Odatda urug‘lik chigitni omborxonalarda saqlash paytida uning sifati pasaya boshlaydi, bunda chigit tarkibidagi oziqa moddalarining miqdori kamayadi, sifati buziladi, oqibatda esa, dala sharoitida tez va ravon unib chiqish qobiliyati keskin pasayadi. Sifati past urug‘lik chigit ekilganda unib chiqqan nihollarning soni kam bo‘lib, kasalliklarga chidamsiz, urug‘pallalarida esa nekrotik dog‘lar uchraydi, ildiz tarmoqlari yaxshi rivojlanmagan bo‘ladi. Ularning omon qolganlaridan rivojlangan g‘o‘za o‘simliklari kamquvvat bo‘lib, hosil to‘plashda va ko‘saklar ochilishida orqada qoladi. Shuning uchun ayrim holatlarda chigitni qayta ekishga to‘g‘ri keladi. Omborxonalarda saqlash paytida yoki dalaga ekilgandan so‘ng urug‘lik chigitning sifati pasayishi va chirishining asosiy sababi chigitda mikroorganizmlar, ayniqsa zamburug‘lar rivojlanishi uchun qulay sharoit – yuqori namlik va mo‘tadil harorat mavjud bo‘lishidir. Sifati pasaygan chigit laboratoriyada tahlil qilinsa asosan qo‘yidagi zamburug‘ turlari topiladi: Fuzarium spp., Alternaria spp., Aspergillus spp., Penicillium spp., Rhizopus spp. urug‘lik chigit har xil ko‘sak chirishini qo‘zg‘atuvchi zamburug‘lar va ba’zi bakteriyalar, misol uchun gommoz bakteriyasi bilan ham zararlangan bo‘lishi mumkin.
Zamburug‘lar urug‘lik chigitni oldin to‘mtoq qismidagi xalaza (urug‘ kurtagi yadrosining qobiqqa yopishgan joyi) orqali zararlab, keyinchalik qobiqning ichki qatlamlariga va qobiq bilan murtak orasidagi bo‘shliqqa tarqaladi. Murtak nutsellus deb ataladigan yupqa to‘qima-parda bilan qoplangan bo‘lib, bu parda murtakni zararlanishdan asrash uchun xizmat qiladi. Odatda chigit o‘zining unuvchanligini yo‘qotmaguncha murtakning ichiga infeksiya kira olmaydi. Ammo ba’zi yuqorida ko‘rsatilgan mikroorganizmlar o‘zlarining metabolitlari (toksinlari) va ekstratsellyular fermentlari yordamida o‘simlik to‘qimalarini kasallantirishi va hatto halok qilishi mumkin.
Zamburug‘lar urug‘lik chigitni oldin to‘mtoq qismidagi xalaza (urug‘ kurtagi yadrosining qobiqqa yopishgan joyi) orqali zararlab, keyinchalik qobiqning ichki qatlamlariga va qobiq bilan murtak orasidagi bo‘shliqqa tarqaladi. Murtak nutsellus deb ataladigan yupqa to‘qima-parda bilan qoplangan bo‘lib, bu parda murtakni zararlanishdan asrash uchun xizmat qiladi. Odatda chigit o‘zining unuvchanligini yo‘qotmaguncha murtakning ichiga infeksiya kira olmaydi. Ammo ba’zi yuqorida ko‘rsatilgan mikroorganizmlar o‘zlarining metabolitlari (toksinlari) va ekstratsellyular fermentlari yordamida o‘simlik to‘qimalarini kasallantirishi va hatto halok qilishi mumkin.
Urug‘lik chigitning sifatini pasayishi, uni yoki urug‘lik olish uchun mo‘ljallangan paxtani omborxonalarda saqlash paytida oson aniqlanadi, chunki bu jarayonda urug‘lik chigit va paxta haroratining sezilarli darajada ko‘tarilishi va oqibatda chigit murtagida turli dog‘larning paydo bo‘lishi kuzatiladi. Odatda murtakning rangi oq yoki sarg‘ish-ok bo‘lsa, zararlanganlari och yoki to‘q qung‘ir rangga kiradi. Urug‘lik chigit va paxta nisbatan quruq joyda saqlanishi tufayli, ularning zararlanishiga deyarli faqat osmofil zamburug‘lar, asosan Aspergillus turlari sabab bo‘ladi. Boshqa zamburug‘ turlari va bakteriyalar chigitni faqat nisbiy namligi 20 % dan baland bo‘lsagina zararlashi mumkin.
