. Bustamante. Univ. of California, Berkeley.

C120 

996.11  Structural and kinetic differences in 

oligomerization-fibrillation of serum amyloid A and not the 

intrinsic amyloidogenicity may contribute to pathogenesis in AA 

amyloidosis. 

S. Srinivasan, S. Patke, J.J. Aguilera, R.S. Kane 

and W. Colon. Rensselaer Polytech Inst.

C121 

996.12  Beta-arc 2 hydrogen bond network within 

hemolysin A facilitates hemolytic activation.