Kirish Mavzuning dolzarbligi

2108025, 16436437, 15193450 PMIDlar uchun umumiy jadval

To'liq RLIMS-P hisoboti besh bo'limni o'z ichiga oladi (quyidagi jadvalga qarang): 1- PubMed iqtibos ma'lumotlari (nashr qilingan sana, mualliflar, jurnal); 2- UniProtKB va iProClass (Wu va boshq., 2004) bilan bog'langan boy biologik va funktsional ma'lumotlarni o'z ichiga olgan protein hisobotlariga havolalar bilan xaritalangan yozuvning qo'shilishi, ID, oqsil nomi, organizm va oqsillar oilasidan iborat UniProtKB-ga PMID xaritalash; 3- UniProtKB ga nom ko'rsatish, shu jumladan, bioThesaurus-ni onlayn qidirish uchun mavhum yoki foydalanuvchi tomonidan ko'rsatilgan nomlarda ko'rsatilgan nomlardan foydalanish variantlari; 4- uchta fosforlanish ob'ektining har bir to'plami uchun RLIMS-P ekstraktsiya natijalarining tartiblangan ro'yxati bilan izoh; va 5- Protein kinazlari, fosforlangan oqsillar va fosforlangan qoldiqlar/joylarni ajratib ko'rsatish uchun turli ranglarda yorliqlangan ekstraksiyalangan ob'ektlar bilan asl abstrakt va sarlavhani ko'rsatadigan matnli dalillar. Vizual tekshirish uchun abstraktda ob'ektning har bir turi uchun rang yorlig'ini yoqish/o'chirish imkoniyati mavjud.
PMID 2108025 uchun to'liq hisobot

Shaxsni tanib olish/ontologiyani ishlab chiqish
Protein nomi bilan atalgan mavjudotni tanib olish (adabiyot matnlaridan oqsil nomlarini topish) bibliografiya xaritasini tuzish uchun zaruriy shartdir (belgilangan oqsillarni tavsiflovchi hujjatlarni aniqlash). Bu, shuningdek, bir qancha boshqa biologik adabiyotlarni qazib olish vazifalari, jumladan, adabiyotlardan oqsil izohlarini (masalan, oqsil-oqsil o'zaro ta'siri) olish uchun asosiy hisoblanadi.
BioThesaurus - bu oqsil va gen nomlarining keng qamrovli to'plamini UniProtKB protein yozuvlariga xaritalash uchun mo'ljallangan veb-ga asoslangan tizim. Hozirgi vaqtda ikki milliondan ortiq oqsillarni qamrab olgan BioThesaurus iProClass-dagi ma'lumotlar bazasining o'zaro bog'liqligiga asoslangan bir nechta onlayn resurslardan olingan 2,6 milliondan ortiq nomlardan iborat. Bu berilgan oqsil yozuvlarining sinonimik nomlarini topishga va bir nechta oqsillar tomonidan baham ko'rilgan noaniq nomlarni aniqlashga imkon beradi. Siz gen/oqsil nomini terish yoki identifikatordan foydalanib qidirishingiz mumkin.
UniProtKB P18688 uchun BioThesaurus hisoboti



Xulosa

1. Gen ham kodlovchi, ham kodlanmagan ketma-ketlikka ega. Kodlamaydigan ketma-ketliklar oqsil sintezida ishtirok etmaydi. Ular intronlardir.

2. Kodlash ketma -ketligi oqsilning genetik kodiga ega. Ular ekzonlar. Umuman olganda, bu intronlar va ekstronlar o‘rtasidagi asosiy farq.
3. Tabiiyki bunday ekzon va intron qismi D N K qo‘sh qavat
zanjirida bolgani sababli transkri psiya paytida ular iRNK zanjiriga o‘tadi.
4.Intronlar splaysing jarajoni ta’sirida yo‘qilib ketadi.
5.Gen klasterlari - bu xromosomaning ma’lum hududlarida (lokuslarida) joylashgan tegishli funktsiyalarga ega bo‘lgan turli xil strukturaviy genlar guruhlari. Klasterlar ko‘pincha xromosomada takrorlanish shaklida bo‘ladi. Masalan, giston genlari klasteri inson genomida 10-20 marta takrorlanib, takroriy tandem guruhini hosil qiladi.
6. iRNK sintezi transkripsiyaning initsiatsiyaqismidan boshlanadi. Bu
sintezlanishi lozim bo‘lgan gen oldidagi promotor qismdir.
7. Promotor 80 nukleotidlar juftligidan tashkil topgan.
8. Promotordagi nukleotidlar izchilligida AT juftligi tez-tez takrorlanganligi sababli u TATA izchilligi deb ham ataladi.