ƏDƏBİYYAT
1. Г.Б. Абдуллаев, Р. Прохоров и др. ГВГ СО
2
–лазера в кристаллах GaSe. Квантовая электроника, 1989, т.16, №4, с.757-763.
2. Kenmochi A., Tanabea Т., Oyamaa Y., Suto K., Nishizawa J.-i. Terahertz wave generation from GaSe crystals and effects of
crystallinity// J. Phys. Chem. Sol. -2008. -Vol. 69. № 2-3. - P. 605-607.
3. Березной С.А. ГВГ при накачке кристаллов излучением импульсного лазера на длине волны 10,6 мкм. Известия Вузов,
физика, 2010, т.53, №9, с. 65-70.
HERPES VİRUSU MOLEKULUNUN STRUKTUR TƏŞKİLİ
Yaşar ABBASOV
Bakı Dövlət Universiteti
yashar-abbas@mail.ru
AZƏRBAYCAN
Təbii peptidlərin və zülalların üçölçülü strukturunu yaxud fəza quruluşunu bilmək və onların bu quruluşunun əmələ
gəlməsi prinsiplərini başa düşmək müasir dövrün aktual mövzularından sayılır.
Təbii peptid və zülalların fəza quruluşunu öyrənməklə onların çoxsaylı bioloji funksiyalarını izah etmək olar. Bu
zülalların tədqiqi zülalların sintetik analoqlarını almağa imkan verir. Peptidlərin müxtəlif bioloji funksiyaları onların
üçölçülü quruluşundan asılıdır. Peptidlərin fəza quruluşuna digər molekullar da təsir edə bilirlər. Məhz bu da peptidlərin
fəza quruluşlarının dəyişməsinə səbəb olur. Belə mürəkkəb molekulların fəza quruluşunu və onların konformasiya
imkanlarını öyrənmək onların canlı hüceyrə və orqanizmdəki funksiyaların mexanizmini izah etməyə imkan verir.
Peptid molekullarının yüksək spesifikliyə və aşağı konsentrasiyalarda belə təsir etmək qabiliyyətinə malikdir. Bu xassə
reseptorun hissəsinə uyğun liqandın fəza quruluşundan daha doğrusu strukturundan asılıdır. Peptid molekullarının struktur
problemi molekulyar biofizika və biotexnologiyanın əsas məsələlərindən biridir. Bu molekullar arasında kimyəvi quruluşu
öyrənməklə onların funksiyalarını bilmək olur. Çoxlu sayda eksperimental təcrübələr və nəzəri məlumatlar göstərir ki,
peptid molekulları stabil konformasiyalara malikdir.
Tyr-Ala-Gly-Ala-Val-Val-Asn-Asp-Leu molekulu sintez edilmişdir və o Herpes virusu ribonukleotidreduktaza
molekulunun C-tərəf hissəsinin 329-337 amin turşu ardıcıllığına uyğun gəlir. Molekulun bir sıra sintetik analoqları sintez
edilmiş və onların bioloji fəallığı təyin edilmişdir. Göstərilmişdir ki, 333-337 amin turşu ardıcıllığında edilən dəyişikliklər
molekulun bioloji fəllığını iki dəfədən çox azaldır. Molekulun bioloji fəallığında tirozinin yan zənciri mühüm rol oynayır.
Nanopeptid molekulun fəza quruluşu onu fraqmentlərə ayırmaqla öyrənilmişdir. Ilk mərhələdə uyğun amin turşularının
aşağı enerjili konformasiyaları müəyyən olunmuş, Tyr 329-Val 333 pentapeptid fraqmentinin konformasiya imkanları
öyrənilmişdir. Hesablamalar göstərmişdirki konformasiyaların, əsas zəncirin formalarının və şeyplarin enerjilərinə görə
kəskin diferensiasiyası baş verir. 0-5 kkal/mol enerji intervalında 13 şeypə mənsub əsas zəncirin 32 formasının 32
konformasiyası baş verir. Əsas zəncirin bütün bu formaları nanopeptid molekulun təqdiqadına nəzərə alınmışdır. Ikinci
mərhələdə uyğun nanopeptidlərin stabil konformasiyaları əsasında C-tərəf Val 333-Leu 337 pentapeptid fraqmentinin aşağı
enerjili quruluşları təyin edilmişdir. Tədqiqat göstərmişdirki əsas zəncirin formalarının və şeyplərinin enerjilərinə görə
kəskin diferensiasiyası baş verir. Verilmiş ardıcıllıq üçün mümkün olan əsas zəncirin 105 formasından 0-5 kkal/mol enerji
intervalına əsas zəncirin 34 forması düşür. Nanopeptid molekulun fəza quruluşu N- və C-tərəf pentapeptid fraqmentlərinin
aşağı enerjili quruluşları əsasında tədqiq edilmişdir. Ilk mərhələdə 389 konformasiya hesablanmış sonra bəzi yan zəncirlərin
vəziyyətləri araşdırılmışdır.
Tədqiqatların nəticələri göstərmişdirki konformasiyaların, əsas zəncirin formalarının və şeyplərin enerjilərə görə
kəskin differensiyasiyası baş verir. Molelulun fəza quruluşu nisbi enerjilərin 0-7 kkal/mol enerji intervalına düşən əsas
zəncirin 26 forması ilə təsvir oluna bilər.
|