76
reaksiyalarni
barcha
bosqichlarini
borishi
standartlashtirilgan.
Ishlatiladigan reagent va erituvchilarni izchil tozalash natijasida
aminokislota qodiqlarini parchalanishini avtomatik ravishda 95% va
undan yuqorigacha olib borish mumkin. Reagentlarni uchuvchanligini
oldini olish uchun reaksion stakanni katta hajmiga birikish
reaksiyalarida
asos
sifatida
kvadrol(
-tetrakis-2-
gidroksipropil)-etilendiamin;
ajralish
reaksiyalarida
esa
quyi
uchuvchanlikka ega geptaftormoy kislota qo’shiladi. Sekvenatorda
Edman reaksiyasini ikki bosqichi
birikish va ajralish amalga
oshiriladi. Hosil bo’lgan anilinotiazolinonlar ekstraktsiya qilib
olinadilar va fraksiyalar kollektoridan yig’iladi. Ularning
larga
aylanishi qqlda yoki avtomatik ravishda amalga oshiradigan -
konverter
da amalga oshiriladi. Suyuq fazali sekvenator o’z
tarkibida
60-200 aminokislota qoldiqlariga ega oqsil va peptidlarni aniqlashda
yaxshi natijalar ko’rsatadi. Bular uchun odatda 30-50 dan iborat
ketma-ketlik
aniqlanadi.
Yirikroq
oqsillarni
aniqlashda
degradatsiyalanish jarayonida polipeptid zanjirini ichidagi labil peptid
bog’larini sezilarli gidrolizi amalga oshadi. Ikkinchi tomondan, qisqa
peptidlar, ayniqsa o’z tarkibida gidrofob aminokislotalarga ega
peptidlar sekvenator stakanidan intensiv yuviladi.
Peptidlarni bunday
yo’qotishni oldini olish uchun reaksion kameraga peptidni mexanik
yo’qolishiga to’sqinlik qiluvchi maxsus tashuvchilar qo’shiladi.
Tashuvchi sifatida erkin
-aminoguruhga ega emas oqsillar(masalan,
sitoxrom C) yoki sintetik polimerlar poliornitin va polibren ishlatiladi.
Peptidlarni organik erituvchilarda eruvchanligi ularni gidrofilligi
ortgan
sari
keskin
kamayadi.
Gidrofillikni
oshirish
uchun
fenilizotiotsianatlarni analoglari hisoblangan Braunitser reagentlaridan
foydalaniladi. Edman bo’yicha degradatsiyalanishdan
birinchi
bosqichda
o’rniga Brauniser reagenti qo’shilsa,
-
aminoguruhlarini
modifitsirlanishi
hisobiga
lizinli
peptidlarni
gidrofilligi keskin ortadi, bu esa ularni sekvenatorda aniqlashga
imkon beradi.
Dostları ilə paylaş: