MATERİAL VƏ METODLAR
Analiz üçün nüvə genomu tam yaxud qaralama
variantında oxunmuş 8 bitkinin - birləpəli düyü
(Oryza sativa japonica; 12 xromosom; NCBI:
NC_008394 - Chr1, NC_008395 - Chr2,
NC_008396 - Chr3, NC_008397 - Chr4,
NC_008398 - Chr5, NC_008399 - Chr6,
NC_008400 - Chr7, NC_008401 - Chr8,
NC_008402 - Chr9, NC_008403 - Chr10,
NC_008404 - Chr11, NC_008405 - Chr12), kalış
(Sorghum bicolor; 20 xromosom) və qarğıdalı (Zea
mays; 10 xromosom; http://ftp.maizegdb.org/Maize
GDB/FTP/maize_proteome/proteome.fasta), ikilə-
pəli kəsəkotu (Arabidopsis thaliana; 5 xromosom),
qara yoncanın (Medicago truncatula; 8 xromosom;
http://jcvi.org/medicago/index.php), qovaq ağacı
(Populus trichocarpa; 19 xromosom ftp://ftp.ncbi.
nlm.nih.gov/genomes/Populus_trichocarpa/), soya
(Glycine max; 20 xromosom; ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.
gov/genomes/Glycine_max/) və şərab üzümünün
(Vitis vinifera; 19 xromosom; ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.
gov/genomes/Vitis_vinifera/) müvafiq surətdə
28392, 29448, 63540, 35176, 64123, 28504, 55787
və 21764 məlum yaxud güman olunan zülal ardıcıl-
lıqları, həmçinin kəsəkotu və düyü bitkilərinin 29
müxtəlif metabolik yol və/ya funksional kompleks
ilə bağlı, xloroplast təyinatlı zülal kodlaşdıran nüvə
genləri (müvafiq surətdə 1779 və 1837 gen) götü-
rülmüşdür (http://chloroplast.net/index.html; cədvəl
1). Həmin genlərin məhz xloroplast təyinatlı olma-
sı, yəni onların kodlaşdırdıqları zülalların sintez
olunduqdan sonra xloroplasta daşınması aşağıdakı
meyarlardan biri və ya bir neçəsi əsasında müəy-
yənləşdirilmişdir:
Dostları ilə paylaş: |