3
BbvCI nukleazasi haqida ma’lumot
BbvCI,IIT tipidagi
cheklovchi endonukleaz,yetti tayanch juftlik 5'-
CCTCAGC-3' ketma-ketligini taniydi va ajratadi,bu 3-asosli,5'-o'simtalarni hosil
qiladi.BbvCI ikkita oqsil bo'linmasidan iborat bo'lib,ularning har biri bitta katalitik
joyni o'z ichiga oladi.Ikkala sayt mutatsiya natijasida
inaktivatsiya qilinishi
mumkin,natijada DNKni o'ziga xos tarzda bog'laydigan ferment variantlari paydo
bo'ladi.Bu erda biz holoenzimning labil ekanligini,R1
subbirligi past pH da
dissotsilanishini ko'rsatamiz.Bunday sharoitda R2 subunitining kristallanishi
qarama-qarshi tomonlarda joylashgan ikkita katalitik joy bilan cho'zilgan dimerni
aniqladi.
Fiziologik pH da keyingi kristallanish natijasida
har bir subunitning ikkita
nusxasidan iborat tetramer aniqlandi,ularning har birida DNK parchalanishi uchun
mos ravishda joylashtirilgan va yo'naltirilgan ikkita katalitik joyni o'z ichiga olgan
bir juft chuqur yoriqlar mavjud.Ushbu domen tashkiloti bir zanjirli oqsil
konstruksiyalari bilan yana tasdiqlandi,unda ikkita ferment bo'linmasi o'zgaruvchan
uzunlikdagi peptid bog'lovchilari orqali bog'langan.Biz DNK bilan bog'langan
kompleksni
kristallashtira
olmadik;ammo,ilgari
kristallangan
cheklash
endonukleazalarining strukturaviy o'xshashligi DNK bilan bog'langan energiya
minimallashtirilgan modelni yaratishga va maqsadni tanib olish uchun mas'ul
bo'lgan nomzod qoldiqlarini aniqlashga yordam berdi.Markaziy C:Gtayanch
juftligini tan olish uchun taxmin qilingan qoldiqlarning mutatsiyasi CCTNAGC ni
(N= har qanday asos)taniydigan va parchalaydigan o'zgartirilgan
fermentga olib
keldi.Ilgari kristallangan cheklash endonukleazlariga tizimli o'xshashlik DNK bilan
bog'langan energiyani minimallashtirilgan modelni yaratishga va maqsadni aniqlash
uchun mas'ul bo'lgan nomzod qoldiqlarini aniqlashga yordam berdi.Markaziy
C:Gtayanch juftligini tan olish uchun taxmin qilingan qoldiqlarning mutatsiyasi
CCTNAGC ni (N= har qanday asos)taniydigan va parchalaydigan o'zgartirilgan
fermentga olib keldi.Ilgari kristallangan cheklash endonukleazlariga tizimli
o'xshashlik DNK bilan bog'langan energiyani
minimallashtirilgan modelni