Ahmadov abdurahmonning



Yüklə 1,28 Mb.
səhifə10/14
tarix02.06.2023
ölçüsü1,28 Mb.
#124042
1   ...   6   7   8   9   10   11   12   13   14
Eukariot va prokariot genomlarining bir-biridan farqi (1)

6-rasm. Odam genomi
Gaploidli genom inson genomining (23 xxromosom) uzunligi qariyb 3 milliard juft asosdan iborat bo'lib, 25 mingga yaqin genlarni o'z ichiga oladi. Har bir asos juftlikni 2 bit yordamida kodlash mumkin bo'lganligi sababli, bu taxminan 750 megabayt ma'lumotni tashkil qiladi. Alohida somatik ( diploid ) hujayra bu miqdordan ikki baravar ko'proq, ya'ni 6 milliardga yaqin asos juftligini o'z ichiga oladi. Erkaklarda ayollarga qaraganda kamroq, chunki Y - xromosoma taxminan 57 million asos juftlikni, X esa 156 millionni tashkil etadi, ammo ma'lumot jihatidan erkaklarda ko'proq, chunki ikkinchi X tarkibida deyarli bir xil ma'lumotlar mavjud.
Inson genomining tarkibi odatda kodlovchi va kodlanmaydigan DNK ketma-ketligiga bo'linadi. DNK kodlovchilar mRNKga yozilishi va inson hayoti davomida oqsillarga translaytsiya qilinishi mumkin bo'lgan ketma-ketliklar deb ta'riflanadi; bu ketma-ketliklar genomning ozgina qismini egallaydi (<2%). Kodlanmagan DNK oqsillarni kodlash uchun ishlatilmaydigan ushbu ketma-ketliklarning barchasidan (genomning 98% ni) tashkil qiladi. Ba'zi kodlanmaydigan DNK muhim biologik funksiyalari bilan farqalanadi. Kodlanmagan DNK kodlanuvchi DNKdan ancha ustun bo'lganligi sababli, genom tushunchasi DNK kodlash genining klassik tushunchasiga qaraganda ko'proq yo'naltirilgan analitik tushunchaga aylandi. 
Kodlash ketma-ketligi (oqsillarni kodlaydigan genlar).Oqsillarni kodlash ketma-ketligi inson genomining eng ko'p o'rganilgan va yaxshiroq tushunilgan qismidir. To'liq modulli oqsil kodlovchi genom sig'imi ExoME- da mavjud va oqsillarga aylantirilishi mumkin bo'lgan ekzonlar tomonidan kodlangan DNK ketma-ketligidan iborat. Uning biologik ahamiyati, shuningdek u genomning 2% dan kamrog'ini tashkil etganligi sababli ExoME tartiblashi inson genomi loyihasining birinchi muhim bosqichi bo'ldi.
Inson genomidagi oqsilni kodlaydigan genlar. Oqsilni kodlaydigan genlar soni. UniProt kabi ma'lumotlar bazalarida 20000 ga yaqin odam oqsillari izohlangan. Xromosoma tarkibidagi oqsillarni kodlash qobiliyati. Oqsil kodlovchi genlar xromosoma bo'ylab notekis taqsimlangan. Oqsillarni kodlaydigan genlarning hajmi. Oqsillarni kodlovchi genlarning hajmi inson genomida juda katta o'zgaruvchanlikni ko'rsatmoqda. Protein kodlovchi genning o'rtacha miqdori 26288 bp ni tashkil qiladi (o'rtacha = 66577 bp). Masalan, H1a gistoni (HIST1HIA) nisbatan kichik va sodda bo'lib, 781 nt va 215 aminokislotali oqsil (648 nt ochiq o'qish doirasi) ketma-ketligini kodlaydigan intron va mRNKga ega emas . Distrofin (DMD) - bu insonga tegishli genomdagi oqsil kodlovchi eng katta gen bo'lib, u 2,2 MB ni tashkil qiladi, Titin ( TTH ) esa eng uzun kodlash ketma- (114414 bp), eng ko'p ekzon (363) va uzun yakka ekzon (17106 bp) ketma-ketligiga ega.(jadval) Butun genom uchun o'rtacha ekzon hajmi 122 bp ni tashkil qiladi. (o'rtacha = 145 bp), ekzonlarning o'rtacha soni 7 (o'rtacha = 8,8) va o’rtacha kodlash ketma-ketligi 367 aminokislotalarni kodlaydi (o'rtacha = 447 aminokislotalar).

Oqsil

Xromosoma

Gen

Uzunligi

Ekzonlar

Ekzon uzunligi

Intiron uzunligi

Alt-qism

Ko'krak bezi saratonining 2-turi oqsillarga sezgirlik

13

BRCA2

83736

27

11386-yil

72350

Ha

Kistik fibroz transmembranani o'tkazuvchanligi regulyatori

7

CFTR

202881

27

4440

198441

Ha

Sitoxrom

Montana

MTYCB

1140-yil

1

1140-yil

0

Yo`q

Distrofin

X

DMD

2220381

79

10500

2209881

Ha

Gliseraldegid-3-fosfat degidrogenaza

12

GAPDH

4444

9

1425-yil

3019-Yil

Ha

Gemoglobin beta bo'linmasi

11

GBD

1605-yil

3

626-yil

979-yil

Yo`q

giston H1A

6

HIST1H1A

+781

1

+781

0

Yo`q

Titin

2

TTN

281434

364

104301

177133

Ha

Odam oqsillarini kodlovchi genlariga misollar. Xromosoma. Alt splaysing, alternativ mRNA splaysing. (Ma'lumot manbasi: Genom brauzerining Ensembl nashri, 2012-yil,68-son)


Yaqinda inson genomidan yangilangan ma'lumotlarning tizimli meta-tahlili, inson genomidagi RBFOX1 (RNK - majburiy protein, tulki - 1 gomolog 1) umumiy 2.47 MBni o'z ichiga olgan proteinli kodlovchi eng katta genlarni aniqladi. Butun genom uchun, hozirgi vaqtda o'rtacha ekzon hajmi 133 asos juftlikda (o'rtacha = 309 zarba) baholanmoqda, hozirgi vaqtda ekzononlarning o'rtacha soni 8 (o'rtacha = 11), 425 aminokislotalarni kodlash uchun o’rtacha kodlash ketma-ketligi baholanmoqda (o'rtacha = 553 aminokislotalar).



Yüklə 1,28 Mb.

Dostları ilə paylaş:
1   ...   6   7   8   9   10   11   12   13   14




Verilənlər bazası müəlliflik hüququ ilə müdafiə olunur ©azkurs.org 2024
rəhbərliyinə müraciət

gir | qeydiyyatdan keç
    Ana səhifə


yükləyin