Mantarlar ya da bağırsakta bulunan diğer patojen bakteriler, bağırsakta var olmalarına rağmen dışkı kültürlerinde üremeyebilirler.
Bu durum teşhisin atlanmasına neden olur.
Bereket ki bu mikroorganizmaların kana geçen yan ürünlerini ve toksinlerini idrarda organik asit testi gibi hassas testler ile saptayabilmek mümkün olabilmektedir.