1 friday, april 19 Biochemistry and Molecular Biology asbmb graduate and postdoctoral travel award keynote lecture special Session

Sherwood, Z. Zhang, R. Patek, J. Vagner, T.J. Price and S. 

Boitano. Univ. of Arizona and NYU.

804. MICROARRAYS

Poster

m

on

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C242 

804.1 

Designing a unique reporter-based microarray 

sensor platform for monitoring cell signaling. 

A. Gibriel. Ahram 

Canadian Univ., Egypt.

C243 

804.2 

The next generation of nucleic acid microarrays: 

alternative, multi-stranded, plasmid and helical transitional 

DNA and RNA microarrays. 

V. Verma, C. Gagna, O. Chagin, R. 

Chhatlani, I. Ally, E. Thomas, X.F. Yang and W.C. Lambert. 

New York Inst. of Technol. and New Jersey Med. Sch., Newark.

805.  MODE OF ACTION OF BIOACTIVE NATURAL 

PRODUCTS

Poster

m

on

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C244 

805.1 

Induction of hepatic glutathione synthesis via 

alterations in sulfur amino acid metabolism in mice treated with 

silymarin acutely. 

D.Y. Kwon, C.W. Ahn, Y.J. Choi and Y.C. 

Kim. Col. of Pharm., Seoul Natl. Univ.

MONDAY BIOCHEMISTRY

248

C245 

805.2 

Inhibition of hepatitis B virus gene expression 

and replication by arylnaphthalene lignan analogues HE-145-

111. 

S.F. Yeh and C.H. Lin. Natl. Yang-Ming Univ., Taiwan and 

Inst. of Chem., Acad. Sinica, Taipei.

C246 

805.3 

Antibacterial activity and cytotoxicity of Aster 

sphathulifolius maxim. against oral-bacteria and oral-cancer 

cell lines. 

J-H. Lee and G-H. Kim. Duksung Women’s Univ., 

South Korea.

C247 

805.4 

Determination of protocatechuic acid from 

Rubus coreanus fruits and their inhibitory effects of triglyceride 

accumulation on 3T3-L1 cells. 

H-S. Park and G-H. Kim. 

Duksung Women’s Univ., South Korea.

C248 

805.5 

Induction of cell cycle arrest and apoptosis 

by an extract created from California walnuts (Juglans sp.) in 

MDA-MB-231, MCf7, and HeLa cells. 

J.B. White, A. Pham, V. 

Le, J. Kim and R. Okuda. San Jose State Univ.

C249 

805.6 

Novel biodegradable microporous bacterial 

cellulose scaffolds engineered for bone and cartilage 

regeneration. 

P. Favi, R. Benson, N. Neilsen, C. Ehinger and 

M. Dhar. Univ. of Tennessee, Knoxville.

C250 

805.7 

Chemical biology analysis of borrelidin 

identifies an essential translational enzyme as a pro-angiogenic 

modulator of tumor progression in multiple human cancers. 

C.S. Francklyn, K. Lounsbury, T. Williams and A. Mirando. 

Univ. of Vermont.

806.  NEW TARGETS FOR DRUG DISCOVERY: 

ANTIBACTERIALS

Poster

m

on

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C251 

806.1 

Targeting lsr2/dna complexation for 

dysregulation of gene expression in mycobacterium 

tuberculosis. 

L. Pinault, J. Han, C. Kang, J. Franco and 

D.R. Ronning. Univ. of Toledo, Myongji Univ., South Korea, 

California State Univ. Stanislaus and Merrimack Col.

C252 

806.2 

Synthesis and anti-mycobacterial 

characterization of ester protected ethambutol derivatives. 

D.C. 

Stephens and R.J. Johnson. Butler Univ.

C253 

806.3 

Design and synthesis of a dual-ligand inhibitor 

for acetyl-CoA carboxylase. 

M.A. Silvers, C.M. Taylor and G.L. 

