1. Prostetik qruplar: üzvi birləşmələdir və bunlar apoenzimə möhkəm bağlıdırlar. Bu möhkəm bağlı olan molekullar adeten aktiv mərkəzdə olur və kataliz funksiyası daşıyırlar. Məsələn, flavin və hem kofaktorları əsasən redoks təsirində olurlar.
2. Koenzimlər: bunlarda üzvi birləşmələrdir lakin bunların apoenzimlə birləşmələri daimi deyil. Koenzimlər kimyəvi qrupları bir fermentdən o birisinə daşıyan kiçik üzvi molekullardır. Vitaminlər, riboflavin, tiamin, fol turşusu kimi üzvi birləşmələr bu qrupun üzvləridir. Daşınan kimyəvi qruplara misal olaraq NAD tərəfindən daşınan hidrogen ionu, koenzim A tərəfindən daşınan asetil qrupu, fol turşusu tərəfindən daşınan formil, metanil və ya metil qrupları və S-adenozilmetiyonin tərəfindən daşınan metil qrupu göstərilə bilər.
