Qafqaz Uni
ИЗ
А
Генети
ДНК, челове
вытянуть вс
ParisJaponic
этом, вся ДН
жесткие стр
самопроизво
а в виде к
информации
формирован
намотано ок
Рисуно
Структ
Å и высотой
Интересно,
происходит
уровня комп
можно полу
Несмот
транскрибир
то же время
крайней мер
второй част
зависимости
полимеразы
Таким
структуры и
ментальных
II INTER
versity
ЗУЧЕНИЕ
АРМЕЕВ Гр
ическая инфо
еческий гено
се нити ДН
a, он содерж
НК помещает
руктуры, нес
ольному свор
комплекса с
и. В основе
ние нуклеосо
коло 147 нукл
к 1 Визуализ
тура нуклеосо
й 60 Å. На д
что гистон
постоянный
пактизации -
учить набор и
тря на упаков
руемые гены
я умеренно т
ре, два механ
тичное удале
и от их мод
ы сквозь нукл
образом, пон
и динамики х
х методов, по
RNATIONA
ПРИНЦИ
МОЛ
игорий, ЛЮ
Московский
ормация, зак
ом содержит
НК. В настоя
ит более 150
тся в клеточн
сущие на се
рачиванию с
белками –
е компактиза
ом. Нуклеосо
леотидных па
зация нукле
Визуализа
омы отображ
данный моме
ный состав
обмен димер
30 нм фибри
интермедиато
вку ДНК, в кл
ы свободны от
транскрибиру
низма транск
ение гистоно
дификаций, и
еосому, что п
нимание стру
хроматина. Д
озволяющих
L SCIENTIF
ИПОВ ФОР
ЛЕКУЛЯР
ЮБИТЕЛЕВ А
й Государств
a
одированная
около 3 милл
ящее время
0 миллиардов
ное ядро, раз
ебе большой
образование
хроматина,
ации генетич
ома представл
ар или 1,67 ви
еосомы, 147 н
ация построе
жена на рисун
ент получено
нуклеосом
рами гистоно
иллы к нукле
ов нуклеосом
летке происх
т нуклеосом
уемые гены к
крипции скво
ов с ДНК. С
изменяется с
позволяет рег
уктуры и под
Для исследов
оценить энер
FIC CONFER
4
РМИРОВА
НОГО МО
Александр, Б
венный Униве
rmeev@molsi
я в виде пос
лиардов нукл
максимальн
в нуклеотидн
змером меньш
й суммарный
м компактны
основной ф
ческой инфо
ляет собой о
итка спирали
нп, ДНК и бе
ена на структ
нке 1. Белков
о более 80 ра
не постояне
ов H2A-H2B
еосомам при
м, таких как те
ходит синтез
и синтез мРН
конденсиров
озь цепочки н
Сохранение г
степень срод
гулировать тр
движности н
вания нуклео
ргию связыв
RENCE OF Y
АНИЯ НУ
ОДЕЛИРО
БЛИНОВ Ве
ерситет им. М
im.org
следовательно
леотидных па
ным по разм
ных пар, и его
ше 100 микр
й отрицатель
ых глобул. ДН
функцией кот
ормации леж
октамер белк
и ДНК.
елок отображ
туре с кодом
вое ядро нукл
азличных кри
ен, наприме
[4, 5], а при ф
соединяется
етрасомы и г
белка, которы
НК на них пр
аны на гисто
нуклеосом, о
гистонов H3-
дства ДНК к
ранскрипцию
нуклеосом яв
сом применя
ания ДНК с
YOUNG RES
18-19 A
УКЛЕОСО
ОВАНИЯ
ениамин, Ш
М.В.Ломонос
ости нуклеот
ар, что соотв
меру считает
о длина може
ометров. Мо
ьный заряд,
НК в ядре нах
торого являе
жит взаимод
ков гистонов
жены в виде
м 1KX5 PDB
леосомы обр
исталлически
ер, в активн
формировани
гистон H1. П
гексасомы [6]
ый нуждаетс
роисходит бе
онах. Было п
один из котор
-H4 имеет б
к гистонам
ю.
