Biologiya fakulteti genetika kafedrasi fan: genetika va genomika asoslari

SSAP. SSAP usuli (Sequence Specific Amplification Polimorphism) AFLP usulining modifikatsiyasi hisoblanadi. Farq ikki bosqichli PCR hisoblanadi. O'rganilayotgan namunalarning DNKlari psti va Mselning cheklovi bilan ajralib turadi, bu esa 3 " uchlari bilan parchalanadi. Keyinchalik, cheklangan DNK PstI-A msel adapterlari bilan ligatsiya qilinadi. Birinchi PCR (preamplifikatsiya) PstI - va Msel adapterlarining primerlari bilan amalga oshiriladi, ya'ni.ushbu adapterlarning cheklangan genomik DNKdagi kombinatsiyalarining barcha mumkin bo'lgan kombinatsiyasi amplifikatsiya qilinadi. Birinchi PCRDAN so'ng primerlar va adapterlar o'rtasida lokalizatsiya qilingan DNK fragmentlarini amplifikatsiya qilish mahsulotlarining katta miqdori hosil bo'ladi. PCR mahsulotlari suyultiriladi va LTR va psti yoki Msel bilan adapter har qanday primer uchun belgilangan primer bilan amalga oshiriladi, ikkinchi, qay PCR uchun ishlatiladi. Amplifikatsiya natijasida LTR va adapter o'rtasida DNK fragmenti hosil bo'ladi.
IRAP (Inter-Retrotransposon Amplified Polimorphism) - primerlar orasidagi polimeraza zanjir reaktsiyasi, ikkita yonma-yon joylashgan ltr retrotranspozonlarining qo'shimcha ketma-ketligi.
REMAP (Retrotransposon-Microsatellite Amplified Polymorphism). REMAP-birinchi arpa uchun DNK "otpechtkov" usuli sifatida tasvirlangan. PCR primer o'rtasida retrotranspozon ltr fragmentiga va oddiy mikrosatellit takrorlash (SSR primer) yonidagi primerga o'tadi. Bunday holda, retrotranspozonning amplifikatsiya qilingan qismining pozitsiyasi mikrosatellit lokusiga primer yordamida "quyon" bo'ladi. REMAP LTR-primerlarning 5' - va 3'-end LTR uchun IRAP kabi variantlarini qo'llaydi. Usulning afzalliklari nisbatan soddalik va turli retrotranspozonlar va mikrosatellitlardan (REMAP) primerlarning potentsial ko'p sonli birikmalarini o'z ichiga oladi.


XULOSA
Molekulyar marker tanadan (biologik markerlardan)yoki boshqa moddadan olingan namunadagi molekuladir. Bu tegishli manba haqida muayyan xususiyatlarini aniqlash uchun foydalanish mumkin. DNK, masalan, genetik kasalliklar va hayotning evolyutsion tarixi haqida ma'lumotni o'z ichiga olgan molekulyar belgidir. DNKning o'ziga xos joylari (genetik ko'rsatkichlar) autosomal retsessiv genetik kasalliklarni aniqlash uchun ishlatiladi mukovistsidoz , taksonomik yaqinlik (filogenetika) va identifikatsiya qilish .Bundan tashqari, hayot shakllari, ma'lum bir joyda, ularning mavjudligini dalil sifatida atrof-muhitga chislednk , shu jumladan, noyob kimyoviy moddalar to'kish uchun ma'lum. Proteinlar kabi boshqa biologik belgilar ishlatiladialzgeymer kasalligi kabi murakkab neyrodejenerativ kasalliklar uchun diagnostika testlarida. Biologik molekulyar markerlar, masalan, ekologik tadqiqotlarda ham qo'llaniladi. Muayyan hosilning genetikasini o'rganish uchun molekulyar markerlardan foydalanganda, markerlarning cheklovlari borligini unutmaslik kerak. Birinchidan, o'rganilayotgan organizmda genetik o'zgaruvchanlikni baholash kerak. Nomzod genlar yaqinida yoki ma'lum bir genomik ketma-ketlikni qanday aniqlashni tahlil qiling. Xaritalar genlar orasidagi masofani aniqlash va turlar orasidagi farqni aniqlash uchun yaratilishi mumkin. Genetik belgilar ommaviy ishlab chiqarishga kiritilishi mumkin bo'lgan yangi xususiyatlarni ishlab chiqishda yordam berishi mumkin. Ushbu yangi xususiyatlar molekulyar markerlar va xaritalar yordamida aniqlanishi mumkin. Rang kabi maxsus xususiyatlar faqat bir nechta genlar tomonidan nazorat qilinishi mumkin. Rang kabi sifatli xususiyatlar (2 genidan kam talab qilinadi) MAS (marker assisted Selection) yordamida aniqlanishi mumkin. Kerakli belgini topgach, u oilaning turli avlodlarida kuzatilishi mumkin. Belgilangan marker turli xil tug'ilish yoki turlar o'rtasida kesishishda muayyan xususiyatlarni avlodlarga etkazish umidi bilan qiziqishning muayyan xususiyatlarini kuzatishga yordam berishi mumkin.O'simlik o'ziga xos xususiyati belgilashda molekulyar ma'lumoti foydalanish bir misol, bug'doy Fusarium bosh pasayishi hisoblanadi. Fusarium bosh parchalanish don halokatli kasallik bo'lishi mumkin, lekin ba'zi navlari yoki zurriyotlarini yoki navlari kasallik chidamli bo'lishi mumkin. Ushbu qarshilik MAS (Marker Assisted Selection) va ztl (Kantitativ trait Loci) yordamida kuzatilishi mumkin bo'lgan ma'lum bir genni chiqaradi. Fenotiplar yoki TTL belgilari doirasida muayyan variantlar aniqlanadi va odatda goi (qiziqish geni) qaerda joylashganligi aniqlanadi. Xoch amalga oshirilgandan so'ng, nasl-nasabning namunasi qanday nasl-nasabni meros qilib olgan va qanday nasl-nasabga ega emasligini aniqlash uchun olinishi va baholanishi mumkin. Ushbu turdagi selektsiya selektsionerlar va fermerlar uchun yanada foydali bo'ladi, chunki u pestitsidlar, fungitsidlar va insektitsidlar sonini kamaytiradi. Goini kiritishning yana bir usuli mexanik yoki bakterial uzatishdir. Bu juda qiyin, lekin vaqt va pulni tejash mumkin.
FOYDALANILGAN ADABIYOTLAR