Waldrop. LSU.

C254 

806.4 

Phenotype studies of Orf135 CTPase from 

E. coli and complementation studies with RV1160 from M. 

tuberculosis. 

K.S. Gerien, J.G. Thomson, S.J. Denial and S.F. 

O’Handley. Rochester Inst. of Technol.

C255 

806.5 

ApaH diadenosine polyphosphatase from 

Legionella pneumophila. 

M.P. Madaio, A. Rizo Patron, J.G. 

Thomson, A. Baltus, M. Edelstein, D. Zhuang, P. Edelstein 

and S. O’Handley. Rochester Inst. of Technol. and Univ. of 

Pennsylvania Sch. of Med.

C256 

806.6 

A phosphoglycolate phosphatase from 

Saccharomyces cerevisiae. 

K.J. Blake, A.U. Gehret, R. Puts, 

A. Rizo Patron, S. Ramirez, A. Strassner, A. Lof, B. Wahler, 

M. Walling and S.F. O’Handley. Rochester Inst. of Technol.

C257 

806.7 

Isolation of potential new SPase inhibitors 

producing strains by soft agar overlay assay method. 

S. 

Ahmed, P.A. Smith, T.C. Roberts and P.R. Jensen. UCSD 

and RQx Pharmaceuts., La Jolla.

C258 

806.8 

Diadenosine phosphatases of the Nudix 

hydrolase superfamily. 

T. DiDonato, K. Williford, J. Thomson, 

J. Ramos, D. Sheibley, S. Glick and S. O’Handley. Rochester 

Inst. of Technol.

C259 

806.9 

AraL from B. subtilis is a sugar phosphatase 

and member of the nitrophenyl phosphatase family of the HAD 

superfamily. 

S.F. O’Handley and J.K. Hill. Rochester Inst. of 

Technol.

807.  NEW TARGETS FOR DRUG DISCOVERY: 

NUCLEAR HORMONE RECEPTORS

Poster

m

on

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C260 

807.1 

A novel splicing variant of rat pregnone X 

receptor down regulates CYP gene expression. 

M. Sakai, S. 

Nakahara,  S. Yamada, Y.  Kurata, Y. Yamashita,  K.  Hayashi 

and K. Tsutsumi. Fac. of Hlth. Sci., Hokkaido Univ. and 

Hokkaido Univ. Sch. of Med., Japan.

808.  PHOTOCHEMICAL SENSORS

Poster

m

on

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C261 

808.1 

Protein scaffolds for light-activated delivery of 

toxic iron to cancer cells. 

E.N. Boice and D.M. Kurtz. Univ. of 

Texas at San Antonio.

809.  POLYPHARMACOLOGY AND DRUG 

REPURPOSING

Poster

m

on

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C262 

809.1 

Synthesis of multivalent ligands designed to 

disrupt HIV-1 Tat-peptide/TAR-RNA interactions. 

S.L. Scott, J. 

Allgaier and M. Kosinski-Collins. Brandeis Univ.

810.  PROTEOMICS AND BIOINFORMATICS

Poster

m

on

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C263 

810.1 

SELDI-TOF MS combined with magnetic 

beads for detecting serum protein biomarkers for diagnosis of 

active tuberculosis. 

J. Liu, L. Wei, T. Jiang, X. Zhang, D. Xu, 

C. Wang, Z. Li, J. Zhong and J-C. Li. Zhejiang Univ. and The 

Sixth Hosp. of Shaoxing, China.

BIOCHEMISTRY MONDAY

249

M

O

N

C264 

810.2 

Fast fix, fish and filter, 4Facts strategy to 

identify real time protein-protein interactions in situ with few 

false positives. 

L. Zhu, M. Li, L. Jia, Z. Guo, L. Wei and Y. Gao. 

Peking Union Med. Col.

C265 

810.3 

Proteomic study of reversible cysteine oxidation 

in catalase overexpressing mice on a Western diet. 

