Molekulyar markerlarning asosiy sinflari 1. AFLP (amplified fragment length polymorphism) - amplifikatsiya qilingan parchalar uzunligi polimorfizmi.
2. CAPS ( cleaved amplified polimorfik sequences) - tarqalgan amplifikatsiya qilingan polimorfik sekanslar.
3. DArT (diversity array technology) - xilma-xillikni o'rganish uchun Dnkchip texnologiyasi.
4. IRAP (interretrotransposon amplified polumorphism) - retrotranspozonlar orasidagi amplifikatsiya qilingan ketma-ketliklarning polimorfizmi.
5. ISSR (inter simple sequence repeats) - intermicrosatellit ketma-ketligi.
6. RAPD (tasodifiy amplified polimorfik DNK) - tasodifiy amplifikatsiya qilingan polimorfik DNK.
7. RFLP (cheklash fragment Length polymorphism) - chegara qismlari uzunligi polimorfizm.
8. SCAR (sequence characterized amplified region) - nukleotid ketma-ketligi bilan tavsiflangan amplifikatsiya qilingan maydon.
9. SNP (singlenucleotide polymorphism) - bir nukleotid polimorfizm.
10. SSAP (sequencespecific amplification polimorphism) - davomiy-o'ziga xos amplifikatsiya polimorfizmi.
11. SSCP (yagona strand conformation polumorphism) - bir zanjir DNKning konformatsiyasi polimorfizmi.
12. SSR (oddiy sequence repeats) oddiy takrorlanadigan ketma-ketlik (mikrosatellit).
Molekulyar markerlardan foydalanishning asosiy yo'nalishlari Molekulyar markerlar orasida ma'lum bir lokalizatsiya (ma'lum bir xromosomada yoki xromosomaning bir qismida yoki ma'lum bir gen yaqinida) va lokalizatsiya haqida hech narsa ma'lum bo'lmagan markerlar (odatda, bu multikus belgilar) mavjud. Ham, boshqalar ham genetik tadqiqotlar va selektsiyada qo'llaniladi. Noma'lum lokalizatsiyaga ega bo'lgan molekulyar markerlar ma'lum bir gen yoki xromosomani belgilash uchun ishlatilishi mumkin emas, lekin ular filogenetik tadqiqotlarda, o'simlik navlarini va hayvon turlarini pasportlashda muvaffaqiyatli qo'llaniladi.