1. Н.В. Лебедева, Н.Н. Дроздов, Д.А. Криволуцкий Биологическое разнообразие. Учебное пособие для вузов М.: Гуманит. изд. центр ВЛАДОС, 2004. 432 с.

2.В.И. Коробкин, Л.В. Передельский Экология : учеб. для вузов / 17-е изд., доп. и перераб. - Ростов-на-Дону : Феникс, 2011. - 603 с. - (Высшее образование).
3. В.И. Василевич Альфа-разнообразие растительных сообществ и факторы его, определяющие // Биологическое разнообразие: подходы к изучению и сохранению. СПб.: ЗИН РАН, 1992. С. 162-170.
4.Э. Мэгарран Экологическое разнообразие и его измерение. М.: Мир, 1992. 181 с.
5. Н.В. Лебедева Измерение и оценка биологического разнообразия. Ч. 1. Ростов-на-Дону: УПЛ РГУ, 1997. 39 с. Ч. 2. Ростов-на-Дону: УПЛ РГУ, 1999. 41 с.
6. В.Г. Терещенко, Л.И. Терещенко, М.М. Сметанин Оценка различных индексов для выражения биологического разнообразия сообщества // Биоразнообразие: Степень таксономической изученности. М.: Наука, 1994. С. 86-98
7. Б.А. Юрцев Эколого-географическая структура биологического разнообразия и стратегия его учета и охраны // Биологическое разнообразие: подходы к изучению и сохранению. СПб.: ЗИН РАН, 1992. С. 7-21
8. Р. Примак. Основы сохранения биоразнообразия / Пер. с англ. О.С. Якименко, О.А. Зиновьевой. М.: Издательство Научного и учебно-методического центра, 2002. 256 с. 6. A.T.G‘ofurov va boshq., Genetikadan masala va mashqlar,Toshkent – 1991 y
9. Hamidov J. H., Oqilov A.T., Nishonboev K.N., Saidov T. M.,Eshonqulov A. N. Tibbiy biologiya va irsiyatdan qo‘llanma.T., Ibn Sino, 1992.
10. A. T. G‘ofurov va boshq., Genetikadan masala va mashqlar.Toshkent – 1993 yil.
11. To‘raqulov Yo. X. Tabiatda jonli molekulalar va genlar. T. Fan. 1980.12. Tarasenko N. D., Lushanova G. I. Nasl – nasab nimaligini
bilasizmi? T., Meditsina 1984.
13. Majidov N., Ikromova N. Irsiyat va zurriyod. T., Fan. 1985. . N.G.Simongulyan va boshk., Guza genetikasi, seleksiyasi va urug’chiligi. Toshkent – 1974
14. D.T.Abdukarimov va boshq., Dala ekinlari seleksiyasi,urug‘chiligi va genetika asoslari. Toshkent- 1989
15. Otaqo‘ziev S. Irsiyat nima? T., Fan 1979. Molekulyar klonlash