C. Yao,  J.B. 

Behring, V. Humar, D.A. Siwik, M.E. McComb, C.E. Costello, 

W.S. Colucci, R.A. Cohen and M.M. Bachschmid. Boston 

Univ. Sch. of Med.

C266 

810.4 

Differential protein analysis of developing 

mouse cochlea using label-free quantitative mass spectrometry. 

L. Darville and B. Sokolowski. Univ. of South Florida Morsani 

Col. of Med.

C267 

810.5 

Analysis of differentially expressed proteins 

in Escherichia coli when exposed to L-telluromethionine. 

K.M. 

Broderick, S. Taylor and J.O. Boles. Tennessee Technol. Univ.

C268 

810.6 

Biomarkers of acute rejection in renal 

transplant: a proteomic approach. 

J.D. Perez, M.M. Sakata, 

T.S. Cunha, D.Y. Arita, J.A. Colucci, H. Tedesco Silva, Jr., 

J.O.M. Pestana and D.E. Casarini. Fed. Univ. of São Paulo 

and Hosp. São Paulo.

C269 

810.7 

A simplistic bioinformatics approach to clade 

identification in Chlorella-like green algae. 

T.L. Jensen, R.M. 

Stubbendieck, A.L. Barnes, K.M. Wichers, B.J. Keller, S.A. 

Larson, N.S. Patel and V.H. Freeman. Univ. of Nebraska-

Lincoln.

C270 

810.8 

An interactive and probabilistic strategy for 

visualizing linear biological sequence motifs. 

D. Schwartz, J.P. 

O’Shea, S.A. Quader, A.C. Mingir, G.M. Church and M.F. 

Chou. Univ. of Connecticut and Harvard Med. Sch.

C271 

810.9 

Quantum analysis/improvement of 

antipsychotic’s docking results. 

G. Nunes, G. Zanatta, E.M. 

Bezerra, R.F. da Costa, V.N. Freire and C.C. Gottfried. Univ. 

at Buffalo and Fed. Univ. of Rio Grande do Sul and Fed. Univ. of 

Ceará, Brazil.

C272 

810.10  Moonlighting proteins. C. Jeffery, M. Mani, V. 

Amblee, C. Chen and Z. Zhang. Univ. of Illinois at Chicago.

C273 

810.11  Resolving the bacterial selenomethionyl 

proteome for differential expression proteomic analysis. 

S.J. 

Taylor, K.M. Broderick and J. Boles. Tennessee Technol. 

Univ.

C274 

810.12  The molecular mechanism of histone 

deacetylase inhibitor PCI-24781 mediating anti-tumor activity 

in neuroblastoma cells. 

Q.L. Zhan and S.M. Ngai. The Chinese 

Univ. of Hong Kong.

811.  COMPUTATIONAL TOOLS FOR ASSIGNING 

ENZYMATIC FUNCTIONS

Poster

m

on

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C275 

811.1 

Development and testing of a systematic 

approach for computational enzyme function determination. 

G. 

Dodge, E.N. Arroyo, H. Bernstein and P. Craig. Rochester 

Inst. of Technol. and Dowling Col., Oakdale, NY.

C276 

811.2 

Automated generation of motif templates in 

protein function prediction software ProMOL. 

M. Osipovitch, 

H.J. Bernstein and P.A. Craig. Rochester Inst. of Technol. and 

Dowling Col., NY.

C277 

811.3 

Thermodynamics of cellulose solvation in novel 

solvent mixtures. 

R. Das and J-W. Chu. Univ. of California, 

Berkeley.

C278 

811.4 

Using the Structurally Aligned Local Sites 

of Activity computational method to determine biochemical 

function of structural genomics proteins. 

J.S. Lee and M.J. 

Ondrechen. Northeastern Univ.

C279 

811.5 

Computational prediction and validation of 

putative ketosteroid isomerase structural genomics proteins. 

