70
qisman parchalanadi. Oqsilni bromsian bilan ta’sir vaqtida, kislotali
sharoitda beqaror
bog’ini qisman gidrolizi sodir bo’ladi.
Triptofan qoldig’ini
gurug’i bo’yicha parchalanishni juda ko’p
usullari taklif etilgan. Bu maqsad uchun ishlatiladigan reagentlardan
biri
bromsuksinimiddir. Reaksiya 2-3 baravar ko’p reagent
ishtirokida
2,0; 20
S, 2 soat davomida amalga oshiriladi.
Peptidlarda parchalanish 50 -90% unum bilan borsa, oqsillarda 10-
60% boradi. 2 - (2 - nitrofenilsulfenil) - 3-metil -3 bromindol
(
skatol) selektivligi yuqori reagentdir. 2 - (2 - nitrofenil)
sulfenil skatolni
bromsuktsinimid bilan ta’siri natijasida olinadi.
skatol ta’sirida peptid zanjir
qoldig’i bo’yicha
parchalanadi. Reaksiya sharoiti quyidagicha: 50 % CH
3
COOH,
,
24 soat, 10- marta ko’p
-skatol, unum 50 - 70%. 1979 yilda
triptofan hosil qilgan peptid bog’larini uzish uchun O - yodbenzoy
kislotani taklif etdi. Bu reagent ham
bog’ni uzib, unumi 70 -
100% dir. Reaksiya 80%
2 marta ko’p reagent,
, 24
soatda boradi. Oqsillar tuzilishini aniqlashda polipeptid zanjirdagi
bog’ni uzishda
dan foydalaniladi. Reaksiya
10,5; 35 -
da borib
bogi 50 - 70% unum bilan
uziladi.
Ba’zi hollarda oqsil molekulalarini parchalash uchun qisman
kislotali gidroliz usuli qo’llaniladi. Kislotalar ta’siriga
eng sezgir
bog’lar bo’lib aspartil peptid boglari hisoblanadi. Kislotali sharoitda
eng barqaror bo’lib
bog’lari hisoblanadi. Peptid
bog’lardagi prolin qoldig’idagi azot atomi boshqa aminokislota
qoldiqlariga nisbatan yuqori asos xossasiga ega bo’lib oson
protonlanadi. Quyidagi sharoitlarda (10%
- piridin,
2,5; 7 M guanidin
,
4 sutka)
bog’i 90% gacha
parchalanadi. Tsistein qoldig’i hosil qilgan peptid bog’lar 2 - nitro -
5-tiotsianat benzoy kislota ishtirokida gidrolizlanadi(
).
tsistein qoldig’ini sianlab, yumshoq sharoitda (
8,0-9,0;
, 12-16 soat) 2- iminotiazolidinkarbon kislotaga aylantiradi. Shu
sharoitlarda
polipeptid zanjirini
ttsistein
qoldiqlari bo’yicha
parchalash 80 - 90% unum bilan sodir bo’ladi. Kimiyoviy usullar
71
ichida
ni bromsian bo’yicha parchalash eng ko’p qo’llaniladi.
va
bo’yicha parchalash ham nisbatan ko’p
qo’llaniladi.
bog’i bo’yicha qisman kislotali gidroliz va
qoldiqlari bo’yicha parchalash nisbatan kam qo’llaniladi.
Oqsillar polipeptid zanjirini fermentativ yoki kimyoviy usullar
bilan parchalaganda hosil bo’lgan peptid
fragmentlarini ajratish
birlamchi tuzilishni aniqlashda eng muhim vazifadir. Peptidlarni
ajratish usullari tanlanayotganda ajraladigan moddalar miqdori va
fizik kimyoviy xossalari hisoblga olinishi zarur. 15-20 aminokislota
qoldig’i tutgan peptidlarni analizida ion-almashinish xromotografiyasi
ko’pincha ishlatiladi. Adsorbent sifatida polistiral va divinibenzolni
sulfirlangan sopolimeri -
dauekc
turidagi kationitlar ishlatiladi.
Peptidlar kolonkadan maxsus tanlab olingan ma’lum bir
gradienti
va piridin-atsetat bufer eritmasi yordamida yuviladi. Peptidlarni
tahlili ningidrin bilan reaksiyasidan so’ng 570 nm da optik yutilishi
o’lchanib o’rganiladi. Ba’zida ningidrin o’rniga
o-ftal angidridi va
ba’zi bir o’ziga xos reaksiyalardan (masalan,Sakaguchi reaksiyasi)
foydalaniladi. Ion-almashinish xromatografiyasi orqali olingan
birlashgan fraksiyalar tsellyulozani yupqa qatlamida va oxirgi
aminokislota qoldiqlarini tekshirib o’rganiladi. Analitik tajribalar
natijalari peptidlarni bo’lish va tozalash uchun kerakli yo’nalishni
tanlashga imkon beradi. Buning uchun odatda qog’oz yoki tsellyuloza
yoki silikagelning yupqa qatlamidagi xromatografiya va elektroforez
qo’llanadi. O’zida 10- 15 peptidlarni tutgan aralashmalar
"peptid
haritalari"
usulida tekshiriladi. Buning uchun gidroliz natijasida hosil
bo’lgan aralashma xromatografik qog’oz yoki yupqa qatlamli
sellyuloza plastinkasiga o’tkazilib qarama - qarshi tomonlarga
elektroforez yoki xromatografiya qilinadi.
Peptid harita tegishli
reaktiv bilan yorqinlashtirilib ajralish usuli samarasi aniqlanadi. 20
dan ortiq aminokislota qoldig’i saqlovchi yirik peptidlarni o’rganish
murakkabdir. Bunda asosiy qiyinchilik shundaki bunday peptidlar
suvli eritmalarda bir-biri bilan birlashib yuqori molekulyar agregatlar
hosil qiladi. Agregatlanishni oldini olish uchun bufer eritmaga
detergentlar (mochevina, guanidin xlorid, natriy dosetilsulfat)
72
qo’shiladi. Odatda gel-filtrlanish usuli qo’llanib, bunda molekulyar
massa bo’yicha bo’lish amalga oshiriladi. Harakatlanmaydigan faza
sifatida yuqori gidrofil dekstranlar (sefadeks) va poliakrialamid gellar
(biogel) qo’llanadi. Ular suvda bo’kib gel hosil qiladilar. Tashuvchi
sifatida
va
ionalmashuvchi sellyulozalar;
hamda
dekstranning ionalmashuvchi dekstranlari:
sefadekslar ishlatiladi. So’ngi yillarda peptidlarni bo’lish uchun
yuqori samarali suyuqlik xromatografiyasi keng qo’llanilmoqda.
Ba’zida ma’lum bir funksional guruh tutgan peptidlarni ajratish zarur
bulib qoladi. Bunda xemoo’ziga xos yoki kovalent xromatografiya
qo’llaniladi. Bu usul peptidni tashuvchi bilan kovalent bog’ hosil
ilishiga asoslanadi. Ko’pincha bu usul ttsistein saqlovchi peptidlarni
ajratish uchun qo’llaniladi. Monoklonal antitelalar texnikasini ishlab
chiqish affin xromatografiyasiga keng imkoniyatlar yaratdi.
Monoklonal antitelalar asosidagi immunosorbentlar bu agentlarni
antigen determinantlarini saqlovchi peptid fragmentlarini ajratish
uchun ishlatiladi. Antigen determinantlar
oqsil globulasi sirtida
bo’lganligi uchun oqsillar topografiyasini o’rganishda bu usul
yuqori natijalar beradi.
Dostları ilə paylaş: