Deşifre (decoding) merkezi; 30S’lik küçük alt biriminde bulunur ve sadece, mRNA’daki kodonla komplementer olan tRNA’nın A bölgesine kabul edilmesini sağlar.
Peptidil transferaz merkezi; 50S’lik büyük alt biriminde bulunur ve peptid bağının oluşumunu katalizler.
Prokaryotlarda rRNA’nın 50S’lik alt ünitesi, peptidil transferaz aktivitesi ile peptid bağı oluşumunu katalizlemektedir. Peptid bağı kovalent bir bağdır ve 1. aminoasitin COOH ucu ile 2. aminoasitin amino ucu arasında, bir molekül su çıkmasıyla elde edilir.