Bioinformatika fanining rivojlanish tarixi

Genom evolyusiyasi.
Genom evolyutsiyasi - bu vaqt o'tishi bilan genomning tuzilishi (ketma-ketligi) yoki hajmi o'zgarishi jarayoni . Genom evolyutsiyasini o'rganish genomning tarkibiy tahlili, genomik parazitlarni o'rganish, gen va qadimgi genomlarning ko'payishi, poliploidiya va qiyosiy genomika kabi ko'plab sohalarni o'z ichiga oladi . Genom evolyutsiyasi ilmiy hamjamiyat va umuman jamoatchilik uchun mavjud bo'lgan prokaryotik va eukaryotik genomlarning ketma-ket o'sib borayotgan soni tufayli doimiy o'zgaruvchan va rivojlanayotgan sohadir.Birinchi ketma-ket genomlar 1970-yillarning oxirida paydo bo'lganidan beri [1] olimlar turli genomlar orasidagi farq va o'xshashliklarni o'rganish uchun qiyosiy genomikadan foydalanmoqda. Genom ketma-ketligi vaqt o'tishi bilan rivojlanib, tobora murakkab genomlarni, shu jumladan 2001 yilda butun inson genomining yakuniy ketma-ketligini o'z ichiga oldi . [2] Ham yaqin qarindoshlar, ham uzoq ajdodlar genomlarini solishtirish orqali turlar o'rtasidagi keskin farqlar va o'xshashliklar ham paydo bo'la boshladi. genomlarning vaqt o'tishi bilan rivojlanishi mumkin bo'lgan mexanizmlar sifatida
Gomologik ketma-ketliklar.
Ketma-ketlik homologiyasi hayotning evolyutsion tarixida umumiy ajdodlar nuqtai nazaridan aniqlangan DNK , RNK yoki oqsil ketma-ketliklari orasidagi biologik homologiyadir . DNKning ikkita segmenti uchta hodisa tufayli umumiy ajdodlarga ega bo'lishi mumkin: yoki turlanish hodisasi (ortologlar) yoki ko'payish hodisasi (paraloglar) yoki gorizontal (yoki lateral) gen ko'chirish hodisasi (ksenologlar).DNK, RNK yoki oqsillar o'rtasidagi homologiya odatda ularning nukleotidlari yoki aminokislotalar ketma-ketligi o'xshashligidan kelib chiqadi . Muhim o'xshashlik ikkita ketma-ketlikning umumiy ajdodlar ketma-ketligidan evolyutsion o'zgarishlar bilan bog'liqligini tasdiqlovchi kuchli dalildir. Har bir ketma-ketlikning qaysi hududlari gomologik ekanligini ko'rsatish uchun bir nechta ketma-ketliklarni tekislash qo'llaniladi.
Ekzon va intronlar.
Eukariot genlarning ko'pchiligida o'zlarining oqsillarni kodlash qismida kodlamaydigan qo'shimchalar - intronlar mavjud. Eksonlar - bu intronlar bilan ajratilgan genning kodlash qismining qismlari. Transkripsiya paytida hamma narsa "o'qiladi": ham ekzonlar, ham intronlar. Bu "etuk bo'lmagan xabarchi RNK" bo'lib chiqadi. So'ngra, qo'shilish jarayonida etuk bo'lmagan xabarchi RNKdan intronlar kesilib, oqsil sintez qilinishi mumkin bo'lgan "etuk xabarchi RNK" olinadi. Ba'zida intronlar bilan birga ba'zi holatlarda har xil bo'lgan ba'zi ekzonlar o'chiriladi. Shu sababli, bitta gen asosida bir necha xil etuk mRNKlar (har xil ekzonlar to'plamlari bilan) sintez qilinishi mumkin va shunga ko'ra bir nechta turli oqsillar sintez qilinadi. Ushbu hodisa "muqobil biriktirish" deb nomlanadi.