Mantarlar ya da bağırsakta bulunan diğer patojen bakteriler, bağırsakta var olmalarına rağmen dışkı kültürlerinde üremeyebilirler.
Bu durum teşhisin atlanmasına neden olur.
Bereket ki bu mikroorganizmaların kana geçen yan ürünlerini ve toksinlerini idrarda organik asit testi gibi hassas testler ile saptayabilmek mümkün olabilmektedir.
İdrar organik asit incelemelerinde saptanan mantar ve bakteri metabolitleri
Mukozal immün sistem
Antibiyotikler-bağırsak florası
Antibiyotikler kullanıldığında bağırsaktaki probiyotik bakteriler 1000 kat azalarak, 100 trilyondan, 100 milyara kadar inebilirler.
Antibiyotikler faydalı bakterileri öldürünce mantar ve mayaların üremesi de hızlanır; normalin 130 kat kadarına çıkabilirler.