2.Sekonder (ikincili) quruluş: zülların praymer quruluşlarının qatlanması nəticəsində yaranan, α və β şəklində quruluşdur. Göründüyü kimi zülalların ikincili quruluşu iki fərqli şəkildə formalaşıb. Hər iki quruluş amin turşuların CO və NH qrupları arasındakı H rabitələri ilə yaranır. α quruluşda bir zəncir üzərində yer alan her dört amin turşudan biri arasında H körpüsünün qurulması ilə yaranır. Yəni bir amin turşunun CO qrupu ilə dört amin turşu sonra gelən başqa bir amin turşunun NH qrupu arasında H körpüsü yaradır. Bu baxımnan zülal molekulu heliks formasını alir. (şəkil 3.6) β-təbəqə isə eyni zəncirin qatlanması nəticəsində bir-birinə paralel uzanan zəncirlər arasında H körpülərinin olması nəticəsində meydana gelir.