N.A. DeLateur, S. Somarowthu, C. Shea, M. Naniong, M.J. 

Ondrechen and P.J. Beuning. Northeastern Univ.

812.  FUNCTIONAL PROTEOMIC STUDIES

Poster

m

on

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C280 

812.1 

Quantitative proteomics reveals regulation of 

KPNA2 and its potential novel cargo proteins in non-small cell 

lung cancer. 

C-J. Yu, C-I. Wang, K-Y. Chien, C-L. Wang, H-P. 

Liu, C-C. Cheng, Y-S. Chang and J-S. Yu. Chang Gung Univ. 

and Chang Gung Mem. Hosp., Taiwan.

813.  LIPID SIGNALING IN HEALTH AND DISEASE

Poster

m

on

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C281 

813.1 

Stearoyl CoA desaturase 1 and seipin: 

important players in hepatic steatosis? 

L. Amine, S. Lalonde, 

S. Rial, X. Prieur, P. Costet, J. Magré and C. Mounier. Univ. of 

Quebec at Montreal and UMR-S 1087, Nantes.

C282 

813.2 

Overexpression of lipogenic genes in the 

heart distinguishes physiologic from pathologic left ventricle 

hypertrophy. 

P. Dobrzyn, A. Pyrkowska, M. Duda, M. 

Maczewski, T. Bednarski, J. Langfort and D. Agnieszka. 

Nencki Inst. of Exptl. Biol., Postgrad. Med. Sch. and Mossakowski 

Med. Res. Ctr., Warsaw.

C283 

813.3 

The pro-cysteine drug, L-2-oxothiazolidine-

4-carboxylic acid is a novel inducer of nSMase2 mRNA and 

protein expression in the liver. 

G. Deevska, C. Karakashian, 

M. Sunkara, B. Peppers, A. Morris and M. Nikolova-

Karakashian. Univ. of Kentucky.

C284 

813.4 

Aspirin delays skin wound healing by reducing 

the production of 12-hydroxyheptadecatrienoic acid, a ligand 

for BLT2 receptor. 

T. Yokomizo, M. Liu and K. Saeki. Juntendo 

Univ. and Kyushu Univ., Japan.

C285 

813.5 

Protective role of BLT2 receptor in mouse 

acute lung injury. 

M. Shigematsu, T. Koga, K. Saeki and T. 

Yokomizo. Grad. Sch. of Med. Sci., Kyushu Univ. and Juntendo 

Univ. Sch. of Med., Japan.

C286 

813.6 

Label-free spectroscopic imaging of lipids in 

live cells and intact tissues. 

J-X. Cheng. Purdue Univ.

C287 

813.7 

Omega 3 polyunsaturated fatty acids modulate 

cyclooxygenase-2 induction via interactions with GPR120. 

X. 

Li, Y. Yu and C.D. Funk. Queen’s Univ., Canada and Inst. for 

Nutr. Sci. , Shanghai.

MONDAY BIOCHEMISTRY

250

C288 

813.8 

Cysteinyl leukotriene receptor 2-mediated 

vascular permeability and ischemia/reperfusion injury. 

N. Ni, 

L.L. Ballantyne, J.D. Mewburn and C.D. Funk. Queen’s Univ., 

Canada.

C289 

813.9 

Structural basis of FTY720 (Gilenya) 

phosphate selectivity of the sphingosine 1-phosphate receptor 

subtype 1. 

G. Tigyi, W. Valentine, D. Osborne, Y. Fujiwara, J. 

Liu, V. Godwin, A. Parrill, R. Bittman and J. Van Brocklyn. 

Univ. of Tennessee, Memphis, Univ. of Memphis, Queens Col. 

of CUNY and The Ohio State Univ.

C290 

813.10  Cholesterol binding is a determinant of 

canonical Wnt signaling activity of dishevelled. 

R. Sheng. Univ. 

of Illinois at Chicago.

