Cədvəl 1. Pro1-Met2-Ser3-Met4-Leu5-Arg6-Leu7-NH
2
miomodulin A molekulunun və onun [MeSer3],. [MeMet4],
[MeArg6].analoqlarının konformasiyalarının nisbi enerjiləri
№
K o n f o r m a s i y a
Miomodulin
A molekulu
[MeSer3]
analoqu
[MeMet4]
analoqu
[MeArg6]
analoqu
1 BB
1222
B
11
B
2122
R
2122
B
3322
R
2122
6.6 4.8 1.0
11.6
2 BR
2122
R
12
B
2322
B
2122
B
3322
B
3222
6.9 15.7
15.4 2.6
3 RR
2122
R
12
B
2122
B
2122
R
3122
R
2122
4.9 12.9
16.1 2.9
4 RR
2122
R
12
B
2122
R
2122
B
3322
R
2122
3.4 15.7
13.3 5.6
5 RR
2122
R
12
R
2222
B
2122
B
3322
B
3222
0.2 12.1
17.8 0
6 RR
2122
R
12
R
3222
R
2122
B
3322
R
2122
0 9.8
38.9
4.3
7 RR
2122
R
12
R
2222
B
2122
R
3122
R
2122
0.6 13.3
26.1 7.9
8 BR
3322
R
12
B
2222
R
2122
R
3122
R
2322
10.7 7.5 15.4
24.8
9 RB
1222
B
12
R
3222
R
2122
B
3322
R
2122
4.6 0
29.7
8.1
10 RR
3322
B
12
B
2122
R
2122
B
3322
R
2122
7.9 10.5 0 12.2
11 RB
1222
R
12
B
2122
R
2122
B
3322
R
2122
6.9 10.9 9.8 10.5
[MeMet4].analoqu üçün təbii molekulun on bir stabil konformasiyasından yalnız ikisi aşağıenerjili olmuşdur.
Analoqun ən stabil konformasiyası RR
3322
B
12
B
2122
R
2122
B
3322
R
2122
-dir. Təbii molekulda bu konformasiyanın nisbi enerjisi 7.9
kkal/mol-dur. Analoqun digər stabil konformasiyası BB
1222
B
11
B
2122
R
2122
B
3322
R
2122
-dir, onun nisbi enerjisi 1.0 kkal/mol-dur,
təbii molekulda isə 6.6 kkal/mol olmuşdur. Miomodulin A molekulunun [MeMet4] analoqunun fəza quruluşunun
öyrənilməsi göstərir ki, bu analoq da təbii molekulun yalnız müəyyən funksiyasıını yerinə yetirə bilər.
[MeArg6] analoqunun fəza quruluşunun öyrənilməsi göstərdi ki, bu analoq üçün təbii molekulun on bir stabil
konformasiyasından yeddisi aşağıenerjili olmuşdur. Analoqun ən stabil konformasiyası RR
2122
R
12
R
2222
B
2122
B
3322
B
3222
-dir,
təbii molekulda bu konformasiyanın nisbi enerjisi 0.2 kkal/mol-dur. Bu analoqun dörd konformasiyasının nisbi enerjisi 5.0
kkal/mol-dan az olmuşdur. Hesablamaların nəticəsinə əsasən demək olar ki, bu analoq təbii molekulun bir neçə funksiyasını
yerinə yetirə bilər.
Ümumiyyətlə, qeyd etmək lazımdır ki, tədqiq olunan hər üç analoqun stabil konformasiyaları təbii miomodulin A
molekulunun stabil konformasiyaları yığımını verə bilir və sintez üçün təklif oluna bilər.
ƏDƏBIYYAT
1. V.Brezina, B.Bank, E.C.Cropper, S.Rosen, F.C.Vilim ,L.Kupferman ,K.R.Weiss. Nine members of the myomodulin family of
peptide cotransmutters of the B-16 akcneumuscular junction of Aplysia. Journal of Neurophysiolofy, V.74, p.54-72, 1995.
2. A.Jan. Veenstra.Neurohormones and neuropeptides encoded by the genome of Lottia gigantea,with reference to other mollusks
and insects.General and Comparative Endocrinology, V.167, p.86-103, 2010.
3. Н.А.Ахмедов, Р.М.Аббаслы, Л.Н.Агаева, Э.М.Гасанов Пространственная структура молекулы миомодулина А.
Сборник трудов III Всероссийской научно-практической конференции «Биотехнология и биомедицинская инженерия»
Курск-2010, стр.31-33.
|