I bob asosiy qism

1.6 Strukturaviy proteomika
Biologiyaning eng yorqin xususiyati xilma-xillikdir. U biologik tashkilotning barcha darajalarida (biologik turlar, morfologiya, molekulalarning kimyoviy tuzilishi, tartibga solish jarayonlari tarmog'i va boshqalar) ko'rinadi. Bu to'liq oqsillarga tegishli. Ularning strukturaviy xilma-xilligi ko'lami hali to'liq yoritilgan emas. Bitta oqsildagi aminokislotalar qoldiqlari soni ikkitadan (peptid bog'lanishga ega bo'lgan minimal tuzilish) o'n minglabgacha bo'lishi mumkinligini aytish kifoya, va inson titin oqsili 34 350 ta aminokislotalar qoldiqlarini o'z ichiga oladi va bugungi kunda rekordchi hisoblanadi. barcha ma'lum bo'lgan oqsil molekulalarining eng kattasi. Proteoma haqida ma'lumot olish uchun uni birinchi navbatda boshqa molekulalardan ajratib olish va tozalash kerak. Butun proteomada (ya'ni butun organizmda) oqsillar soni juda ko'p bo'lganligi sababli, odatda organizmning faqat bir qismi (uning organi yoki to'qimasi) olinadi va oqsil komponenti turli usullar bilan ajratiladi. Proteinlarni o'rganishning deyarli 200 yillik tarixida oqsillarni ajratish uchun oddiy tuz cho'kmasidan tortib, ushbu moddalarning turli xil fizik-kimyoviy xususiyatlarini hisobga oladigan zamonaviy murakkab usullargacha ko'plab usullar ishlab chiqilgan. Individual oqsilning sof qismini olingandan so'ng uning kimyoviy tuzilishi aniqlanadi.
Oqsillarning bioinformatikasi. Ko'p sonli turli xil oqsillarning mavjudligi ular haqida ma'lum bo'lgan barcha ma'lumotlar kiritiladigan ma'lumotlar massivlarini - ma'lumotlar bazalarini (yoki banklarini) yaratish zaruratini keltirib chiqardi. Hozirgi vaqtda Internetda hamma uchun mavjud bo'lgan ko'plab umumiy va maxsus ma'lumotlar bazalari mavjud. Umumiy ma'lumotlar bazalari tirik organizmlarning barcha ma'lum oqsillari haqida ma'lumotni o'z ichiga oladi, ya'ni. barcha tirik mavjudotlarning global proteomi haqida. Bunday ma'lumotlar bazasiga SwissProt-TrEMBL (Shveytsariya-Germaniya) misol bo'la oladi, u bugungi kunda analitik usullar bilan aniqlangan 200 000 ga yaqin oqsillarning tuzilmalarini va nukleotidlar ketma-ketligidan tarjima qilish natijasida aniqlangan yana 2 millionga yaqin tuzilmalarni o'z ichiga oladi. Shaklda. 8 va 9 aminokislotalar qoldiqlarining har bir ma'lum soni uchun ma'lum bo'lgan mavjud oqsillar sonini ko'rsatadi. Ushbu uchastkalardagi abscissa o'qlari 2000 ta qoldiq bilan cheklangan, lekin yuqorida aytib o'tilganidek, tez-tez bo'lmasa-da, sezilarli darajada kattaroq molekulalar ham mavjud. Raqamlarda keltirilgan ma'lumotlardan ko'rinib turibdiki, eng ko'p miqdordagi oqsillar bir necha yuzlab aminokislotalar qoldiqlarini o'z ichiga oladi. Bularga fermentlar va boshqa juda harakatchan molekulalar kiradi. Kattaroq oqsillar orasida qo'llab-quvvatlovchi yoki himoya funktsiyalarini bajaradigan, biologik tuzilmalarni bir-biriga bog'lab turadigan va ularga kuch beradigan ko'plar bor.