Bowmanova membrána (lamina limitans anterior) se skládá z kolagenních fibril a je produkována buňkami bazální membrány epitelu, na kterou nasedá. Její tloušťka je přibližně 8 - 12 μm. Na rozdíl od epitelu nemá schopnost regenerace a při poranění se hojí jizvou.
Stroma (substancia propria) zabírá asi 90 % celkové tloušťky rohovky. Má několik funkcí, z nichž hlavním úkolem stromatu je ochranná funkce, dále určuje zakřivení rohovky. Další její vlastností je, že je vysoce transparentní. Hlavním stavebním elementem stromatu jsou kolagenová vlákna typu I, III a vzácně IV, která se skládají z jemných fibril. Ve stromatu se vyskytují keratocyty, proteoglykany, glykoproteiny, plazmatické buňky, leukocyty nebo lymfocyty. [2] Kolagenní vlákna vytvářejí lamelární uspořádání rohovky. V předním stromatu jsou lamely méně uspořádané než v zadním stromatu. Fibrily mají velmi pravidelnou tloušťku a vzdálenost mezi sebou. Díky tomu vznikla teorie mřížky, kde „stejná tloušťka a vzdálenost fibril ležící pod vlnovou délkou světla, vede k tomu, že pronikající světelné paprsky nejsou ve svém průběhu skrz rohovku ovlivňovány“. [1] Proto je rohovka transparentní. Další příčinou průhlednosti rohovky je obsah vody ve stromatu. Normální množství vody ve stromatu je kolem 80 %. Pokud se zvýší obsah vody, např. porušením funkce endotelu, dochází ke zkalení rohovky, k edému. Mukopolysacharidy, které se nacházejí v prostoru mezi fibrilami, zajišťují jejich pravidelnou vzdálenost. Jakmile dojde ke zvýšení obsahu vody ve stromatu, dochází ke zbobtnání mukopolysacharidů, tím i ke změně vzdáleností fibril, a rohovka se pak stává méně transparentní. Regenerační schopnost stromatu je velmi malá. [1]