2-xromosoma insonning ikkinchi eng katta xromosomasidir va inson genomining atigi 10% ni tashkil qiladi. Bu submetasentrik xromosomadir, chunki sentromera o'rtada emas, balki markazdan biroz siljib joylashgan. Odam 2-xromosomasidagi genlar shimpanze va boshqa maymunlarda, lekin ikki xil xromosomada joylashgan boʻlib, bu odam 2-xromosomasi primatlar evolyutsiyasi jarayonida ikkita kichikroq xromosomalarning birlashishi natijasida yaratilganligini koʻrsatadi. Shunday qilib, maymunlarda 23 juft odam xromosomasidan farqli o'laroq, 24 juft xromosoma mavjud. 2-xromosoma 50 kb inson
genomidagi GC juftlarining ko'p qismini o'z ichiga oladi (GC juftlari tarkibi taxminan 66%), ammo butun xromosoma bo'yicha o'rtacha genomik o'rtacha 41% ga yaqin. 1-xromosoma bilan solishtirganda, 2-xromosoma kamroq gen zichligiga ega (har Mb uchun 7 gen).
Hajmi: 200 Mb (million tayanch juft) Taxminan. yo'q. genlar: 1300
3-xromosoma katta va metasentrik, ammo 1-xromosomadan kichikroq (tsentromera taxminan o'rtada va qo'llar uzunligi taxminan teng). Bu xromosoma butun genomning taxminan 7% ni tashkil qiladi. U genetik zichlikka, GC juftlarining tarkibiga va inson genomik o'rtacha qiymatiga juda yaqin bo'lgan takrorlanuvchi ketma-ketlikka ega.
4-xromosoma katta submetasentrik xromosomadir (tsentromera markazlanmagan). 2-xromosomadan farqli o'laroq, sentromera markazdan sezilarli darajada siljiydi, shuning uchun qo'llar turli uzunlikda bo'ladi. 4-xromosoma nisbatan past gen zichligiga ega (har bir Mb uchun 6 gen, genomik o'rtacha 9-10 gen) va past o'rtacha GC juftligi (38%). 4-xromosomaning 18% ga yaqini noma’lum funksiyaga ega bo‘lgan katta DNK segmentlaridan iborat. 4-xromosomada bir nechta CpG orollari
mavjud. 4-xromosomaning qisqa bo'lagining yo'q qilinishi Volf-Hirshhorn sindromi deb nomlanuvchi tug'ma buzilish bilan bog'liq.
Hajmi: 181 Mb (million tayanch juft)Taxminan. yo'q. genlar: 1100
5-xromosoma submetasentrik (tsentromera markazlanmagan) va hajmi va tarkibi boʻyicha 4-xromosomaga juda oʻxshaydi. U 4-xromosomaga qaraganda bir oz yuqoriroq GC juftligi va gen zichligiga ega, ammo bu qiymatlar genomik oʻrtacha qiymatdan past. 5-xromosomaning qisqa qo'lini yo'q qilish Cri-du-chat sindromi deb nomlanuvchi konjenital kasallik bilan bog'liq. Uzun a'zoda tez-tez rekombinatsiyaga duchor bo'lgan katta teskari va takrorlangan segment mavjud.
