II INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS
34
Qafqaz University
18-19 April 2014, Baku, Azerbaijan
Cədvəl 2. Lys-Glu dipeptidinin stabil konformasiyaların qaliqdaxili və qalıqlararası qarşılıqlı təsirlərin enerji
payları
Konformasiya Lys
Glu Amin
turşu
qalığı
R
12222
R
121
R
22222
R
221
R
22222
R
321
4.4
4.2
4.1
-11.4
-14.2
-13.8
Lys
3.3
3
2.8
Glu
Cədvəl 2-də Lys-Glu dipeptidinin stabil konformasiyaların qalıqdaxili və qalıqlararası qarşılıqlı təsirlərin enerji payları
göstərilib. Bu cədvəldən görünür ki, ən stabil bükülü RR formalı konformasiyalarda birinci və ikinci qalıqlar arasında çox
güclü elektrostatik qarşılıqlı təsirlər əmələ gəlir. Misal üçün R
22222
R
221
konformasiyada bu qarşılıqlı təsir -14,2 kkal/mol
təşkil edir.Hesablama nəticəsində alınan optimal konformasiyaların ikiüzlü fırlanma bucaqları müəyyən edilmişdir.
Cədvəl 3. Glu-Lys molekulunun optimal konformasiyaların qarşılıqlı təsirlərin enerji payları.
N
Konformasiya
Şeyp
Qarşılıqlı təsirin enerji payları (kkal/mol)
E
q.v
E
el
E
tor
E
ümumi
E
nisbi
1 R
22222
R
121
f -8.37 1.45 1.03 -5.89 0
2 R
22222
R
321
f
-9.16
2.33
1
-5.83
0.06
3 B
12222
L
321
f -7.78 2.29 1.82 -3.66 2.23
4 B
22222
L
321
f -7.72 3.28 0.95 -3.49 2.4
Cədvəl 3-dən göründüyü kimi, dipeptid molekulunun ən aşağı enerjili konformasiyaları f şeypinə mənsub olan RR
formasına aiddir.
Aparılan tədqiqat onu göstərdi ki, Lys-Glu dipeptid molekulu 0-5 kkal/mol nisbi enerji intervalında məhdud sayda
konformasiya vəziyyətləri yaradır. Bu molekul bükülü formalara meyl edir və onun enerji cəhətdən ən əlverişli
konformasiyası kvaziqapalı qululuş əmələ gətirir. Alınan nəticələr gələcəkdə yeni, daha selektiv dərman əhəmiyyətli
preparatlarının yaranmasında və tədqiqində istifadə oluna bilər.
Dostları ilə paylaş: |