ляется важны
яется множес
гистонами, и
SEARCHER
April 2014, B
М МЕТОД
ШАЙТАН Але
сова
тидов в лин
ветствует дли
тся геном ре
ет достигать
олекулы ДНК
и поэтому
ходится не в
ется упаковк
действие ДН
на который
е вторичной
[1].
разует цилинд
их структур
но транскриб
ии структуры
При сборке н
]
ся в матрично
ез каких-либо
показано, что
рых подразум
большое знач
и вероятност
ым этапом н
ство разнооб
исследовать
RS
aku, Azerbai
ДАМИ
ексей
нейной молек
ине 2 метра, е
едкого расте
100 метров,
К – относител
не способн
свободном в
ка генетичес
НК с белкам
как на кату
структуры.
др диаметром
нуклеосом [1
бируемых ге
ы более высок
нуклеосом inv
ой РНК. Акти
о препятстви
о существует
мевает полно
чение, так ка
ть прохожде
на пути изуче
разных экспе
крупномасш
ijan
куле
если
ения
при
льно
ы к
виде,
ской
ми и
ушку
м 65
1-3].
енах
кого
vitro
ивно
ий, в
т, по
ое, а
ак в
ения
ения
ери-
штаб-
II INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS
5
Qafqaz University
18-19 April 2014, Baku, Azerbaijan
ные движения, а также влияние гистонных модификаций на сродство ДНК к гистонам. Такие эксперименты техни-
чески сложны и ресурсоемки. В то же время, современные суперкомпьютеры позволяют производить вычислитель-
ные эксперименты, предоставляя исследователю своеобразный «вычислительный микроскоп», позволяющий наб-
людать явления на атомистическом уровне.На текущий момент исследований были исследованы микросекундные
траектории движения нуклеосом и их интермедиатов, выявлены крупномасштабные перестройки в гистонах,
исследованы сайты посадки гистона H1.
Работа выполнена с использованием ресурсов суперкомпьютерного комплекса МГУ имени М.В. Ломоносова [7].
Список литературы
1.
Davey, C.A., et al., Solvent mediated interactions in the structure of the nucleosome core particle at 1.9 angstrom
resolution. J Mol Biol, 2002. 319(5): p. 1097-1113.
2.
Richmond, T.J., Hot papers - Crystal structure - Crystal structure of the nucleosome core particle at 2.8 angstrom
resolution by K. Luger, A.W. Mader, R.K. Richmond, D.F. Sargent, T.J. Richmond - Comments. Scientist, 1999.
13(23): p. 15-15.
3.
Vasudevan, D., E.Y.D. Chua, and C.A. Davey, Crystal Structures of Nucleosome Core Particles Containing the '601'
Strong Positioning Sequence. J Mol Biol, 2010. 403(1): p. 1-10.
4.
Thiriet, C. and J.J. Hayes, Replication-independent core histone dynamics at transcriptionally active loci in vivo.
Genes & Development, 2005. 19(6): p. 677-682.
5.
Studitsky, V.M., D.J. Clark, and G. Felsenfeld, Overcoming a Nucleosomal Barrier to Transcription. Cell, 1995. 83(1):
p. 19-27.
6.
Zlatanova, J., et al., The Nucleosome Family: Dynamic and Growing.
Structure, 2009. 17(2): p. 160-171.
7.
Воеводин Вл.В., Ж.С.А., Соболев С.И., Антонов А.С., Брызгалов П.А., Никитенко Д.А., Стефанов К.С.,
Воеводин Вад.В. , Практика суперкомпьютера "Ломоносов". Открытые системы., 2012. 7.
