110
Inżynieria genetyczna operuje na cząsteczkach kwasów nukleinowych.
Nie ma możliwości, aby dokonywać pożądanych zmian w bezpośredni
sposób, używa się więc jako narzędzi enzymów i szczególnych rodzajów
DNA bakteryjnego czy wirusowego.
W celu obróbki materiału genetycznego, np. konkretnego genu, należy
przygotować dużą jego ilość. W tym celu wykorzystuje się techniki
klonowania. W tym celu przy użyciu specyficznych enzymów restryktaz
wycina się interesujący gen z cząsteczki DNA. Restryktazy przecinają
wiązania fosfodiestrowe w okolicy sekwencji palindromowych. Dokonują
tego nie w obu niciach równolegle, ale z przesunięciem
o kilka
nukleotydów, zatem z obu stron wyciętego fragmentu DNA otrzymujemy
krótkie odcinki niesparowanej, pojedynczej nici DNA, wykazujące
tendencję do parowania się z komplementarnymi sekwencjami –
tzw. lepkie końce.
Tą samą restryktazą działa się na koliste DNA bakteryjne – tzw.
plazmid. Ulega on przecięciu w dokładnie takim samym miejscu, co
wcześniej opisana cząsteczka, ponieważ używa się takiej samej
restryktazy o specyficznym działaniu, co w przypadku wycięcia genu.
Również tu otrzymujemy lepkie końce, komplementarne z lepkimi
końcami genu. Po wprowadzeniu odcinka DNA z interesującym nas
genem w pobliże przeciętego plazmidu – komplementarne, lepkie końce
obu fragmentów DNA łączą się przy udziale ligazy. W ten sposób
otrzymujemy plazmid zawierający fragment DNA będący genem, który
chcemy skopiować w dużej ilości.
Odcinki DNA, których używa się do przenoszenia genów – takie jak
plazmidy – nazywa się
wektorami. Zrekombinowany wektor (z wbudo-
wanym genem) wprowadza się do komórki gospodarza (np. bakterii), po
czym zapewnia się mu odpowiednie warunki do namnażania się. W celu
otrzymania czystej kultury wyłącznie tych bakterii, które są nosicielami
interesującego
nas genu, można np. dodatkowo wbudować im gen
warunkujący odporność na konkretny antybiotyk. Po zadziałaniu tym
antybiotykiem na wymieszane kultury bakterii – przeżyje tylko wybrany
szczep. Dzięki namnożeniu bakterii w dużej liczbie uzyskujemy liczne
kopie interesującego nas genu.
Jako wektory używane są często również wirusy – np. bakteriofag λ,
infekujący
E. coli. Istnieją biblioteki genomowe ze zrekombinowanym
DNA bakteriofagów λ.
111
Reakcja łańcuchowej polimeryzacji pozwala na uzyskanie bardzo
licznych kopii genów. W tym celu wielokrotnie przeprowadza się
replikację wybranego fragmentu DNA, w której za każdym razem
skopiowana nić DNA jest matrycą w następnej replikacji.
Proces ten
przeprowadza się w wysokiej temperaturze, w której DNA jest
jednoniciowe ze względu na denaturację.
Hybrydyzacja kwasów nukleinowych jest techniką łączenia
jednoniciowych cząsteczek kwasów nukleinowych (DNA i/lub RNA)
w dwuniciowe hybrydy. Metoda ta wykorzystywana jest do identyfikacji
specyficznych sekwencji kwasów nukleinowych: do jednoniciowej
tzw. sondy o znanej sekwencji przyłącza się cząsteczka kwasu
nukleinowego o sekwencji komplementarnej.
Technika mikromacierzy DNA jest rozwinięciem hybrydyzacji
kwasów nukleinowych. Polega na umieszczeniu na mikromacierzy
tysięcy sond DNA różniących się nieznacznie (np. jednym nukleotydem)
od siebie. Dzięki np. znaczeniu fluorescencyjnemu, można łatwo
wychwycić te, z którymi związały się (utworzyły dwuniciowe hybrydy)
badane próbki kwasów nukleinowych. Metoda ta pozwala na szybkie
przebadanie tysięcy genów.
Przykładem bezpośredniego zastosowania inżynierii genetycznej są
terapie genowe. Skierowane są one na zwalczanie chorób, których
przyczyną są nieprawidłowe allele konkretnych genów.
Terapie genowe
zasadniczo polegają na próbie zastąpienia nieprawidłowych alleli –
prawidłowymi. Dzięki opisanym powyżej technikom, dysponujemy
prawidłowymi allelami tych genów, należy je jednak wprowadzić do
wystarczającej liczby komórek ciała pacjenta. W tym celu można pobrać
próbkę jego komórek, wprowadzić do ich DNA prawidłowy allel, po
czym wszczepić je z powrotem do tkanki, w której spełniają swą funkcję.
Jeśli jednak trzeba zadziałać na dużym obszarze (wielu tkanek) – należy
użyć wektora, który gen przeniesie do jak największej liczby komórek
in vivo. Wykorzystuje się do tego wirusy o zrekombinowanym DNA,
zawierającym pożądany gen, lecz pozbawione genów warunkujących ich
zdolność do namnażania się. Terapie takie przeprowadza się np.
w przypadku mukowiscydozy lub niedoboru deaminazy adenozyny
(S C ID / A D A – ciężki niedobór immunologiczny). Jednak najczęściej
metodę tę stosuje się w przypadku chorób nowotworowych: przenoszony
w tym przypadku gen ma spowodować śmierć komórki nowotworowej,
ale nie innych.
112
Poza terapiami genowymi, inżynieria
genetyczna jest stosowana
w medycynie jako narzędzie pozwalające na produkcję leków – przez
namnożone mikroorganizmy o zmodyfikowanym DNA. Pierwszym
lekiem wyprodukowanym w taki sposób była syntetyczna ludzka insulina,
zarejestrowana w roku 1982. Kolejnymi były m.in.: ludzki hormon
wzrostu oraz szczepionka przeciwko wirusowemu zapaleniu wątroby
typu B.
Inne, poza medycyną, dziedziny stosujące technologie inżynierii
genetycznej to przede wszystkim rolnictwo (uzyskiwanie odporności
zwierząt i roślin na choroby i warunki klimatyczne, przyspieszenie
wzrostu dzięki wprowadzeniu do DNA alleli genów warunkujących
korzystne cechy), paleontologia, historia i kryminalistyka (identyfikacja
próbek biologicznych).