Her ne kadar prokaryot ve ökaryotlarda protein sentez mekanizmaları benzerlik gösterse de, özellikle mRNA kalıbı üzerinde, polipeptid zinciri sentezinin başladığı pozisyonu belirleyen sinyaller gibi bazı farklar da mevcuttur.
Translasyon, mRNA’nın 5’ ucunda özel başlama bölgelerinden başlar.
Translasyon, mRNA’nın 5’ ucunda özel başlama bölgelerinden başlar.
Bu nedenle hem prokaryot hem de ökaryotlarda, 5’ terminal kısmı, kodlama yapmayan diziler içerir ve proteine çevrilmeyen (untranslated region=UTR) 5’ bölgesi olarak adlandırılır (5’-UTR).
mRNA’lar proteine çevrilmeyen 3’ UTR ile sonlanırlar.
Ökaryot mRNA’ları genellikle tek bir polipeptid zinciri kodlar, ancak prokaryotik mRNA’ları farklı başlama bölgelerinden sentezlenen bir çok polipeptid kodlar.