Kirish Mavzuning dolzarbligi

2.2. iProLINK bilan ishlash

PIR o'z sa'y-harakatlarini UniProtKB oqsillar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasini qayta ishlashga qaratganligi sababli, iProLINK maqsadi bibliografiya xaritalash, izohlarni olish, protein nomini aniqlash va oqsil sohalarida matn qazib olish tadqiqotlari uchun ishlatilishi mumkin bo'lgan tanlangan ma'lumotlar manbalarini taqdim etishdan iborat. ontologiyaning rivojlanishi. Protein ma'lumotlar bazasini kuratsiya qilish uchun adabiyot qazib olish usullarini qo'llash jarayoni bir nechta vazifalarni o'z ichiga oladi:

- Bibliografiya xaritasi: ma'lum bir protein yozuvini tavsiflovchi adabiyot manbalaridan (masalan, PubMed) maqolalarni aniqlash;
- Annotatsiyani chiqarish: annotatsiya turlarini turkumlash va berilgan izohni tavsiflovchi jumlalar va/yoki iboralarni ajratib olish;

- Ma'lumotlar bazasini boshqarish: olingan adabiyot ma'lumotlarini tuzilgan sintaksis, boshqariladigan lug'at va dalillar atributi bilan ma'lumotlar bazasida annotatsiyaga aylantirish.

Bu vazifalar, shuningdek, oqsil nomidagi mavjudotni tanib olish va oqsil ontologiyasini rivojlantirish mavzulari bilan bog'liq. Bibliografiya xaritasini tuzishning zaruriy sharti oqsil nomi bilan atalgan ob'ektni maqolalardan oqsil nomlarini aniqlash/identifikatsiya qilishdir. Bundan tashqari, oqsil nomenklaturasining uzoq vaqtdan beri davom etayotgan muammosi tufayli, oqsil ontologiyasi oqsil sinflarining nomlari va sinonimlarini, shuningdek ularning munosabatlarini tavsiflash orqali ob'ektni tanib olishga yordam beradi.
Bibliografiya xaritasi: Protein ma'lumotlarini oqsillarni tavsiflovchi yoki tavsiflovchi tegishli ilmiy adabiyotlar bilan bog'lash eksperimental tasdiqlangan ma'lumotlar miqdorini oshirish va oqsil izohining sifatini yaxshilash uchun juda muhimdir. So'rovingizga tegishli bibliografiyani olish uchun matn qatorini yoki noyob identifikatorni kiriting. Natijalar iProClass natijalar sahifasiga o'xshash jadvalda, lekin bibliografiyani qidirish bilan bog'liq maxsus ustunlar bilan ko'rsatilgan. Bibliografiya yozuviga havolalar, shuningdek, PubMed-dagi individual yozuvlar mavjud.
UniProtKB P13866 uchun iProLINK Bibliografiya xaritasi natijalari sahifasi