Boloniya universiteti Tashkil etilgan yili - 1088 yil Boloniya universitetini yaratish uchun zarur shart-sharoitlar Rim huquqini o'rganish an'analari qayta tiklana boshlagan 1000 yilda paydo bo'lgan. U huquqni chuqur o‘rganishga asos solganInerius, Yustinian qonunlari kodeksining birinchi o'qituvchilari va sharhlovchilaridan biri, G'arbiy Evropa Rim huquqini o'rganish asoschilaridan biri. 1088 yilda u o'zining ommaviy ma'ruzalarini ochdi - shu paytdan boshlab Boloniya universiteti tarixi o'tkazilmoqda.
Biroq, o'sha paytda so'zning zamonaviy ma'nosida universitet hali mavjud emas edi. Professorlar o'z uylarida, ijaraga olingan binolarda va ko'pincha shahar maydonlarida ma'ruzalar o'qidilar. Boloniya professorlarining mashhurligi va shuhrati o'qitishga ilmiy yondashuv va Muqaddas Rim imperatori Frederik Barbarossaning homiyligi bilan bog'liq edi. 1154 yilda u universitetni rasman tan oldi.
Butun Yevropadan bu yerga oqib kelib, oʻz korporatsiyalarini tuzdilar. Umumiy nizom bo'yicha barcha talabalar korporatsiyalarining yig'ilishi 12-asrning oxiriga kelib Boloniya universitetini tashkil etdi.
Qiziq faktlar Boloniya universitetining o'ziga xos xususiyati shundaki, u dastlab talabalar bo'ysunishi kerak bo'lgan professorlar korporatsiyasi (universitas magistrorum) sifatida emas, balki talabalar korporatsiyasi (universitas scholarium) sifatida yaratilgan. Talabalarning o'zlari rektor, yetakchi va o'qituvchilarni sayladilar.
Boloniya universitetining yana bir xususiyati shundaki, u tadqiqot uchun markaz edihuquqshunoslik. Universitetga asos solgan Rim huquqini oʻrganish, XII asrdan boshlab dasturga kiritilgan kanon huquqi universitet oʻqitishning asosiy fanlari boʻlib qoldi.
Butun 13-asr davomida bu yerda mashhur professorlar falsafa va liberal sanʼat boʻyicha maʼruzalar oʻqidilar, Boloniyada huquqdan tashqari falsafa, lotin va yunon adabiyoti, keyin esa tibbiyot kabi fanlar rivojlana boshladi.
Biroq, faqat ichida 1565 Xuddi shu yili universitet o'z binolariga ega bo'ldi va ilgari bir-biridan farq qilgan barcha maktablar va korporatsiyalar bir tom ostida birlashdi. Boloniya universitetining mulki uning kutubxonasi bo'lib, 1605 yilda professor Aldrovandi tomonidan asos solingan. Unda 250 mingga yaqin kitob va 1350 ta davriy nashr mavjud.