CƏMİ: 29
qrup
1770
1823
püter proqramlarının vasitəsi ilə cüt-cüt (növdaxili
və növlərarası) müqayisə olunmuş və tam uzunluqlu
oxşarlıq dərəcəsi 90%-də yüksək olan ardıcıllıq-
lardan yalnız biri götürülmüşdür. Bu yolla yuxarıda
qeyd olunan 8 növdən müvafiq surətdə 28332,
28523, 57312, 32309, 62566, 28229, 51751 və
21117 zülal ardıcıllığı, həmçinin 29 metabolik yol
və ya funksional sistem üzrə 1770 (kəsəkotu) və
1823 (düyü) gen götürülmüşdür (cədvəl 1). Bu cür
dəqiqləşdirmə («təmizləmə») əməliyyatı statistik
cəhətdən daha dəqiq, düzgün nəticə əldə etmək
məqsədi ilə aparılmışdır. Promotor analizlərində
xloroplast təyinatlı nüvə genlərinin 5’-rayonlarının
(-1020: +30; +1 ATG inisiasiya kodonuna uyğun-
dur) nukleotid ardıcıllıqları istifadə olunmuşdur.
RNT polimeraza II promotorlarının (TSS-
lərin) axtarışı TSSP-TCM kompüter proqramının
(Shahmuradov et al., 2005) vasitəsi ilə həyata
keçirilmişdir.
Zülalların lokalizasiya yerlərinin proqnoz-
laşdırılması ProtComp kompüter proqramının
(http://linux1.softberry.com/berry.phtml) köməyi
ilə aparılmışdır.
Müxtəlif növlərdən olan, ardıcıllıq və təyinat
yeri baxımından oxşar zülal/gen qruplarının axtarışı
Dostları ilə paylaş: |