C291 

813.11  Regulation of prostaglandin E2 signaling by 

cysteinyl leukotrienes in human mast cells. 

V. Kondeti, E. 

Duah, A. Emory, C.K. Thodeti and S. Paruchuri. Univ. of 

Akron and Northeast Ohio Med. Univ.

C292 

813.12  Inflammatory role of cysteinyl leukotrienes in 

human vascular endothelial cells. 

E. Duah, V. Kondeti, R.K. 

Adapala, J. Sanford, C.K. Thodeti and S. Paruchuri. Univ. of 

Akron and Northeast Ohio Med. Univ.

C293 

813.13  Temporal and combinatorial control of pro-

resolution eicosanoid formation in TLR4 primed, purinergic 

receptor stimulated macrophages. 

P. Norris and E. Dennis. 

UCSD.

C294 

813.14  Stearoyl-CoA desaturase affects the level of 

global DNA methylation in 3T3-L1 adipocytes. 

A. Dobrzyn, 

M. Malodobra-Mazur, K. Kolczynska, K. Kozinski, A. 

Dziewulska and P. Dobrzyn. Nencki Inst. of Exptl. Biol., 

Warsaw.

C295 

813.15  Myristate-derived d16:0-sphingolipids 

constitute an abundant cardiac sphingolipid pool with distinct 

synthetic routes and functional properties. 

S.B. Russo, R. 

Tidhar, A. Futerman and L.A. Cowart. Med. Univ. of South 

Carolina, Weizmann Inst. of Sci., Rehovot and Ralph H. 

Johnson VA Med. Ctr., Charleston.

C296 

813.16  PMA stimulates PKCalpha-dependent 

phosphorylation of ASAH1 in breast cancer cell lines. 

T. 

Escobar and M. Sewer. UCSD Skaggs Sch. of Pharm. and 

Pharmaceut. Sci.

C297 

813.17  Rescue of sphingosine kinase-1-knockout 

phenotype by 2-acetyl-5-tetrahydroxybutyl imidazole following 

murine cardiac arrest is linked to changes in sphingosine-1-

phosphate and behenoylceramide levels. 

E.V. Berdyshev, 

I.A. Gorshkova, V. Natarajan, H. Wang, D.G. Beiser and T.L. 

Vanden Hoek. Univ. of Illinois at Chicago and Univ. of Chicago.

C298 

813.18  Sphingosine kinase 1 is regulated by PPAR

a in 

response to free fatty acids and mediates skeletal muscle IL-6 

production and signaling in diet-induced obesity. 

J.S. Ross, W. 

Hu, B. Rosen, A.J. Snider, L.M. Obeid and L.A. Cowart. Med. 

Univ. of South Carolina, Boston Univ. Sch. of Med., Ralph H 

Johnson VA Ctr., Charleston, Stony Brook Univ. and Northport 

VA Ctr., NY.

814.  LIPID TRAFFICKING

Poster

m

on

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C299 

814.1 

Arachidonic acid increases permeability of 

HBMEC monolayers via increased production of prostaglandin 

E2. 

G.M. Hatch, S. Dalvi, R. Mitchell, H. Aukema and D. 

Miller. Univ. of Manitoba.

C300 

814.2 

a-TTP-expressing astrocytes regulate 

a-tocopherol homeostasis in the CNS. L.M. Ulatowski, J. 

Atkinson and D. Manor. Case Western Reserve Univ. and 

Brock Univ., Canada.

C301 

814.3 

Determining the mechanism of sphingosine-1-

phosphate transport between membranes. 

M.N. Massa and B. 

Wattenberg. Univ. of Louisville Sch. of Med.

C302 

814.4 

The role of Perilipin 5 in lipid droplet maturation. 

T.C. Saley, C.C. Hardy and J.T. Tansey. Otterbein Univ., OH.

C303 

814.5 

Mechanisms of cholesterol transport by 

Niemann Pick C2 protein and cyclodextrin.