Microsoft Word Materiallar Full

Cədvəl 1. Lys-Glu dipeptid molekulunun optimal konformasiyalarının 0-5 kkal./mol  

nisbi enerji intervalında paylanması 

Şeyp 

Əsas 

zəncirin 

forması 

                       Nisbi enerji intervalı 

  0-1 

  1-2 

  2-3 

  3-4 

   4-5 

  5> 

                  

e 

   RL 

    - 

    - 

    - 

    - 

    - 

    9 

   BR 

    - 

    - 

    - 

    - 

    3 

    6 

   LR 

    - 

    - 

    - 

    1 

    2 

    6 

                  

f 

   RR 

    2 

    - 

    - 

    2 

    2 

    3 

   BL 

    - 

    - 

    2 

   - 

    - 

    7 

 

Peptidin  ilkin variantlarında əsas zəncirin hər bir forması 

R(

φ=-180-0, Ψ=-180-0), B(φ=-180-0 ,Ψ=0-180), L(φ , Ψ=0-

180) üçün qalıqların yan zəncirlərinin müxtəlif orientasiyaları  nəzərdə tutulmuşdur [4.5]. Hər bir peptidin fəza quruluşu 

onun konformasiya vəziyyəti ilə, əsas zəncirin forması, şeyplərlə xarakterizə olunduğundan bunu cədvəld 1-də daha dəqiq 

görə bilərik. Bu cədvəldə Lys-Glu dipeptid molekulunun optimal konformasiyalarının 0-5 kkal./mol nisbi enerji intervalında 

paylanması göstərilmişdir. Cədvəldən görünür ki, molekulun şeypləri və  əsas zəncirin formaları arasında differensasiya 

müşahidə olunur.Tam bükülü f şeypinə aid olan konformasiyalar Lys-Glu dipeptidi üçün enerji cəhətdən daha 

əlverişlidir.Onu da qeyd etmək lazımdır ki, Lys-Glu dipeptid molekulu stabil konformasiyalarında bir sıra  hidrogen 

rabitələri əmələ gəlir. Nəticədə hesablanmış optimal fəza quruluşları arasında çox kəskin enerji fərqi müşahidə olunmuşdur. 

Dipeptid molekulun ən stabil R

22222

R

121

 konformasiyasında Lys-nin NH

2

 və  Glu-nin  COO

-

  yan zəncirlərinin qruplarındakı 

atomlar arasında spesifik hidrogen rabitəsi  əmələ  gəlir. Bu hidrogen rabitəsi R

22222

R

121 

konformasiyada kvaziqapalı 

vəziyyətinə səbəb olur. Bu hesablamada hidrogen rabitəsinin uzunluğu 2.7  , hidrogen rabitəsinin enerjisi -0.14 kkal/mol 

çərçivəsində olmuşdur. 

---