SiYARIİLETKENİ ÜZERİNDE ’’SPINCOATING’’ YÖNTEMİ İLE OLUŞTURULAN
Al/MEH-PPV/p-SiMETAL/POLİMER/YARI İLETKEN SCHOTTKY DİODLARIN
DİELEKTRİK ÖZELLİKLERİNİN İNCELENMESİ
Ahmet ASİMOV, Ahmet KIRSOY
Uludağ Üniversiteti
fizikasimov@gmail.com, admkirsoy@yahoo.com
TÜRKIYE
Schottky diyotlar fizik alanında teorik ve deneysel olarak önem taşıyan araştırma konularından biridir. Karakteristik-
lerinin çoğunun bilinmesi ve yapılışlarının kolay olması nedeniyle, Schottky diyotların önemi ve kullanım alanları her geçen
gün artmaktadır. [1-2]. Polimerler ile metallerin üstün özellikleri bir araya getirilerek iletkenlik özelliği taşıyan polimerlerin
elde edilmesi mümkün olmuştur. İletken bir polimerin temel özelliği polimerin omurgası (ana zincir) boyunca konjuge
(ardışık sıralanmış) çift bağların olmasıdır. Özellikle MEH-PPV polimeri fiziksel ve elektriksel özelliklerinden, kolay ve
ucuz üretiminden dolayı daha fazla önem kazanmıştır. Günümüzde polipirol, polianilin, politiyofen gibi polimer çeşitleri
daha fazla araştırılmaktadır. Polimerlerin elektrik endüstrisinde kullanımları, moleküler hareketlilik ve relaksasyon süreleri
ile ilgili dielektrik özelliklerin incelenmesi ile ilgili birçok çalışma yapılmıştır. Dielektrik sabiti (Permitivite ya da
elektriksel geçirgenlik) bir alanın etkisi altında dış elektrik bölgede ne kadar enerji saklandığını ve malzeme içerisinde ne
kadar enerji kaybolduğunu gösterir.
Bu çalışmada Al/MEH-PPV/p-Si Schottky diyotun oluşturulması için (100) doğrultusunda büyütülmüş, 380 mm kalın-
lığındaki, p-Si kristali kullanıldı. Numune hazırlama sırasında kullanılacak malzemeler bir takım kimyasal temizlemeden
geçirildi. Nümunenin ön yüzeyine spincoater cihazı ile MEH-PPV isimli iletken polimer 1200 rpm döndürme hızıyla 60 san
döndürülerek kaplandı. Sonra polimer kaplanmış ön yüzeye yaklaşık 2000 A kalınlığında %99.99 saflıkta saf Al
buharlaştırılarak Al/MEH-PPV/p-Si Schottky diyotlar oluşturuldu. (Şekil 2). Hazırlanan Schottky diyotlarının C-V ve G/ω-
V ölçümleri HP-4192A LF Empedans Analiz-metre (500 kHz ve 1000 kMHz) yardımıyla bilgisayar ile kontrol edilerek
gerçekleştirildi. Bu ölçümleri kullanarak diyodundielektrik parametrelerini bulabiliriz. Frekans değerlerinin yüksek
seçilmesiyle, düşük frekanslarda meydana gelebilecek olan ara yüzey durumların etkisi ortadan kaldırılmış oldu. Grafikten
görüldüğü gibi kapasitans ve iletkenliğin değerleri voltajın artmasıyla, artmaktadır ve bir pik vermektedir. Özellikle pikin
aşağı frekansta olduğunu görmekteyiz. Bunun başlıca sebebi frekans değeri arttıkça arayüzey halleri a.c sinyali
izleyemediklerinden dolayı, arayüzey halleri kontak kapasitesine herhangi bir katkıda bulunmazlar ve bu yüzden Sekil 1.
den de görüleceği gibi frekans arttıkça kapasite değeri azalmıştır. Al/MEH-PPV/p-Si Schottkydiyodun voltaja bağlı