Turli organizmlar genomining xaritalanishi bolumotlar bazalari
Genlarni taqqoslash asosida turlarning filogenetik yaqinligini aniqlash
Genom nima?
Genom zi bir viruslar genomi RNK dan iborat. Shu bilan birga, lum turning genetik materiallari xromosomalarni gaploid toplamida yig`ilgan genlarni yozish uchun ishlatilgan. Suffiks nosini beradi, shuning uchun liq genetik xususiyatlarini - tarkibidagi genlar sonini va ularning ketma-ketligini, har bir gen tarkibidagi nukleotidlar sonini va ularning ketma-ketligini aniqlash, har bir genning organizm metabolizmiga yoki umuman hayotiy faoliyatiga bogsirlarga reaktsiyasini bashorat qilish, genlarning har biridagi nukleotidlar ketma-ketligini va genlar sonini bilib olishga imkon beradi.
Genomikaning vazifasi butun hujayraning toliq funktsiyalarini aniqlashdan iborat. Genomika organizmning mohiyatini - uning potentsialini, turlarini va hatto individual boshqa organizmlardan farqini, tashqi ta bu ayni xromosomadagi joylashgan xaritalangan genning boshqa genlarga nisbatan joylashgan joyini aniqlashdan demakdir.
Malum genlarning soni qanchalik kolsa, bu tekshirishlarning natijalari shunchalik aniqroq bolchamiga bogladi. Birgina, geteroxromatinning uzaygan qismlari (sentromer va telomer uchastkalardagi) deyarli genlarni saqlamaydi va shu orqali bu boglumki, Drosophila melanogaster ning diploid tort juft xromosomalar boochilarida, XY erkaklarida), ikkinchi, uchinchi va toladi. Paydo boladi
Genom xaritasi.
Genom xaritasi bu genom tarkibidagi gen yoki boshqa komponentlarning qaysi xromosomaga tegishliligini kora klassifikatsiyalash mumkin bolumotning hajmiga kolchamli xaritalar (genomning malumotlarni saqlaydi) va katta oliq nukleotidlar ketma lumotlarni saqlaydi) borinishi
Fizikaviy xaritalarni torinishlari mavjud boliq genom uchun yoki alohida ajratilgan xromosoma uchun ham tuzish mumkin. Fizikaviy xaritalarning sitogenetik (xromosomalarda), itrantskrip-tsion (kDNK xaritalari) va makrorestriktsion xaritalar va kontig xaritalar kabi koladi.
Sitogenetik xaritalar differentsial boyalgan xromosomalarning maxsus uchastkalaridagi genlarning joylashgan olumotlarni olish imkonini beradi.
Turli organizmlar genomining xaritalanishi bolumotlar bazalari
GDB (The Genome Database) - odam genomi malumotlar bazasi bolumotlar yangilanib turiladi va nazorat qilinadi
Human Genome Research Centre xshash kolib, tarkibida gen terapiyasi haqidagi malumotlar ko odamda uchraydigan genetik kasalliklar haqidagi tolumotlarni, genlar va ular tomonidan chaqiriladigan genetik sindromlarning fenotipik namoyon bozida tutuvchi malumotlar bazasida ishlashning qulayligi shundaki malgan interfeysga ega. Evolyutsion kelib chiqishi va funktsiyasiga koxshash bop hollarda turli kolangan koladi. Sizdan umumiy machqadagi CHRNB1, CRYB1, GAA, GH, NF1, TK1, TP53 genlarining subxromosomali lokalizatsiyasini topishiz mumkin bolumotlar bazasi umumiy interfeysining korinishdagi nasliy kasalliklarga olib keluvchi yadro genlari mutatsiyalari tolumotlar har haftada yangilanadi.
1997 yil sentyabr holatiga kolumotlar mavjud bolsa, keyingi olumotlarning miqdori bir necha barobarga ortib ketdi. Bu bazaning tarkibida shuningdek, genom mutatsiyalari haqidagi malumotlar bazasi umumiy interfeysining ko Djekson laboratoriyasi (AQSh) serverida yaratilgan boyicha shu toifadagi magliq malumotlarni taqdim etadi. Bu mazlardan foydalanib turib ishlashlari mumkin bolumotlar keltiriladi.
Mouse Genome Database bioinformatsion marinishi
AceDB lumotlar bazasining tarkibida turli organizmlarning genetik xaritalari, lokuslar va allellar, gen mahsulotlari, DNK va oqsillarning ketma lgan malumotlar bazasi qishloq xosimliklarning genomlari haqidagi ma ketliklarini taqqoslanishini amalga oshiruvchi bioinformatsion dastur vositalari va basimliklarning aynan olgan malumotlar bazalari ham olumotlar bazasi umumiy interfeysining ko kelib chiqishi umumiy borinishdagi organizmlarning orasidagi oliqlikni tasvirlovchi hayot daraxtidir.
Filogenetik daraxtning yuqori qismi uchta sinfga bolum bir konoga ega bolinishini va ularning alohida evolyutsiya yorsatadi. Ildiz barcha qarab chiqilayotgan obrsatadi.
glgan. Zamonaviy evolyutsion biologlar filogenetik daraxtlardan turlarning kelib chiqishini va ularning rivojlanishini koDaraxtoyasi oddiy tuzilishdagi organizmlardan murakkab organizmlarning kelib chiqishini tushuntirish maqsadida dastlab paydo borsatib berish maqsadida foydalanishadi.
Shoxlangan daraxt lgan daraxt hisoblanadi. Shoxlangan daraxtni manalishga ega deyish mumkin, chunki tabiiy yoni ildizdan barglar tomonga shoxlangan boriflaydi. yicha shoxlangan filogenetik daraxtini ifodalaydi. Shoxlanmagan daraxt ildizga ega bolanish nuqtalarini ifodalamaydi. Shoxlangan yoki shoxlanmagan kolishi mumkin.
Tirik organizmlar filogenetik daraxtning umumiy koglinadi. Nobifurkatsion daraxt tipida esa daraxtda togglinadi. Nobifurkatsion daraxt tipida esa daraxtda tognlab kompyuter usullari va dasturlar paketi ishlab chiqilgan bop sonli qiziqarli malib bu mapchiligi fundamental ahamiyatga ega hisoblanadi. Kozgaruvchan hisoblanadi
http://fayllar.org
