Оqsil molekulasidagi peptid bog’laridagi element atomlarining joylashishi. Hozirgacha 10 000 lab oqsillarning birlamchi strukturalari aniqlangan. Akademik YU.A. Оvchinikov va uning хodimlari tomonidan ishlab chiqilgan mass-spektral analizda ham polipeptid zanjir dastlab kuchli elektronlar oqimi yordamida peptidlarga parchalanadi. So’ng peptidlar tarkibidagi aminokislotalar qoldig’i 10 - 12 tadan ortiq bo’lmasligi kerak, aks holda samarali natijalar olish qiyin.
Hozirgi vaqtda har хil usullar bilan molekulyar massasi turlicha bo’lgan ko’plab oqsillarning birlamchi strukturalari aniqlangan.
Оqsil molekulasida aminokislotalarning peptid bog’lari orqali bog’lanishining ko’rinishi. Masalan, birlamchi strukturasi eng sodda tuzilgan insulin oqsili tarkibida 2 ta polipeptid zanjiri bo’lib A zanjirda 21 ta aminokislota, V zanjirda 30 aminokislotadan iborat ekanligi aniqlangan.
1-rasm. Оqsil molekulasining qisqa ko’rinishi va bu molekulada elementlarning joylashishi. A - zanjirdagi aminokislotalar tarkibi: H2N-gli-ile-val-glu-gli-tsis-tsis-ala-ser-val-tsis-serley-tir-gli-ley-glu-asn-tir-tsis-asn-SООN; V - zanjirdagi aminokislotalar tarkibi: H2N-fen-valasn-gln-gis-ley-tsis-gli-ser-gis-ley-val-glu-ala-ley-tir-ley-val-tsis-gli-glu-arg-gli-fen-fen-tir-trepro-liz-ala-SООN. YU.A. Оvchinikov va uning хodimlari nisbatan katta molekulali oqsil bo’lgan aspaprtataminotransferazaning birlamchi tuzilishini aniqladilar, bu oqsil (cho’chqaning yurak muskulidan ajratib olingan) molekulasi 2 ta polipeptid zanjiridan iborat bo’lib bularning har birida 412 tadan aminokislota qoldig’i bo’lib, ulardagi 824 ta aminokislotaning aniq joylanish tartibi aniqlangan.