Zaif nokovalent aloqalar: Substratlar faol joy bilan kuchsiz kovalent aloqalar orqali bog'lanadi, bu esa ferment-substrat kompleksining kerak bo'lganda hosil bo'lishini va dissotsiatsiyalanishini ta'minlaydi.
Xususiyat: Fermentlar o'zlarining funktsiyalarida, birinchi navbatda, ularning faol joylarining mavjudligi va xususiyatlari tufayli o'ziga xoslik ko'rsatadi.
Oddiy aminokislotalar: Faol joylarda tez-tez topilgan aminokislotalarga serin, aspartat, histidin, sistein, lizin, arginin, glutamat va tirozin kiradi. Ayniqsa, serin tez-tez uchraydi.
Ferment-substrat kompleksining hosil bo'lishi: Substratlar faol joyda ferment bilan bog'lanib, ferment-substrat kompleksini (ES) hosil qiladi. Katalizdan so'ng mahsulot (P) chiqariladi va ferment qayta foydalanish uchun mavjud.
Faol joyni tushunish fermentlar tomonidan katalizlangan reaktsiyalarning o'ziga xosligi, funksionalligi va samaradorligini tushunish uchun juda muhimdir.
Fermentning o'ziga xosligi
Fermentning o'ziga xosligi fermentlarni kimyoviy katalizatorlardan ajratib turadigan asosiy xususiyatdir. Fermentlar o'z harakatlarida ajoyib darajada o'ziga xoslikni namoyish etadilar, bu ularga biologik tizimlar ichida juda selektiv va aniq funktsiyalarni bajarishga imkon beradi. Ushbu o'ziga xoslikni uch xil turga bo'lish mumkin: stereospesifiklik, reaktsiyaning o'ziga xosligi va substratning o'ziga xosligi
Streospetsifiklik
Stereospesifiklik (optik o'ziga xoslik):
Stereoizomerlar bir xil molekulyar formulaga ega, ammo tuzilish konfiguratsiyasi har xil bo'lgan birikmalardir.
Fermentlar faqat bitta stereoizomerga ta'sir qilish orqali stereospesifiklikni namoyon qiladi.
Misollar quyidagilardan iborat:
L- va D-aminokislotalarga ta'sir qiluvchi L-aminokislota oksidaza va D-aminokislota oksidazasi.
D-geksozalarga ta'sir qiluvchi geksokinaza.
D-glyukozaga maxsus ta'sir ko'rsatadigan glyukokinaza.
Amilaza, ajraladigan α- glikozid aloqalari.
Tsellyulaza, parchalanadi β- glikozid aloqalari.
Stereo o'ziga xoslik substrat molekulasining o'ziga xos hududlarini ferment yuzasidagi tegishli hududlarga qo'shimcha ravishda bog'lash bilan bog'liq.
Fermentlar sinfi bo'lgan izomerazalar stereospesifiklik ko'rsatmaydi, chunki ular izomerlarni o'zaro aylantirishda ishtirok etadilar.